| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 3,313,208 | T→A | 5.4% | intergenic (‑30/+134) | rbfA ← / ← infB | 30s ribosome binding factor/translation initiation factor IF‑2 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,313,208 | 0 | T | A | 5.4% | 521.1 / 14.1 | 149 | intergenic (‑30/+134) | rbfA/infB | 30s ribosome binding factor/translation initiation factor IF‑2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (69/72); new base A (5/3); total (74/75) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.94e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.02e-01 | |||||||||||
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
GCTGCGGATGAAACCAGAAGCTTCTTGCAACGCTTTGATGCCCGCTTTAACCGCGTCTTCATCTTTGTCGTTGAGGAACGTCACATATACTTTGGCATACGCCAGGTCGCGAGACATTTCGACACCGGAAACGGTGGTCATCATGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTAACGCCGATACCACATTCCATACCGTTACGGACTTCGTTAACGTCATCTTTGAAGCGGCGCA > NC_000913/3312936‑3313481 | gCTGCGGATGAAACCAGAAGCTTCTTGCAACGCTTTGATGCCCGCTTTAACCGCGTCTTCATCTTTGTCGTTGAGGAACGTCACATATACCTTGGCATACGCCAGGTCGCGAGACATTTCGACACCGGAAACGGTGGTCATCATGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTa > 2:721/1‑275 (MQ=255) tGCGGATGAAACCAGAAGCTTCTTGCAACGCTTTGATGCCCGCTTTAACCGCGTCTTCATCTTTGTCGTTGAGGAACGTCACATATACTTTGGCATACGCCAGGTCGCGAGACATTTCGACACCGGAAACGGTGGTCATCATGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGc > 2:183549/1‑275 (MQ=255) tcttGCAACGCTTTGATGCCCGCTTTAACCGCGTCTTCATCTTTGTCGTTGAGGAACGTCACATATACTTTGGCATACGCCAGGTCGCGAGACATTTCGACACCGGAAACGGTGGTCATCATGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCACATTCTTTCGCCATAATAACTTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAaatttaattta > 4:659523/1‑274 (MQ=255) ttGCAACGCTTTGATGCCCGCTTTAACCGCGTCTTCATCTTTGTCGTTGAGGAACGTCACATATACTTTGGCATACGCCAGGTCGCGAGACATTTCGACACCGGAAACGGTGGTCATCATGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCa > 2:674732/1‑274 (MQ=255) tGATTCCCGCTTTAACCGCGTCTTCATCTTTGTCGTTCAGGAACGTAAAATAGACTTTGGCAGAAGTCAGGTCGCGGTACATTTCGACACCGGAAACAGTGGTCATCATGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCAGTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATGCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGccc < 4:442885/244‑1 (MQ=255) tGATGCCCGCTTGAACCGCGTCTTCATCTTTGTCGTTGAGGAACGTCACATATACTTTGGCATACGCCAGGTCGCGAGACATTTCGACACCGGAAACGGTGGTCATCATGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAggg < 2:162452/273‑1 (MQ=255) tGCCCGCTTTAACCGCGTCTTCATCTTTGTCGTTGAGGAACGTCACATATACTTTGGCATACGCCAGGTCGCGAGACATTTCGACACCGGAAACGGTGGTCATCATGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGtt < 4:192900/275‑1 (MQ=255) cgtttaCCGCGTCTTCATCTTTGTCGTTTAGGAACGTCACATATACTTTGGCCTACGCCAGGTCGCGAGACATTTCGACACCGGAAACGGGTGTTATCATGCCCAGGCGAGGATCGTTAATTTCACGCGGCAGGAGGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGtt < 4:128722/270‑1 (MQ=255) cTTTAACCGCGTCTTCATCTTTGTCGTTGAGGAACGTCACATATACTTTGGCATACGCCAGGTCGCGAGACATTTCGACACCGGAAACGGTGGTCATCATGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGtt < 2:518510/275‑1 (MQ=255) atttAACGGCGCTTTCATCTTTGTCGTTGAGGAACGTAACATATACTTTGGCATACGCAAGGTGGGGGGACATTTCGACACCGGAAACGGTGGTCATCATGCCCAGGCGGAGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGtt < 4:564212/274‑1 (MQ=255) tCTTCATCTTTGTCGTTGAGGAACGTCACATATACTTTGGCATACGCCAGGTCGCGAGACATTTCGACACCGGAAACGGTGGTCATCATGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATaa > 4:302277/1‑274 (MQ=255) aCTTTGGCATACGCCAGGTCGCGAGACATTTCGACACCGGAAACGGTGGTCATCATGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAaat > 4:515200/1‑202 (MQ=255) ttGGCATACGCCAGGTCGCGAGACATTTCGACACCGGAAACGGTGGTCATCATGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCAATAATAAATTCCCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACTTGATATGACGCGCCAGCG‑TCCCATCAGGCAATCAATGCCGGa > 2:175443/1‑274 (MQ=255) 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2:760389/135‑1 (MQ=255) ttttGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGa < 2:223367/275‑1 (MQ=255) gCATTTCCTGCGCTACGAGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGAcgt < 4:674730/274‑1 (MQ=255) cATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATaa > 8:819483/1‑131 (MQ=255) cATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑Tcaca > 6:829866/1‑148 (MQ=255) tttCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATc > 5:99872/1‑148 (MQ=255) ttCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAg < 8:725349/149‑1 (MQ=255) ccTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTa < 2:147863/275‑1 (MQ=255) tGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCa < 5:242753/148‑1 (MQ=255) ctactcgtggCGGGTGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGTTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGAGAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCTTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCtt < 4:163612/266‑1 (MQ=255) tACGGGGTGCGGGCGGCCAAATTCTTTCGACATAATAAATTCCCCTGACAAAACAGGGGCTGTTAACCCCCTTTTAAAATGCATTTCAGGTGGAAGGGCTATTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGGATGGAACCCTAAAACCCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTa < 4:175442/275‑1 (MQ=255) cgcTTCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAAGTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTAACGc < 2:277557/275‑1 (MQ=255) gcTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCg < 6:419849/148‑1 (MQ=255) tGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCa > 1:53846/1‑136 (MQ=255) gCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGc < 7:223771/149‑1 (MQ=255) cAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTTACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTaaa > 7:348986/1‑149 (MQ=255) cAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGa < 7:511137/94‑1 (MQ=255) ttCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTa > 6:637839/1‑148 (MQ=255) 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< 5:560583/135‑1 (MQ=255) cATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTaa < 3:102923/135‑1 (MQ=255) aataaATTCGCCTGACAAAAAAGGGGATGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGTTTGAAGAGCTGTTCACGTTGACCTGCTAAGACGCGTCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGAATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGCTCTCGATGANTGCGACTACTNCGCTNACATCCCNAgan > 4:767175/1‑219 (MQ=255) aaaTTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGa > 5:207043/1‑148 (MQ=255) aaTTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGa < 2:767177/221‑1 (MQ=255) ttCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGAATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAAccc < 7:673405/149‑1 (MQ=255) tcCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGa < 7:420598/79‑1 (MQ=255) tcCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGa > 8:420598/1‑79 (MQ=255) cTGACANAAAANGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAANTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCa < 4:724746/159‑1 (MQ=255) gACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTaaaaa > 5:828324/1‑148 (MQ=255) aCAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAAc > 6:790173/1‑148 (MQ=255) cAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAAGTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCg < 4:208602/191‑1 (MQ=255) aaaaaGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGaa > 6:277281/1‑45 (MQ=255) aaaaaGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTa > 8:483900/1‑149 (MQ=255) aaaaGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTaa < 7:627208/149‑1 (MQ=255) aaaaGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGCGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGCCAATCCATGCTGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTa > 6:574373/1‑148 (MQ=255) aaGGGGCTAACAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACCTCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAg > 5:263376/1‑148 (MQ=255) aaGGGGCTAACAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAg > 5:906704/1‑148 (MQ=255) ttAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTAACGCCGATACCACATTCCATACCGTTACGGACTTCGTTAACGTCATCTTTGAAGCGGCGCa > 2:478833/1‑274 (MQ=255) | GCTGCGGATGAAACCAGAAGCTTCTTGCAACGCTTTGATGCCCGCTTTAACCGCGTCTTCATCTTTGTCGTTGAGGAACGTCACATATACTTTGGCATACGCCAGGTCGCGAGACATTTCGACACCGGAAACGGTGGTCATCATGCCCAGGCGAGGATCTTTAATTTCACGCTGCAGGATGAGAGCGATCTCTTTTTGCATTTCCTGCGCTACGCGCTGCGGGCGACCAAATTCTTTCGCCATAATAAATTCTCCTGACAAAAAAGGGGCTGTTAGCCCCTTTTTAAAATTAATTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCG‑TCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTAACGCCGATACCACATTCCATACCGTTACGGACTTCGTTAACGTCATCTTTGAAGCGGCGCA > NC_000913/3312936‑3313481 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |