| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,423,621 | C→G | 8.4% | noncoding (35/76 nt) | thrV ← | tRNA‑Thr |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,423,621 | 0 | C | G | 8.4% | 500.1 / 28.5 | 143 | noncoding (35/76 nt) | thrV | tRNA‑Thr |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (67/64); new base G (7/5); total (74/69) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.66e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.21e-01 | |||||||||||
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
TTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGA > NC_000913/3423485‑3423763 | ttCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTgcgc > 2:38875/1‑148 (MQ=255) tCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAggg < 1:49557/137‑1 (MQ=255) tCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAggg > 2:49557/1‑137 (MQ=255) tCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTAcc > 1:1067552/1‑148 (MQ=255) tCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTAc < 3:624198/147‑1 (MQ=255) tCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTAc > 4:624198/1‑147 (MQ=255) tGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTgc < 3:182937/138‑1 (MQ=255) tCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAg > 3:532479/1‑148 (MQ=255) ggggTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATc < 1:38875/148‑1 (MQ=255) ggTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGctc < 2:93661/123‑1 (MQ=255) ggTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGctc > 1:93661/1‑123 (MQ=255) tGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTg > 4:583191/1‑130 (MQ=255) tGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTg < 3:583191/130‑1 (MQ=255) ggACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACCAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCCCCCTTGGTAAGGGTg < 2:658463/114‑1 (MQ=255) ggACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTGGTAAGGGTg > 1:658463/1‑114 (MQ=255) gACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAAt < 4:352975/148‑1 (MQ=255) accaccGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAg < 3:316339/108‑1 (MQ=255) accaccGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAAtt > 1:929084/1‑148 (MQ=255) ccaccGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCatat < 2:1038937/133‑1 (MQ=255) ccaccGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCatat > 1:1038937/1‑133 (MQ=255) cTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTg < 3:756274/148‑1 (MQ=255) ccAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTGGTAAGGGTga > 4:318362/1‑94 (MQ=255) aaTTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTGGTAAGGGTg < 2:1010688/87‑1 (MQ=255) aaTTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTGGTAAGGGTg > 1:1010688/1‑87 (MQ=255) aTTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGa < 3:618162/125‑1 (MQ=255) aTTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGa > 4:618162/1‑125 (MQ=255) tCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTg > 4:412437/1‑122 (MQ=255) tttCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTGGTAAGGGTgag > 2:496717/1‑81 (MQ=255) cTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGcc > 4:20980/1‑96 (MQ=255) aaTCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGct < 3:56427/80‑1 (MQ=255) aaTCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGct > 4:56427/1‑80 (MQ=255) cGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCata > 4:908616/1‑90 (MQ=255) cGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCata < 3:908616/90‑1 (MQ=255) cGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTaaa > 3:850069/1‑103 (MQ=255) cGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAg < 1:140422/118‑1 (MQ=255) cGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCt > 4:862378/1‑124 (MQ=255) ttAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTGGTAAGGGt < 3:924514/62‑1 (MQ=255) ttAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAcccc < 3:1058205/139‑1 (MQ=255) ttAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAcccc > 4:1058205/1‑139 (MQ=255) tAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGCGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAcc > 4:1073196/1‑131 (MQ=255) tAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTa > 1:389784/1‑64 (MQ=255) tAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTa < 2:389784/64‑1 (MQ=255) tAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTcc < 4:846420/110‑1 (MQ=255) tAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTcc > 3:846420/1‑110 (MQ=255) tAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTActct > 3:596278/1‑117 (MQ=255) tAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGgaga < 1:491244/129‑1 (MQ=255) tAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAcc < 3:1073196/131‑1 (MQ=255) aaaaaGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAggg < 4:52082/54‑1 (MQ=255) aaaaaGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAggg > 3:52082/1‑54 (MQ=255) aaaaaGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTg < 4:529765/70‑1 (MQ=255) aaaaaGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGc > 2:412892/1‑73 (MQ=255) aaaaaGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGc < 2:889084/119‑1 (MQ=255) aaaaaGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGc > 1:889084/1‑119 (MQ=255) aaaaaGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACt < 1:1129041/137‑1 (MQ=255) aaaaaGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACt > 2:1129041/1‑137 (MQ=255) aaaaaGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGgcgc > 2:209100/1‑148 (MQ=255) aaaGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAcccc > 1:35304/1‑130 (MQ=255) aaGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCt < 2:231378/108‑1 (MQ=255) tgCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCaa > 3:499092/1‑58 (MQ=255) tgCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCaa < 4:499092/58‑1 (MQ=255) gATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGc > 1:853856/1‑85 (MQ=255) gATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGc < 2:853856/85‑1 (MQ=255) gATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCg < 4:405414/142‑1 (MQ=255) gATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCg > 3:405414/1‑142 (MQ=255) aTACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAcc > 3:455249/1‑116 (MQ=255) aTACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAcc < 4:455249/116‑1 (MQ=255) cccAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCt > 2:1120355/1‑148 (MQ=255) ccAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTc > 2:926115/1‑146 (MQ=255) cAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTaa < 2:349055/70‑1 (MQ=255) cAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAcccc > 4:1131807/1‑113 (MQ=255) cAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCcaca < 4:745206/116‑1 (MQ=255) cAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCcaca > 3:745206/1‑116 (MQ=255) agagTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGt < 3:30349/136‑1 (MQ=255) agagTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGt > 4:30349/1‑136 (MQ=255) gagTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCa > 3:140165/1‑139 (MQ=255) gagTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCa < 4:140165/139‑1 (MQ=255) aaCTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGt < 1:858748/142‑1 (MQ=255) ggggACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTccc > 2:305085/1‑79 (MQ=255) ggggACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTccc < 1:305085/79‑1 (MQ=255) gggACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATgggg > 3:553587/1‑148 (MQ=255) ggACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCg > 3:1101791/1‑122 (MQ=255) aCCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCcac < 1:258402/99‑1 (MQ=255) aCCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTc > 1:720471/1‑129 (MQ=255) aCCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTc < 2:720471/129‑1 (MQ=255) tCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCa < 4:727501/103‑1 (MQ=255) tCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCa > 3:727501/1‑103 (MQ=255) cACCCTTGGTAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTccc > 2:627424/1‑71 (MQ=25) cACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAcc > 3:377857/1‑91 (MQ=255) cACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAcc < 4:377857/91‑1 (MQ=255) cACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAg < 2:812190/145‑1 (MQ=255) cACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTg < 4:553587/148‑1 (MQ=255) cccTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCgg < 3:37871/104‑1 (MQ=255) cccTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTggg < 4:1024140/148‑1 (MQ=255) ccTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGCGCCATATCAGCCCGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGa > 4:585000/1‑148 (MQ=255) ccTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGa > 2:1075702/1‑148 (MQ=255) cTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTg > 3:448989/1‑51 (MQ=255) cTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCcaca < 4:773184/92‑1 (MQ=255) cTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTg < 2:93662/123‑1 (MQ=255) cTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGtt < 4:611280/127‑1 (MQ=255) tACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGAcc > 4:465898/1‑85 (MQ=255) | TTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCTACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCTCGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGA > NC_000913/3423485‑3423763 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |