Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 374,682 | 0 | C | T | 6.5% | 433.2 / 14.2 | 140 | P272L (CCG→CTG) ‡ | mhpE | 4‑hyroxy‑2‑oxovalerate/4‑hydroxy‑2‑oxopentanoic acid aldolase, class I |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (65/65); new base T (3/6); total (69/71) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.94e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
CCGCGCCCTGAAAGCAGAGCTGAAACCAGAAACGCAAACTGGCATGCACGCTCACCATAACCTGAGTCTTGGCGTGGCGAACTCTATCGCGGCGGTGGAAGAGGGCTGCGACCGAATCGACGCCAGCCTCGCGGGAATGGGCGCGGGCGCAGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGC‑TGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCAGGAGGATATGATCGTTGACGTGGCGCTGGATCTGCGCAACAACAAATAATGATGACTGCCGAGAACGTGCATTTTGTATGCCCATCCCAGCACGACTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATC > NC_000913/374410‑374955 | ccacgcCCTGAAAGCAGGGCTGAAACCAAAGACGCAAACTGACATGCCCGCTCACCATCACCTGAGGCTTGGCGGGGCGGACTCTATCGCGGCGGTGGAAGAGGGCTGGGACCGAATCGACGCCAGCCTCGCGGGAATGGGCGCGGGCGCAGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCgg < 1:15907/272‑1 (MQ=255) 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ccGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGC‑TGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCAGGAGGATATGATCGTTGACGTGGCGCTGGATCTGCGCAACAACAAATAATGATGACTGCCGAGAACGTGCATTTTGTATGCCCATCCCAGCACGACTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATc < 2:445659/275‑1 (MQ=255) | CCGCGCCCTGAAAGCAGAGCTGAAACCAGAAACGCAAACTGGCATGCACGCTCACCATAACCTGAGTCTTGGCGTGGCGAACTCTATCGCGGCGGTGGAAGAGGGCTGCGACCGAATCGACGCCAGCCTCGCGGGAATGGGCGCGGGCGCAGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGC‑TGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCAGGAGGATATGATCGTTGACGTGGCGCTGGATCTGCGCAACAACAAATAATGATGACTGCCGAGAACGTGCATTTTGTATGCCCATCCCAGCACGACTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATC > NC_000913/374410‑374955 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |