| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,753,986 | 0 | A | T | 5.1% | 663.7 / 17.0 | 185 | intergenic (+40/+22) | bamE/ratB | lipoprotein component of BamABCDE OM biogenesis complex/UPF0125 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (86/89); new base T (3/7); total (89/96) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.34e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 190 total aligned reads displayed.
CTGACCGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTAGTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGATATCGGTACGCAATTCCAGCAAGCCACTGGCGCGAATAGCTTCTTCAACCGTCGCGCCCTCCTGCAGCGTCACTCGCTGCAGGTA > NC_000913/2753716‑2754247 | ctgctcGCTAACGACGTTTCAGAAAGACGGGTTGGCATGACGCAACCACAAGTTGCGTTACCATTGGGTCCACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCGGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAAATCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGGCGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAg < 4:209338/270‑1 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tGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCtttttt < 1:44663/73‑1 (MQ=255) tGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGagag > 5:457411/1‑142 (MQ=255) tGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGagag < 6:457411/142‑1 (MQ=255) aGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTcc < 8:233542/149‑1 (MQ=255) tGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAggg > 4:792011/1‑135 (MQ=255) 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CTGACCGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTAGTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGATATCGGTACGCAATTCCAGCAAGCCACTGGCGCGAATAGCTTCTTCAACCGTCGCGCCCTCCTGCAGCGTCACTCGCTGCAGGTA > NC_000913/2753716‑2754247 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |