| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 374,683 | G→C | 6.5% | P272P (CCG→CCC) ‡ | mhpE → | 4‑hyroxy‑2‑oxovalerate/4‑hydroxy‑2‑oxopentanoic acid aldolase, class I |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 374,683 | 0 | G | C | 6.5% | 461.3 / 20.0 | 140 | P272P (CCG→CCC) ‡ | mhpE | 4‑hyroxy‑2‑oxovalerate/4‑hydroxy‑2‑oxopentanoic acid aldolase, class I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (66/64); new base C (3/6); total (69/71) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.93e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.91e-03 | |||||||||||
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
CCGCGCCCTGAAAGCAGAGCTGAAACCAGAAACGCAAACTGGCATGCACGCTCACCATAACCTGAGTCTTGGCGTGGCGAACTCTATCGCGGCGGTGGAAGAGGGCTGCGACCGAATCGACGCCAGCCTCGCGGGAATGGGCGCGGGCGCAGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCAGGAGGATATGATCGTTGACGTGGCGCTGGATCTGCGCAACAACAAATAATGATGACTGCCGAGAACGTGCATTTTGTATGCCCATCCCAGCACGACTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATC > NC_000913/374410‑374955 | ccacgcCCTGAAAGCAGGGCTGAAACCAAAGACGCAAACTGACATGCCCGCTCACCATCACCTGAGGCTTGGCGGGGCGGACTCTATCGCGGCGGTGGAAGAGGGCTGGGACCGAATCGACGCCAGCCTCGCGGGAATGGGCGCGGGCGCAGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCgg < 1:15907/272‑1 (MQ=255) cTGAAAGCAGAGCTGAAACCAGAAACGCAAACTGGCATGCACGCTCACCATAACCTGAGTCTTGGCGTGGCGAACTCTATCGCGGCGGTGGAAGAGGGCTGCGACCGAATCGACGCCAGCCTCGCGGGAACGGGCGCGGGCGCAGGTAACGCCCCGCTGGAAGTGGTTATTGCCCCCGCGGAGAAACTGGGCTGGCAGCACGGTACCGATCTCTATGCGCTAATGGCTGACGCCGACGACCTGTTGCGTCCGTTGCGGGAGCCACAGGTActac > 4:632539/1‑271 (MQ=255) acagaGAAGCGCAAACTAGCATGCACGCTCACCATAACCTGAGGCTTGGCGTGGCGAACTCTATCGCGGCGGTGGAAGAGGGCTGCGACCGAATCGACGCCAGCCTCGCGGGAATGGGCGCGGGCGCAGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAGACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGTTCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAAcgct < 2:83567/270‑1 (MQ=255) cTGGCATGCACGCTCACCATAACCTGAGTCTTGGCGTGGCGAACTCTATCGCGGCGGTGGAAGAGGGCTGCGACCGAATCGACGCCAGCCTCGCGGGAATGGGCGCGGGCGCAGGTAACGCCCCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACCGGGCTGTCAGCATGGGACCGAACTCAATGCGTTAATGGAGGCCGCCGACGACCTGGTTCGTCTGTCGCAGGAACGACCGGTACGAGTCGGTCGCCAAACGCTGGCGCTGGGAtcggt > 4:83566/1‑270 (MQ=255) tCACCATAACCTGAGTCTTGGCGTGGTGAACTCTATCGCGGCGGTGGAAGAGGGCTGCGACCGAATCGACGCCAGCCTCGCGGGAATGGGCGCGGGCGCAGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGCTAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCTGCCGACGACCTGGTTCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGCTTACTCg > 2:174823/1‑274 (MQ=255) tCACCATAACCTGAGTCTTGGCGTGGCGAACTCTATCGCGGCGGTGGAAGAGGGCTGCGACCGAATCGACGCCAGCCTCGCGGGAATGGGCGCGGGCGCAGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGCTCGCGAAACGCTGGAGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCg > 2:12253/1‑274 (MQ=255) gAGTCTTGGCGTGGCGAACTCTATCGCGGCGGTGGAAGAGGGCTGCGACCGAATCGACGCCAGCCTCGCGGGAATGGGCGCGGGCGCAGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAAcgctggc > 2:624838/1‑237 (MQ=255) gTCTTGGCGTGGCGAACTCTATCGCGGCGGTGGAAGAGGGCTGCGACCGAATCGACGCCAGCCTCGCGGGAATGGGCGCGGGCGCAGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCCTGGGACCGATCTCTATGCGTTACTGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGCTCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGGTCCGCt > 2:690142/1‑248 (MQ=255) gTCTTGGCGTGGCGAACTCTATCGCGGCGGTGGAAGAGGGCTGCGACCGAATCGACGCCAGCCTCGCGGGAATGGGCGCGGGCGCAGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGACGACGACCTGGTGCGTCAGTTGNCGGAACGAACGGTCCGCGTCCAACGCGAAACGCAGGCGCTGGGATACGCGGGGGTTTACTCGAGAttacgtagtccc > 3:162265/1‑265 (MQ=255) cTTGGCGTGGCGAACCCTATCGGGGCGGTGGAAGAGGGCTGCGACCGAATCGACGCCAGCCTCGCGGGAATGGGGGCGGGCGCAGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACtg < 2:632541/275‑1 (MQ=255) agtgtctaggcggGGGAGGAGGGGGGCGGCACAATCGACGCGAACATCGCGGGAATGGGCGAGGGCGGAGGGCACGCACCGCCGGGAGGGTTTATTGCGGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGGATGGGGCCGATCTCGATGCGTGAATGGATGCCGCGGCCGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGGACGAGTCGGTCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTGGAGCTTCCTGCGTCACTGGGAAAcggcggcgg < 4:104357/266‑1 (MQ=255) gAATCGACGCCAGCCTCGCGGGAATGGGCGCGGGCGCAGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATtctc > 2:370221/1‑275 (MQ=255) ccTCGCGGGAATGGGCGCGGGCGCAGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCgg < 7:139917/149‑1 (MQ=255) ccTCGCGGGAATGGGCGCGGGCGCAGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCg > 6:714191/1‑148 (MQ=255) aaTGGGCGCGGGCGCAGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTc < 5:64048/148‑1 (MQ=255) aTGGGCGCGGGCGCAGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCg > 4:296576/1‑189 (MQ=255) gggcgcgggcgcAGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACTCGTACCGGTCGATc < 7:285661/149‑1 (MQ=255) ggcgcgggcgcAGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACTCGTACCGGTCGATcc < 7:840780/149‑2 (MQ=255) gcgcgggcgcAGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACTCGTACCGGTCGATcct < 8:140074/149‑3 (MQ=255) gcgcgggcgcAGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCt < 2:296577/189‑1 (MQ=255) cgcgggcgcAGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATcgcg < 7:706359/149‑1 (MQ=255) cgcgggcgcAGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATcgc > 6:656242/1‑148 (MQ=255) cgcgggcgaCGGTAAGCCCCCGGTGGAGATGTTTACTGCGGCGGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGAGCTCTATGCGTTAATGGAGTCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGGGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTg < 4:189757/275‑1 (MQ=255) cgacggagaCGGACCGGTGGTAGGGTTTATTGCTGCGGCGGATAAACCGGGATGGCAGCATGGGGCCGATCTCTATGAGTTAATGGATGCCGCCGACGGCCCGGTGCGTCCGTTGTAGGATCGACCGGTACGAGGCGATCGCGAAACGCTGGGGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGGGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTggcggc < 4:572707/266‑1 (MQ=255) gcAGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAAcgc > 6:555704/1‑148 (MQ=255) aGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCag < 2:147406/274‑1 (MQ=255) gTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAAcgctggcg > 7:734345/1‑149 (MQ=255) tAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAAcgctggcg < 5:778799/148‑1 (MQ=255) cGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAAcgctggcgctgg < 8:231142/149‑1 (MQ=255) gCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTggg < 8:492722/149‑1 (MQ=255) gCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGGGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCAGGAGGATATGAttg > 2:410985/1‑273 (MQ=255) gAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCAc < 2:345999/174‑1 (MQ=255) gAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCgg < 2:37388/211‑1 (MQ=255) gtgtTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCTATCGCTATGCGGTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCTATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCGGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCAGGAGGATATGATCGTTGACGt < 1:135587/275‑1 (MQ=255) gtgtTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCAGGAGGATATGATCGTTGACGt < 2:652354/275‑1 (MQ=255) tgtTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCT‑GTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGttt > 8:476482/1‑149 (MQ=255) gtTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGCTATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCAGGAGGCTTTGAACGTTGCCGtt > 2:200758/1‑273 (MQ=255) aTTGCGGCCGGGGAGAAACTGGGTGGGCGGAATGGGACCGATCTCTATGCGTGAATGGATGCGGCCGACGGCCTGGGGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGGGAAACGGTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCAGGAGGATATGATCGTTGACGTGgcgc < 4:370219/274‑1 (MQ=255) cggagcgGTTAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCCGGTGCGGCCGTTGGAGGATCGACCTGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCAGGAGGATATGATCGTTGACGTGGCGCTGGAt < 4:678054/270‑1 (MQ=255) ccgcGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCtt > 5:461109/1‑148 (MQ=255) aTAACCTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGTATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCAGGAGGATATGATCGTTGACGTGGCGCTGGATCTGCGcaac < 1:162266/275‑1 (MQ=255) tAAACTGGGCTGGCAGCATGGGCCCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCAGGAGGATATGATCGTTGACGTGGCGCTGGATCTGCGcaaca < 1:79530/275‑1 (MQ=255) aaaCTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAAcgc > 5:761107/1‑106 (MQ=255) cagcaTGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGc < 6:686754/110‑1 (MQ=255) cagcaTGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGc > 5:686754/1‑110 (MQ=255) caTGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCAc > 5:159249/1‑135 (MQ=255) caTGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCAc < 6:159249/135‑1 (MQ=255) aCCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGaaa > 6:381538/1‑82 (MQ=255) aCCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGaaa < 5:381538/82‑1 (MQ=255) ccGATCTCGATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGTTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCAGGAGGATATGATCGTTGACGTGGCGCTGGATCTGCGCAACAACAAATAATGATGACTGCCgag < 1:74387/274‑1 (MQ=255) gATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGtt > 5:793499/1‑148 (MQ=255) tctATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGc < 7:273284/149‑1 (MQ=255) tATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCtt > 7:198284/1‑149 (MQ=255) aTGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCAGGAGGATATGATCGTTGACGTGGCGCTGGa > 4:233216/1‑232 (MQ=255) cGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAg > 5:862739/1‑148 (MQ=255) gTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCAGGAGGATATGATCGTTGACGTGGCGCTGGATCTg < 2:233217/232‑1 (MQ=255) aaTGGATGTCGCCGACGACCTGGTTCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGCCGATCGCGAAACGCTTGCGCTGGGATACGCCGGTGTTTACTAGAGCTCACTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGTCTTCAGTGCGGTGGATATTCTCGCTGAGCTGGGCAAACTCCGGATGCTTGTCGTCCAGGCGGATTTGATCGTCTACGCGGCGTTGGACCTGCCCACATCCAAAAAATGAATACTTCCTGGAACGTGCATTTTTTAt > 4:557707/1‑274 (MQ=255) aaTGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCg > 2:587242/1‑97 (MQ=255) aaTGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATAtt > 1:96529/1‑157 (MQ=255) aaTGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTTGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCAGGAGGATTTGATCGTTGACGTGGCCCTGGACCTGCGCAACCAACAATAATAGTGACTGCCGAGAACGTGCATTTTGttt > 4:483888/1‑272 (MQ=255) aaTGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTggcgg > 4:660780/1‑192 (MQ=255) aaTGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGAAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGGGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCAGGAGGATATGATCGTTGACGTGGCGCTGGATCTGCGCAACAACAAATAATGATGACTGCCGAGAACGTGCATTTTGTATg < 2:637616/275‑1 (MQ=255) tGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGa > 4:352035/1‑77 (MQ=255) tGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAg > 4:799067/1‑142 (MQ=255) gaggccgccGACGACCTGNTGCGTCCGTTGCAGGTGCGACCGGTACGAGTCGTTCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCg < 3:96528/154‑1 (MQ=255) gATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCt < 4:587240/97‑1 (MQ=255) gATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCag < 2:660782/192‑1 (MQ=255) gATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCAGGAGGATATGATCGTTGACGTGGCGCTGGATCTGCGCAACAACAAATAATGATGACTGCCGAGAACGTGCATTTTGTATGcc < 2:483890/273‑1 (MQ=255) tGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCg < 2:799069/142‑1 (MQ=255) tGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAACTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCAGGAGGATATGATCGTTTACGTGGCGCGGGAACTGCGCCACAACCAAAAATGATTACTGCCCAGAACGGGCCATTTGTATGcccca > 4:445657/1‑272 (MQ=255) ccgccgACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCAGGAGGATATGATCGTTGACGTGGCGCTGGATCTGCGcaacaaca > 2:500859/1‑231 (MQ=255) cgccgACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATAtt < 5:66308/148‑1 (MQ=255) gccgACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATtc > 6:435025/1‑148 (MQ=255) gccgACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCg < 2:663205/151‑1 (MQ=255) ccgACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATtct < 5:656242/148‑1 (MQ=255) gacgacCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGt < 7:352722/149‑1 (MQ=255) acgacCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGtt < 8:734345/149‑1 (MQ=255) acgacCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGt < 6:862739/148‑1 (MQ=255) acgacCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGt > 5:22212/1‑148 (MQ=255) ccTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGTGGTGGATATTCTCGtt < 8:715259/145‑1 (MQ=255) cTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTCAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCt > 7:371/1‑149 (MQ=255) ttGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTggg > 7:694080/2‑149 (MQ=255) tCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAAcgctg > 4:772855/1‑43 (MQ=255) tCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAAc > 7:674612/1‑149 (MQ=255) tCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTggcgg > 2:732101/1‑165 (MQ=255) tCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAACTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAAc < 8:622691/149‑1 (MQ=255) ccGTTGCAGTATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCGGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACg > 8:288461/1‑149 (MQ=255) ttGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAAcgctggcgc < 2:772857/43‑1 (MQ=255) ttGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCag < 4:732099/165‑1 (MQ=255) ctggAGCGACCGGTACGAGTCGATCCCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCGCTGGGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCAGGAGGATATGATCGTTGACGTGGCGCTGGATCTGCGCAACAACAAATAATGATGACTGCCGAGAACGTGCATTTTGTATGCCCATCCCAGCACGACTGCCGGATGCGGCGTGaa < 1:60612/273‑1 (MQ=255) gcgATCGACTCGTACCGGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGtt > 7:579131/3‑128 (MQ=255) gcgATCGACTCGTACCGGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGtt < 8:579131/126‑1 (MQ=255) aTCGACTCGTACCGGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGt > 5:464340/1‑148 (MQ=255) aTCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGtt > 7:672647/1‑149 (MQ=255) tCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTTGTGCTTGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTAAAACGGCGGAGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGTCAAACGCCGGATGGtt > 5:626298/1‑148 (MQ=255) cGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTg < 5:435025/148‑1 (MQ=255) aCCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATAtt < 6:380452/115‑1 (MQ=255) aCCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATAtt > 5:380452/1‑115 (MQ=255) ccGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGGNCGGGGTTACGCTTGTGTTGACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCAggagga < 3:76632/158‑1 (MQ=255) ccGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTggcg > 6:286641/1‑148 (MQ=255) | CCGCGCCCTGAAAGCAGAGCTGAAACCAGAAACGCAAACTGGCATGCACGCTCACCATAACCTGAGTCTTGGCGTGGCGAACTCTATCGCGGCGGTGGAAGAGGGCTGCGACCGAATCGACGCCAGCCTCGCGGGAATGGGCGCGGGCGCAGGTAACGCACCGCTGGAAGTGTTTATTGCCGCCGCGGATAAACTGGGCTGGCAGCATGGGACCGATCTCTATGCGTTAATGGATGCCGCCGACGACCTGGTGCGTCCGTTGCAGGATCGACCGGTACGAGTCGATCGCGAAACGCTGGCGCTGGGATACGCTGGTGTTTACTCGAGCTTCCTGCGTCACTGTGAAACGGCGGCGGCGCGTTATGGCTTAAGTGCGGTGGATATTCTCGTTGAGCTGGGCAAACGCCGGATGGTTGGCGGCCAGGAGGATATGATCGTTGACGTGGCGCTGGATCTGCGCAACAACAAATAATGATGACTGCCGAGAACGTGCATTTTGTATGCCCATCCCAGCACGACTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATC > NC_000913/374410‑374955 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |