Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,061,041 | T→G | 5.1% | R64R (CGT→CGG) | scpA → | methylmalonyl‑CoA mutase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,061,041 | 0 | T | G | 5.1% | 287.2 / 6.9 | 79 | R64R (CGT→CGG) | scpA | methylmalonyl‑CoA mutase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (36/39); new base G (2/2); total (38/41) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.52e-01 |
GAGCCGTCGGGAGAAAACTGTCGACTCGCTGGTTCATCAAACCGCGGAAGGGATCGCCATCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACAGCAAAAGAGTCCAACGCTTTTTATCGCCGTAACCTGGCCGCCGGGCAAAAAGGTCTTTCCGTTGCGTTTGACCTTGCCACCCACCGTG > NC_000913/3060894‑3061186 | gAGCCGTCGGGAGAAAACTGTCGACTCGCTGGTTCATCAAACCGCGGAAGGGATCGCCATCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGt < 2:90319/148‑1 (MQ=255) aGCCGTCGGGAGAAAACTGTCGACTCGCTGGTTCATCAAACCGCGGAAGGGATCGCCATCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTg < 4:650602/148‑1 (MQ=255) cGGGAGAAAACTGTCGACTCGCTGGTTCATCAAACCGCGGAAGGGATCGCCATCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTa < 2:629941/148‑1 (MQ=255) gagaAAACTGTCGACTCGCTGGTTCATCAAACCGCGGAAGGGATCGCCATCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGt > 3:205153/1‑148 (MQ=255) tCGACTCGCTGGTTCATCAAACCGCGGAAGGTATCGCCATCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCa > 4:727240/1‑148 (MQ=255) cTCGCTGGTTCATCAAACCGCGGAAGGGATCGCCATCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGt < 2:664262/134‑1 (MQ=255) cTCGCTGGTTCATCAAACCGCGGAAGGGATCGCCATCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGt > 1:664262/1‑134 (MQ=255) cGCTGGTTCATCAAACCGCGGAAGGGATCGCCATCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATg > 2:466396/1‑131 (MQ=255) cGCTGGTTCATCAAACCGCGGAAGGGATCGCCATCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATg < 1:466396/131‑1 (MQ=255) gCTGGTTCATCAAACCGCGGAAGGGATCGCCATCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCCTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTgg < 3:727240/148‑1 (MQ=255) tcaAACCGCGGAAGGGATCGCCATCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTa < 4:1026962/119‑1 (MQ=255) tcaAACCGCGGAAGGGATCGCCATCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTa > 3:1026962/1‑119 (MQ=255) tcaAACCGCGGAAGGGATCGCCATCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGt > 2:145323/1‑148 (MQ=255) tcaAACCGCGGAAGGGATCGCCATCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACAATCCGt > 3:746230/1‑148 (MQ=255) ccGCGGAAGGGATCGCCATCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTa > 4:631889/1‑148 (MQ=255) gAAGGGATCGCCATCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGt < 4:859143/112‑1 (MQ=255) gAAGGGATCGCCATCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGt > 3:859143/1‑112 (MQ=255) aaGGGATCGCCATCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATAcc > 1:1045432/1‑116 (MQ=255) aaGGGATCGCCATCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATAcc < 2:1045432/116‑1 (MQ=255) aaGGGATCGCCATCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTc > 1:428208/1‑138 (MQ=255) aaGGGATCGCCATCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTc < 2:428208/138‑1 (MQ=255) aGGGATCGCCATCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGt > 4:426312/1‑148 (MQ=255) gATCGCCATCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGtat < 3:389408/109‑1 (MQ=255) gATCGCCATCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGtat > 4:389408/1‑109 (MQ=255) gATCGCCATCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGt > 3:74633/1‑122 (MQ=255) gATCGCCATCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGt < 4:74633/122‑1 (MQ=255) gATCGCCATCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGtttt < 3:631889/148‑1 (MQ=255) aTCGCCATCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGttttt < 4:205153/148‑1 (MQ=255) tCGCCATCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGt > 4:1023134/1‑143 (MQ=255) tCGCCATCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGt < 3:1023134/143‑1 (MQ=255) cATCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACa > 1:1126708/1‑148 (MQ=255) aTCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACAg > 2:860503/1‑148 (MQ=255) tCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGt > 1:12510/1‑99 (MQ=255) tCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGt < 2:12510/99‑1 (MQ=255) tCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACAGc > 2:1000610/1‑148 (MQ=255) aaGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACAGCaa < 1:145323/148‑1 (MQ=255) aGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCg < 3:865566/102‑1 (MQ=255) aGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCg > 4:865566/1‑102 (MQ=255) aGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACAGCaaa < 2:1126708/148‑1 (MQ=255) gCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACAGCaaaa < 1:1067238/148‑1 (MQ=255) gCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTTGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACAGCAAAagag < 4:746230/148‑1 (MQ=255) gCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACAGCAAAagag < 1:1000610/148‑1 (MQ=255) cTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTAt > 1:1072094/1‑89 (MQ=255) cTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTAt < 2:1072094/89‑1 (MQ=255) cTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACAGCAAAAGAGt < 1:860503/148‑1 (MQ=255) ccGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTc < 2:444652/111‑1 (MQ=255) ccGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTc > 1:444652/1‑111 (MQ=255) tctcGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGtttt < 3:348078/115‑1 (MQ=255) tctcGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGtttt > 4:348078/1‑115 (MQ=255) tctcGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACAGCAAAAGAGTCCAACGCTTTTTATCGc > 4:858960/1‑148 (MQ=255) cGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACAGCAAAAGAGt < 2:301494/128‑1 (MQ=255) cGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACAGCAAAAGAGt > 1:301494/1‑128 (MQ=255) aTAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGt < 3:588180/59‑1 (MQ=255) aTAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGt > 4:588180/1‑59 (MQ=255) aaTCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACAGCAAAAGAGTCCAACGCTTTTTATCGCCGTAAcc < 3:858960/148‑1 (MQ=255) cAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAAc > 4:1018341/1‑100 (MQ=255) cAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAAc < 3:1018341/100‑1 (MQ=255) tACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGtttt < 3:372089/91‑1 (MQ=255) tACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGtttt > 4:372089/1‑91 (MQ=255) tACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACAGCAAAAGAGTc > 2:1010791/1‑108 (MQ=255) tACCCTTCCTGGTATGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCAAACCGTGAACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACAGCAAAAGAGTc < 1:1010791/108‑1 (MQ=255) ccTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACAGCAAAAGAGt < 1:692802/104‑1 (MQ=255) ccTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACAGCAAAAGAGt > 2:692802/1‑104 (MQ=255) tCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGTACCATCCGTCAGTATGCTGGTATTTCAACAGCAAAAGAATCCAACGCTTTTTATCGCCGTAACCTGGCCGCCGGGCAAAAAGGTCtt > 4:325613/1‑148 (MQ=255) tCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACAGCAAAAGAGTCCAACGCTTTTTATCGCCGTAACCTGGCCGCCGGGCAAAAAGGTc < 4:1049671/146‑1 (MQ=255) tCCTGGTCTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACAGCAAAAGAGTCCAACGCTTTTTATCGCCGTAACCTGGCCGCCGGGCAAAAAGGTc > 3:1049671/1‑146 (MQ=255) ggTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACAGCaa < 3:842344/91‑1 (MQ=255) ggTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACAGCaa > 4:842344/1‑91 (MQ=255) ggTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACAGCAAAAGAGt > 4:183436/1‑97 (MQ=255) ggTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACAGCAAAAGAGt < 3:183436/97‑1 (MQ=255) ggTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACAGCAAAAGAGTCCAACGCTTTTTAt < 4:279172/111‑1 (MQ=255) ggTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACAGCAAAAGAGTCCAACGCTTTTTAt > 3:279172/1‑111 (MQ=255) tttGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACAGCAAAAGAGTCCAACGCTTTTTATCGCCGTAAcc < 3:309974/119‑1 (MQ=255) tttGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACAGCAAAAGAGTCCAACGCTTTTTATCGCCGTAAcc > 4:309974/1‑119 (MQ=255) ttGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACAGCAAAAGAGTCCAACGCTTTTTATCGc > 4:411904/1‑111 (MQ=255) ttGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACAGCAAAAGAGTCCAACGCTTTTTATCGc < 3:411904/111‑1 (MQ=255) gccgccCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACAGCAAAAGAGTCCAACGCTTTTTATCGCCGTAACCTGGCCGCCGGGCAAAAAGGTCTTTCCGTTGCg < 3:325613/148‑1 (MQ=255) agTGGCACGCGGGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACAGCAAAAGAGt < 2:804595/78‑1 (MQ=255) agTGGCACGCGGGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACAGCAAAAGAGt > 1:804595/2‑79 (MQ=255) agTGGCACGCGGGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACAGCAAAAGAGTCCAACGCTTTTTATCGCCGTAACCTGgccgcc > 2:165215/2‑111 (MQ=255) agTGGCACGCGGGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACAGCAAAAGAGTCCAACGCTTTTTATCGCCGTAACCTGgccgcc < 1:165215/110‑1 (MQ=255) cgTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACAGCAAAAGAGTCCAACGCTTTTTATCGCCGTAACCTGGCCGCCGGGCAAAAAGGTCTTTCCGTTGCGTTTGACCTTGCCACCCACCGTg < 3:426312/148‑1 (MQ=255) | GAGCCGTCGGGAGAAAACTGTCGACTCGCTGGTTCATCAAACCGCGGAAGGGATCGCCATCAAGCCGCTGTATACCGAAGCCGATCTCGATAATCTGGAGGTGACAGGTACCCTTCCTGGTTTGCCGCCCTACGTTCGTGGCCCGCGTGCCACTATGTATACCGCCCAACCGTGGACCATCCGTCAGTATGCTGGTTTTTCAACAGCAAAAGAGTCCAACGCTTTTTATCGCCGTAACCTGGCCGCCGGGCAAAAAGGTCTTTCCGTTGCGTTTGACCTTGCCACCCACCGTG > NC_000913/3060894‑3061186 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |