New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | = 4423781 | 130 (0.760) | 3 (0.020) | 3/288 | NT | 2.2% | coding (82/687 nt) | ulaF | L‑ribulose 5‑phosphate 4‑epimerase |
? | NC_000913 | = 4423830 | 145 (0.890) | coding (131/687 nt) | ulaF | L‑ribulose 5‑phosphate 4‑epimerase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 166 total aligned reads displayed.
AAACGTGCCGTTTGGCGAAGGTGTAGTGGATTTCGAACGTTGTTTCGAAACGCTCAAACAGAGTGGCTATTGCGGGCCGTACCTGATTGAGATGTGGAGCGAAACGGCGGAAGACCCGGCGGCAGAAGTGGCGAAAGCGCGTGATTGGGTGAAAGCGCGCATGGCGAAAGCGGGCATGGTGGAGGCGGCATAATGCAAAAGCTAAAACAGCAGGTATTTGAAGCCAACATGGAGCTGCCGCGCTACGGGCTGGTGACCTTTACCTGGGGCAACGTCAGCGCTATCGACCGCGA‑ACGCGGGCTGGTGGTGATCAAGCCCAGCGGCGTTGCCTACGAAACCATGAAAGCGGCCGATATGGTGGTGGTTGATATGAGCGGCAAGGTGGTGGAAGGGGAGTATCGCCCATCTTCCGACACTGCGACGCATCTCGAACTCTACCGTCGTTACCCGTCGCTTGGTGGCATTGTCCATACCCACTCCACTCATGCCACCGCATGGGCGCAGGCGGGGCTGGCGATCCCGGCGTTAGGC > NC_000913/4423508‑4424038 | aaaCGTGCCGTTTGGCGAAGGTGTAGTGGATTTCGAACGTTGTTTCGAAACGGTCAAACAGAGTGGCTATTGCGGGCCGTACCTGATTGAGATGTGGAGCGAAACGGCGGAAGACCCGGCGGCAGAAGTGGCGAAAGCGCGTGATTGGGTGAAAGCGCGCATGGCGAAAGCGGGCATGGTGGAGGCGGCATAATGCAAAAGCTAAAACAGCAGGTATTTGAAGCCAACATGGAGCTGCCGCGCTACGGGCTGGTGACCTTTACCTGGGGCAACGt < 4:337465/275‑1 (MQ=255) tttGGCGAAGGTGTAGTGGATTTCGAACGTTGTTTCGAAACGCTCAAACAGAGTGGCTATTGCGGGCCGTACCTGATTGAGATGTGGAGCGAAACGGCGGAAGACCCGGCGGCAGCAGTGACGAAAGCGCGTGATTGGNGGAAAGCGCGCATGGCGACAGCGGGCACGGTTGAGGCGGCATAATGCAAAAGCTAACACAGAAGGATTTTGATGNCAACATCGAGCAGCCGGGCCACGGGCTGGTNNACTTGCCCTGGTGCAACGTCacccccccc > 3:108196/1‑267 (MQ=255) tttCGAACGTTGTTTCGAAACGCTCAAACAGAGTGGCTATTGCGGGCCGTACCTGATTGAGATGTGGAGCGAAACGGCGGAAGACCCGGCGGCAGAAGTGGCGAAAGCGCGTGATTGGGTGAAAGCGCGCATGGCGAAAGCGGGCATGGTGGAGGCGGCATAATGCAAAAGCTAAAACAGCAGGTATTTGAAGCCCACATGGAGCTGCCGCGCTCCGGGCTGGTGACCTTTACTTGGGGCAAGGGCATCGCTTCTGACCGCGA‑ACGCGGGCtgg > 4:245882/1‑274 (MQ=255) ttCGAACGTTGTTTCGAAACGCTCAAACAGATTGGCTATTGCGGGCCGTACCTGATTGAGATGTGGAGCGAAACGGCGGAAGACCCGGCGGCAGAAGTGGCGAAAGCGCGTGATTGGGTGAAAGCGCGCATGGCGAAAGCGGGCATGGTGGAGGCGGCATAATGCAAAAGCTAAAACAGCAGGTATTTGAAGCCAACATGGAGCTGCCGCGCTACGGGCTGGTGACCTTTACCTGGGGCAACGTCAGCGCTATCGACCGCGA‑ACGCGGGCtggt < 2:358084/274‑1 (MQ=255) ttGCGAGCCGTACCTGGTTGAGATGTGGAGCGAAACGGCGGAAGACCCGGCGGCAGAAGTGGCGAAAGCGCGTGATTGGGTGAAAGCGCGCATGGCGAAAGCGGGCATGGTGGAGGCGGCATAATGCAAAAGCTAAAACAGCAGGTATTTGAAGCCAACATGGAGCTGCCGCGCTACGGGCTGGTGACCTTTACCTGGGGCAACGTCAGCGCTATCGACCGCGA‑ACGCGGGCtggtgg < 2:369456/238‑1 (MQ=255) cGGGCGGTAACTGATGGAGATGGGGAGTGAAACGGCGGGAGAACCGGCGGGGGAATGGGCGAAAGCGCGGGATTGGGGGAAAGGGCGCATGGCGAAAGCGGGCATGGTGGAGGCGGCATAATGCAAAGGCGAAAACAGCAGGTAGTTGAAGCCAACATGGAGCTGCCGCGCTACGGGCTGGTGACCTTTCCCTGGGGCAACGTCAGCGCTATCGACCGCGA‑ACGCGGGCTGGTGGTGATCAAGCCCAGCGGCGTTGCCTACGAAACCATGAAAGc < 4:497763/275‑1 (MQ=255) tACCTGACTGAGATGTGGAGCGAAACGGCGGAAGACCCGGCGGCCGAAGTGGCGCAAGCGCGTGATCGGGTGAAAGCGCGCATGGCGAAAGCGGGCATGGGGGAGGCGGCATAATGCAAAAGCTAACAGAGAAGGTATTTGAAGCCAACATGGATATGCCGCGCTACGGGCTGGTTGACTTTACCTGGGCGACGGTAAGCGCTTTCCACC‑CGACACGCGGGCTGGTGGGGATCACGCGCACGGGCTTGGCCTACGAAACCCTGGCATCGGCAGat > 4:675548/1‑275 (MQ=255) 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gCTGGTGACCTTTACCTGGGGCAACGTCAGCGCTATCGACCGCGA‑ACGCGGGCTGGTGGTGATCAAGCCCAGCGGCGTTGCCTACGAAACCATGAAAGCGGCCGATATGGTGGTGGTTGATATGAGCGGCAAggtggt < 5:391409/138‑1 (MQ=255) cTGGTGACCTTTACCTGGGGCAACGTCAGCGCTATCGACCGCGA‑ACGCGGGCTGGTGGTGATCAAGCCCAGCGGCGTTGCCTACGAAACCATGAAAGCGGCCGATATGGTGGTGGTTGATATGAGCGGCAAGGTGGTGGAAGGGGAGt > 5:821241/1‑148 (MQ=255) cTTTACCTGGGGCAACGTCAGCGCTATCGACCGCGA‑ACGCGGGCTGGTGGTGATCAAGCCCAGCGGCGTTGCCTACGAAACCATTAAAGCGGCCg > 2:697955/1‑95 (MQ=255) tttACCTGGGGCAACGTCAGCGCTATCGACCGCGA‑ACGCGGGCTGGTGGTGATCAAGCCCAGCGGCGTTGCCTACGAAACCATGAAAGCGGCCGATATGGGGGTGGTTGATATGAGCGGCAAGGTGGTGGAAGGGGAGTATCGCCCAt > 6:761895/1‑148 (MQ=255) cTGGGGCAACGTCAGCGCTATCGACCGCGA‑ACGCGGGCTGGTGGTGATCAAGCCCAGCGGCGTTGCCTACGAAACCATGAAAGCGGCCGATATGGTGGTGGTTGATATGAGCGGCAAGGTGGTGGAAGGGGAGTATCGCCCATCTTCCg > 7:507497/1‑149 (MQ=255) tGGGGCAACGTCAGCGCTATCGACCGCGA‑ACGCGGGCTGGTGGTGATCAAGCCCAGCGGCGTTGCCTACGAAACCATGAAAGCGGCCGATATGGTGGTGGTTGATATGAGCGGCAAGGTGGTGGAAGGGGAGTATCGCCCATCTTCCg > 5:84420/1‑148 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |