| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,373,180 | T→C | 5.5% | W97R (TGG→CGG) | arnF → | undecaprenyl phosphate‑alpha‑L‑ara4N exporter; flippase ArnEF subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,373,180 | 0 | T | C | 5.5% | 733.0 / 17.9 | 220 | W97R (TGG→CGG) | arnF | undecaprenyl phosphate‑alpha‑L‑ara4N exporter; flippase ArnEF subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (103/101); new base C (9/4); total (114/106) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.55e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.24e-01 | |||||||||||
Only 100 of 221 total aligned reads displayed.
TATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCTGGGTTTTGCGGCGAGTCATCTGCCGCCGATGACGCACTTATGGGATTTTATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTAC‑TCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGCGAGAGTAAATCCCCCACTTTCACGGCGAAGTCACTCTTCACTTCGGCGAT > NC_000913/2372911‑2373448 | gCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCTGGGTTTTGCGGCGAGTCATCTGCCGCCGATGACGCACTTATGGGATTTTATCGCGGCTTTGTTAGCTCTTGGCCTGGATTCCCGGATACTGTTAC‑TCGGGCTGCTGGGTTATCTGTTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTCTGTTCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTATTTCCCGGCTGGGACGGGACttttttgtttac > 1:135946/1‑268 (MQ=255) aaTTAAGCATGGGTTTGGGGGGTGGTCAACTGCCGCCGATGACGCACTTATGGGATTTTATCGCGGCTCTGTTAGCGTTTGGCCTGGAGGCCCGGAGACTGTTAC‑TCGGGCTGGTGGTTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTGCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGa < 4:208512/275‑1 (MQ=255) tccTGGGTTTGTCGGCGGGTCAACTGCCGCCGATGACGGACTTTTTGGATTTTTTCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTAC‑TCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTGGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGcc < 4:345899/274‑1 (MQ=255) gggTTTTGCGGCGAGTCATCTGCCGCCGATGACGCACTTATGGGATTTTATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTAC‑TCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAACGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCGGGGAAGGGGCTTTTTCGGTTAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGta > 4:666970/1‑275 (MQ=255) tGCGGCGAGTCATCTGCCGCCGATGACGCACTTATGGGATTTTATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTAC‑TCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAATCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGGCTGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTTGGCGTAGCCTGttttt > 1:130227/1‑271 (MQ=255) aCGCACTTATGGGATTTTATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTAC‑TCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGcc < 2:721449/275‑1 (MQ=255) aCGCACTTATGGGATTTTATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTAC‑TCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGcc < 2:625279/275‑1 (MQ=255) gtAGCTTTTGGCCGGGATGCCCGGATACTTTGAC‑TCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTAGGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTccc < 2:685070/274‑1 (MQ=255) cTGGATGCCCGGATACTGTTAC‑TCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGcc < 4:473967/198‑1 (MQ=255) gATGCCCGGATACTGTTAC‑TCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTg > 2:281368/1‑275 (MQ=255) ctttgtttAC‑TCGTGCTTCTGGTTTATGTGCTTACTGTTGTTTTTTGCTCTACATCGCTTCATAAACTGGGGGTAAGCAAAGCCTTTGCCTTGCTCAGTATGAGTTAGGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTAGTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCTCTGAATGCACTACTGGGAGTAGCCGGTATTATGAGCGGGTTGATGCTCATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTCCTGATTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCa < 4:512150/269‑1 (MQ=255) tACTGTTAC‑TCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGa < 5:662479/148‑1 (MQ=255) gattGTTACTTCGGGCTCCTGGGTTTTCTCTTTTCCGTTTTTGGTTGGTATAAAACGCTT‑ATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGa < 6:264634/145‑1 (MQ=255) tGTTAC‑TCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAgg < 5:567901/148‑1 (MQ=255) tGTTAC‑TCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTAGGAAggg > 7:778717/1‑149 (MQ=255) tGTTAC‑TCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCAGCCGGGAAgta < 7:558087/149‑3 (MQ=255) gTTAC‑TCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGa < 7:840732/149‑1 (MQ=255) gTTAC‑TCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGa < 7:243990/149‑1 (MQ=255) gTTAC‑TCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTACGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGa < 8:416647/149‑1 (MQ=255) ttAC‑TCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAggg > 6:651953/1‑147 (MQ=255) atAC‑TCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTTCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGAc < 8:778717/148‑1 (MQ=255) attCGTGCTGCTGGGTTTTCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGTTGGTATGGATTGCTTAAATGGGACTTCCCGTCTGGGAAGGGACGTTTTCGCTGAAAGCAGTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACAACAAAGCAACGTTACGGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCAGCgg < 4:71001/273‑1 (MQ=255) gctgGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTg > 5:213528/1‑148 (MQ=255) aTCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCacta > 8:600472/1‑149 (MQ=255) tttCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTggg < 6:139554/148‑1 (MQ=255) tttCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGa > 7:224987/1‑149 (MQ=255) gTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGACCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGTCACGTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGCGGACttt > 2:66836/1‑275 (MQ=255) tttGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGt < 7:600472/149‑1 (MQ=255) tttGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGTTTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTCCCGTGAGTCCTTTCAc > 2:459984/1‑274 (MQ=255) ttgGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGtatta < 7:330879/149‑1 (MQ=255) gTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGa > 7:594551/1‑149 (MQ=255) tataAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTCTGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAg > 7:233264/1‑149 (MQ=255) tataAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGa > 6:860403/1‑148 (MQ=255) aCGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGTCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCTCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGAGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTc < 2:542250/275‑1 (MQ=255) aCGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGtt < 7:188278/149‑1 (MQ=255) cTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAAGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGa < 5:427587/148‑1 (MQ=255) ttCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTcc > 4:817734/1‑159 (MQ=255) ttCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAACACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACtt > 2:763510/1‑201 (MQ=255) ttCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCCCg > 2:689315/1‑274 (MQ=255) ttCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGAATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGcc > 2:139392/1‑163 (MQ=255) aTAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACtttt > 8:500406/1‑98 (MQ=255) aTAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACtttt < 7:500406/98‑1 (MQ=255) aTAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTg < 8:346851/149‑1 (MQ=255) tAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCt > 5:633571/1‑147 (MQ=255) tAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGcc < 2:817736/159‑1 (MQ=255) tAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGAATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACg < 4:139391/163‑1 (MQ=255) aaaaCTNGNCCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGGGTNATGTGCTGGTATGGATTGCTTTAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTAATGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTaca < 4:763508/200‑1 (MQ=255) ttGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTc > 7:80832/1‑149 (MQ=255) tGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTc < 6:907011/148‑1 (MQ=255) cgcTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTggg > 3:132295/1‑78 (MQ=255) cgcTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGaa > 2:339712/1‑97 (MQ=255) aaGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCa < 4:339710/97‑1 (MQ=255) aaGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGccc > 6:457734/1‑148 (MQ=255) cAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACg > 5:507667/1‑148 (MQ=255) ccTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACaaaa < 8:594551/149‑1 (MQ=255) tGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAaacaa < 6:507667/148‑1 (MQ=255) cTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGaa > 5:105603/1‑78 (MQ=255) ttGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGtt < 5:559083/148‑1 (MQ=255) gCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACt > 7:282885/1‑149 (MQ=255) tCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGaaa < 8:21051/74‑1 (MQ=255) tCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTg < 5:905230/148‑1 (MQ=255) cAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGa > 5:741090/1‑148 (MQ=255) aTGAGTTATTTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGtttt < 8:224685/149‑1 (MQ=255) aGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCaa > 4:451578/1‑257 (MQ=255) gTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCCCCGTATGCAGCTTTTCACGATTATACCAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGCCATAGTAAATccccc > 2:365685/1‑275 (MQ=255) gCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTaca < 2:51095/153‑1 (MQ=255) gCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATa < 4:430978/229‑1 (MQ=255) ggTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGCGAGAGTAAATCCCCCACTTTCCCgg > 2:163393/1‑275 (MQ=255) gTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGaa > 2:259072/1‑53 (MQ=255) gagagatcgtCAATGGTACTCGCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCAATACGTGGAGTGGCCTGTATTATGAGCGGGTTTAGGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGCGAGAGTAAATCCCCCACTTTCACGGCGa < 4:10323/265‑1 (MQ=255) ggATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCa < 4:259071/53‑1 (MQ=255) gATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGcc > 7:9555/1‑149 (MQ=255) gATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGcc < 7:702788/149‑1 (MQ=255) aTTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGcc > 5:261431/1‑148 (MQ=255) aTTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCg > 8:262829/1‑149 (MQ=255) aTTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCg > 8:184845/1‑149 (MQ=255) aTTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCg > 7:137607/1‑149 (MQ=255) tGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGAC‑TTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTa > 2:446826/1‑60 (MQ=255) cTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTcc < 8:22562/149‑1 (MQ=255) ttCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTccc > 7:223737/1‑149 (MQ=255) aaTGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACt > 8:820322/1‑149 (MQ=255) aTGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACt > 5:271447/1‑148 (MQ=255) tGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACt > 2:774599/1‑147 (MQ=255) cccTTCCCAGCCGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATc > 6:719086/3‑148 (MQ=255) tcTTCCAGGCTGGGAAGGGACTTTTTGGCGGAAAGAACCACTGGGGGTAGCCTGGATTAGTGGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACACCGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGCGAGAGTAAATCCCCCACTTTCACGGCGAAGTCACTCTTCACTTCg < 4:689313/273‑1 (MQ=255) aCTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATc < 4:774597/147‑1 (MQ=255) aCTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCaa > 4:59453/1‑225 (MQ=255) cTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGCGAGAGTAAATCCCCCACTTTCACg > 2:10323/1‑252 (MQ=255) cTTCCCAGCCGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGtt < 6:335315/136‑1 (MQ=255) cTTCCCAGCCGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGtt > 5:335315/1‑136 (MQ=255) cTTCCCAGCCGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTc < 7:183290/137‑1 (MQ=255) cTTCCCAGCCGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCgg > 5:844130/1‑148 (MQ=255) ttCCCTGCTGGGAAGGGACTTTTTCGTTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCgggg > 8:773234/1‑149 (MQ=255) ttCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGa > 8:835269/1‑90 (MQ=255) ttCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCGGCCCACGa < 7:835269/90‑1 (MQ=255) tgcccGGATGGGCAGGAACTGTGTCGCTGAAAGAATTACTGGGAGTAGCCTGTATGATGGTCGGGTTGGTGCTGATTTTCCTTCCCACGACAAACCAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACGCTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGCGAGAGTAAATCCCCCACTTTCACGGCGAAGTCACTCTTCACTTCGGCg < 4:163392/273‑1 (MQ=255) tCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCgggg > 6:398488/1‑148 (MQ=255) cccGGTGGGGAAGGGACTTGTTCGCTGAAAGGACTGCTGGGAGTAGCCGGTATTATGATCGGGTTGATGCTGATTTCCCTGCCAACAACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGCGAGAGTAAATCCCCCACTTTCACGGCGAAGTCACTCTTCACTTCGGCGAt < 2:585289/275‑1 (MQ=255) cccGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGc > 6:891229/1‑148 (MQ=255) ccGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGcc < 2:351067/82‑1 (MQ=255) | TATTCAGCGTCATTATTGCCTCAGTTGCGCAATTAAGCCTGGGTTTTGCGGCGAGTCATCTGCCGCCGATGACGCACTTATGGGATTTTATCGCGGCTCTGTTAGCTTTTGGCCTGGATGCCCGGATACTGTTAC‑TCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTATAACTGCTTGCCGAGAGGACTTTCACCGTATGCAGCTTTTCACGATTAATACAATAAAGCGCATTCTGCAAAGGCGAGAGTAAATCCCCCACTTTCACGGCGAAGTCACTCTTCACTTCGGCGAT > NC_000913/2372911‑2373448 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |