| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,704,304 | A→G | 7.6% | intergenic (‑241/+31) | rnc ← / ← lepB | RNase III/leader peptidase (signal peptidase I) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,704,304 | 0 | A | G | 7.6% | 320.6 / 13.6 | 105 | intergenic (‑241/+31) | rnc/lepB | RNase III/leader peptidase (signal peptidase I) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (49/48); new base G (3/5); total (52/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.16e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.34e-03 | |||||||||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
AAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACAAAGCCCCAGTAACGGCTGTCCGCGCTGTTGTCGCGGTTGTCGCCCATCATGAAGTATTGTCCCGGAGGAACAATCCAGGTTGCCAGTTGTTGCCCTGGCTGCTGGTAATACATCCCCACCTGATCC > NC_000913/2704037‑2704575 | aaGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGc > 1:76106/1‑275 (MQ=255) aTGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGATGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTCATCTCATAAATAATTCACGTCGTCCCCATAACGGCCACAAAGTGAACGAAg > 2:714255/1‑275 (MQ=255) ggggTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACCGACCGGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGAt < 2:548001/275‑1 (MQ=255) gCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTaa < 2:629149/275‑1 (MQ=255) aaatGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACATACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGGGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATg < 2:520698/275‑1 (MQ=255) cGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGACACGGGAGTTTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATACCGGCGACAACTGTAACGAAGATGGACATTAATGGATGCCGCCAATCCgcat > 4:520696/1‑272 (MQ=255) tCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTTACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTa > 2:162594/1‑275 (MQ=255) acGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGACGCCAATGACACTTAAGCGCAGACCCGTCg > 1:166897/1‑275 (MQ=255) aagggATATACATGGTTCAGCTAACTTCTTCGCTGCAGTTTCATTTTACGGGGATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGGGCCGTGGCAACCTGGAGGGGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTAAACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCg < 1:83789/270‑1 (MQ=255) atatACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCcttc > 2:318742/1‑274 (MQ=255) cATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCtt > 1:22266/1‑275 (MQ=255) tgtttcaatGCTTGGCTGCAGTTTCAGTTGAACGGGATAGGGGGCACGAGGCTGTTGAGTGGTCCTGGGAAACCTGGAGGTGCAGACCGTAAACTTCGGGGGAATAATCTAGACACAACGACGGGGGAGGTCGTTAGACACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGGGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGGAGACCAGTCGGCCATTAGCCTTCTTGCTTATCGAAg < 4:251870/267‑1 (MQ=255) cTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCCCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATTACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCAAATGCGACTTAAGCGCCACCCAGGCGGCCATTCGCCTTCTTGATTATCCAAtctc > 4:665385/1‑275 (MQ=255) tGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGTTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATcc > 4:388734/1‑274 (MQ=255) tGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGaa > 4:346293/1‑266 (MQ=255) tCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTc < 2:346295/266‑1 (MQ=255) cGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGa > 4:768608/1‑186 (MQ=255) gCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGAt < 2:768610/186‑1 (MQ=255) ggTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAAc < 7:868984/149‑1 (MQ=255) tGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCATCCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGTGAATATTCTATACACAACGACGGAGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCGTTATGGCGAc < 7:563024/149‑1 (MQ=255) gggACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAGTTCACGTTGTCGCCGTTATGGCGACa < 6:624240/148‑1 (MQ=255) gggACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAGTTCACGTTGTCGCCGTTATGGCGACa < 6:300081/148‑1 (MQ=255) ggACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACaa < 6:66043/148‑1 (MQ=255) cGCTGTTTGGGGTGCCGTGGCAACCTGGAGGGGCCAAACTTAAACTTCGGGGGAATATGATATACACAACGACGGGGGATGTCGTGAGCCACGGGAGATTTATCTAATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGcaca < 2:368826/274‑1 (MQ=255) gCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGt > 7:903437/1‑143 (MQ=255) gCTGTTGCGTTGGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACaa < 2:520760/274‑1 (MQ=255) tgCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTAt > 6:880963/1‑148 (MQ=255) cGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAAt < 8:582173/149‑1 (MQ=255) cGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTAACGTTGTCGCCATAACGGCGa > 4:199283/1‑123 (MQ=255) gCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAAc < 2:199284/123‑1 (MQ=255) cTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACaa > 8:470229/1‑103 (MQ=255) aaaCTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAACTAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCACAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATCCGCTTCCGGCACAAAGCCCCAGTAACGGCTGTCCGCGCTGTTGTCGCGGtttcgg > 2:138355/1‑271 (MQ=255) aCTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGa < 6:905033/95‑1 (MQ=255) aCTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGa > 5:905033/1‑95 (MQ=255) tacaatgaacatgttCTATACAAAAGGACGGGGGATGTGGGTAGCCACGGGATAGTTATCTCAGAAAAAATTCGGCTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCTAATGCTACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATGCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACAAAGCCCCAGTAACGGCTGTCCGCGCTGTTGTCGCGGTTGTCGcc < 4:409123/261‑1 (MQ=255) tgcGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGTGGATGGCGGTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTATCGCCATAACGGCGACAACGGGAACGAAGATGGCGATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCATTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACAAAGCCCCAGTAACGGCTGTCCGCGCTGTTTTCGCGGTTGTCGcc < 1:88329/271‑1 (MQ=255) tCGGGGGAATTTGCTAGAACAAACTCCGGGGTATGTCGTTAGTAACTGGGGATTTATCTAAGAAATAATTCACGTTGTCGCCATACCGGCGACAACTTGAAGAAATATGGCTATGAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCCCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGGCCAGATTCGCTTCCGGCACAAAGCCCCAGTAACGGCTGTCCGCGCTGTTGTCGCGGTTGTCGCCca < 4:138354/274‑1 (MQ=255) tCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGAc > 5:489665/1‑148 (MQ=255) cGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCg > 2:668338/1‑133 (MQ=255) ggAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACtt < 4:668336/133‑1 (MQ=255) ataCACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCCGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAACCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACAAAGCCCCAGTCACCGCCAGCCGCGCTGGTCTCGCGGTTATCGCCGATCGTgcataatttccc > 4:449056/1‑264 (MQ=255) taCACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACAAAGCCCCAGTAACGGCTGTCCGCGCTGTTGTCGCGGTTGGCGCCCATCATGAAGTATTGTacc > 2:438546/1‑275 (MQ=255) acacAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACa < 5:541683/77‑1 (MQ=255) acacAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACa > 6:541683/1‑77 (MQ=255) acacAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCct < 5:880963/148‑1 (MQ=255) aaCGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACg > 4:513003/1‑82 (MQ=255) aaCGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATgg > 3:198105/1‑89 (MQ=255) aaCGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTaa > 4:718048/1‑96 (MQ=255) aaCGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGAcc > 2:120342/1‑128 (MQ=255) aaCGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGc > 2:131362/1‑204 (MQ=255) aaCGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACAAAGCCCCAGTAACGGCTGTCCGCGCTGTTGTCGCGGTTGTCGCCCATCATGAAGTATTGTCCCggag > 2:107153/1‑274 (MQ=255) aaCGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACAAAGCCCCAGTAACGGCTGTCCGCGCTGTTGTCGCGGTTGTCGCCCATCATGAAGTATTGTCCCggag > 2:181449/1‑274 (MQ=255) aaCGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACAAAGCCCCAGTAACGGCTGCCCGCGCTGTTGTCCCGGTTTTc > 4:271090/1‑248 (MQ=255) aaCGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCCCATCCAGATAGCAGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCGGGCACAAAGCCCCAGTAACGGCTGTCCGCGCTGTTTCCCCGGTTGTCGCCACTCCTGACATATTGTccgcggtg > 4:631148/1‑269 (MQ=255) aaCGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCCCATCCAGATACCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCCCaa > 4:710324/1‑208 (MQ=255) aaCGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTCCTTATCGAAGCTCATCCAAATAGCCGTTGCCCGACCGACCACATTCCCTTCCGGCCCAAAGCCCCGGTACCGGCTTTCCGCGCTGTTGCCCCGTTTGGCGCCCATCATCAAGTATTGTCCCggag > 4:368789/1‑274 (MQ=255) aaCGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGCGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCACTGCGACTTACGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACACAGCCCCAGTAACGGCTGTCCGCGCTGTTTTCGCGGTTGt > 2:409125/1‑247 (MQ=255) acgacgGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCACTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCATAAAGCCCCAGTAACGGCTGTCCGCGCTGTTGTCGCGGTTGTCGCCCATCATGAAGTATTGTCCCggagg < 2:161783/274‑1 (MQ=255) cgccgGGGAATGTCTTTAGCCACCGGTGATTTATACCCTAAATAATTCCCGTGTTCGCCATAACGGCGACAACGTGACCGACAATGGCTATTAATGGCTGCCGCCAATGCGACTTCAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTTCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACAAAGCCCCAGTAACGGCTGTCCGCGCTGTTGTCGCGGTTGTCGCCCATCATGAAGTATTGTCCCGGAGGaa < 4:438544/272‑1 (MQ=255) cgacgGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACAAAGCCCCAGTAACGGCTGTCCGCGCTGTTTTCGCGGTTGTCTCCCATCATGAAGTCTTTTCCCggagga > 4:354999/1‑274 (MQ=255) acgGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGa < 2:513005/82‑1 (MQ=255) acgGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTAt < 1:198106/89‑1 (MQ=255) acgGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGa < 2:718050/96‑1 (MQ=255) acgGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTc < 4:120341/128‑1 (MQ=255) acgGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACaa < 4:131361/204‑1 (MQ=255) acgGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACAAAGcc < 2:710326/208‑1 (MQ=255) acgGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACAAAGCCCCAGTAACGGCTGTCCGCGCTGTTGTCGCGGTTGTCGccc < 2:271091/248‑1 (MQ=255) ggggATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACAAAGCCCCAGGAACGGCTGTCCGCGAGTTTGTCGCGGTTGTCCCCCATTATGAATTATTGTCACGGAGGAACAATc > 4:331516/1‑275 (MQ=255) gTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGaa > 7:626674/1‑67 (MQ=255) gTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGaa < 8:626674/67‑1 (MQ=255) gTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGATATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTGAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATc > 7:567002/1‑149 (MQ=255) gTTAGACACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACAAAGCCCCAGTAACGGCTGTCCGCGCTGTTGTCGCGGTTGTCGCCCATCATGAAGTATTGTCCCGGAGGAACAATCCAGGTTGcc < 2:368791/275‑1 (MQ=255) cGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGGCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAg < 1:141562/135‑1 (MQ=255) aTTTATCCCAAAAATAATTCACGTGTTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACAAAGCCCCAGTAACGGCTGTCCGCGCTGTTGTCGCGGTTGTCGCCCATCATGAAGTATTGTCCCGGAGGAACAATCCAGGTTGCCAGTTGTTGCCCTgg < 4:195703/275‑1 (MQ=255) tgaTCTCATAAAGAGTTACCGTTGTGGCCAGAAGGTCGAAAACTGGAACGAAGGTGGCTAGTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTGGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACAAAGCCCCAGTAACGGCTGTCCGCGCTGTTGTCGCGGTTGTCGCCCATCATGAAGTATTGTCCCGGAGGAACAATCCAGGTTGCCAGTTGTTGCCCTGgct < 4:539371/273‑1 (MQ=255) tATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACAAAGCCCCAGTAACGGCTGTCCGCGCTGTTGTCGCGGTTGTCGCCCATCATGAAGTATTGTCCCGGAGGAACAATCCAGGTTGCCAGTTGTTGCCCTGgctg < 2:355001/275‑1 (MQ=255) taaataaTTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCGAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTCGCCCgaccgacc < 8:567002/149‑1 (MQ=255) aaataaTTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATc > 7:170413/1‑124 (MQ=255) aaataaTTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATc < 8:170413/124‑1 (MQ=255) aataatTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACAAAGCCCCAGTAACGGCTGTCCGCGCTGTTGTCGCGGTTGTCGCCCATCATGAAGTATTGTCCCGGAGGAACAATCCAGGTTGCCAGTTGTTGCCCTGGCTGCTGGTAAt < 2:388736/274‑1 (MQ=255) ataatTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCa < 7:241698/81‑1 (MQ=255) ataatTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCa > 8:241698/1‑81 (MQ=255) ataatTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGa > 8:697279/1‑149 (MQ=255) atTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGAACAGAtt < 6:489665/148‑1 (MQ=255) ttCACGTTGTCGCCGTTATGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGAt > 7:503864/1‑123 (MQ=255) ttCACGTTGTCGCCGTTATGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGAt < 8:503864/123‑1 (MQ=255) ttCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACAAAGCCCCAGTAACGGCTGTCCGCGCTGTTGTCGCGGTTGTCGCCCATCATGAAGTATTGTCCCGGAGGAACAATCCAGGTTGCCAGTTGTTGCCCTGGCTGCTGGTAATACATcc < 4:107152/275‑1 (MQ=255) cGTTGTCGCCGTTATGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTTAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTAt > 6:275569/1‑103 (MQ=39) cGTTGTCGCCGTTATGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTTAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTAt < 5:275569/103‑1 (MQ=39) gTTGTCGCCGTTATGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTcc > 7:841306/1‑149 (MQ=255) gTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACAAAGccc > 1:59979/1‑161 (MQ=255) ttGTCTCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATACCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACAAAGCCCCAGTAACGGCTGTCCGCGCTGTTGTCGCGGTTGTCGCCCATCATGAAGTa < 1:151686/210‑1 (MQ=255) tGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGt > 2:597628/1‑77 (MQ=255) gTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACAAAGCCCCAGTAACGGCTGTCCGCGCTGTTGTCGCGGTTGTCCCCCATCATGAAGTATTTTCCCGGAGGAACAATCCAGGTTTCCAGTTGTTGCCCTGGCCGCTGGTAATAcccttgctctta > 4:655796/1‑263 (MQ=255) cGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACAAAGCCCCAGTAACGGCTGTCCGCGCTGTTGTCGCGGTTGTCGCCcat > 2:107180/1‑197 (MQ=255) gCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACAAAGCCCCAGTAACGGCTGTCCGCGCTGTTGTCGCGGTTGTCGCCCATCCTGAAGTATTGTCCCGGAGGAACACTCCAGTTTGCCAGTTGTTGCCCTGGCTGCTGGTAATCCATCCCCCCCTgtccc > 4:107299/1‑271 (MQ=255) gCCATAACGGCGACAACATGAACGAAGATAGCTATTAATAGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGc < 4:597626/77‑1 (MQ=255) ccATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACaa > 8:3416/1‑149 (MQ=255) ccATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACAAAGCCCCAGTAACGGCTGTCCGCGCTGTTGTCGCGGTTGTCGCCCATCATGAAGTATTGTCCCGGAGGAACAATCCAGGTTGCCAGTTGTTGCCCTGgctg < 2:655798/249‑1 (MQ=255) aTAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACAAAGCCCCAGTAACGGCTGTCCGCGCTGTTGTCGCGGTTGTCGCCCATCATg < 4:107179/197‑1 (MQ=255) | AAGCCGATTAATTACGATGGGGTTCATGCGATACCAATAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACAAAGCCCCAGTAACGGCTGTCCGCGCTGTTGTCGCGGTTGTCGCCCATCATGAAGTATTGTCCCGGAGGAACAATCCAGGTTGCCAGTTGTTGCCCTGGCTGCTGGTAATACATCCCCACCTGATCC > NC_000913/2704037‑2704575 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |