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gTAGAAGTGATTTGGTGGCAGAACGCTTAAATCGTGGCGTCCTGGAACGAAAAACGGATCTCCGTGGAGGTCCGTGTATATGATTTTGGTGCCCGGACTCAGAATCGAACCAAGGACACGGGGATTTTCAATcct < 2:487433/135‑2 (MQ=37) ttGATTTGGAGGCAGAACGCTTAAATCGTGGCGTCCTGAAACGAAAAACGGACCTCCGTGGAGGTCCGTTTATATGAATTTGGTGCCCGGACTCGGAATCGAACCAAGGACACGGGGATTTTCAATCCCCTGCTCTACCGACTg < 5:581390/144‑1 (MQ=255) ttGATTTGGAGGCAGAACGCTTAAATCGTGGCGTCCTGAAACGAAAAACGGACCTCCGTGGAGGTCCGTTTATATGAATTTGGTGCCCGGACTCGGAATCGAACCAAGGACACGGGGATTTTCAATCCCCTGCTCTACCGACTg > 6:581390/1‑144 (MQ=255) ttGATTTGGAGGCAGAACGCTTAAATCGTGGCGTCCTGAAACGAAAAACGGACCTCCGTGGAGGTCCGTTTATATGAATTTGGTGCCCGGACTCGGAATCGAACCAAGGACACGGGGATTTTCAATCCCCTGCTCTACCGACTGAGCTa > 7:666379/1‑149 (MQ=255) aGGCAGAACGCTTAAATCGTGGCGTCCTGAAACGAAAAACGGACCTCCGTGGAGGTCCGTTTATATGAATTTGGTGCCCGGACTCGGAATCGAACCAAGGACACGGGGATTTTCaa > 4:341509/1‑116 (MQ=255) aGGCAGAACGCTTAAATCGTGGCGTCCTGAAACGAAAAACGGACCTCCGTGGAGGTCCGTTTATATGAATTTGGTGCCCGGACTCGGAATCGAACCAAGGACACGGGGATTTTCa < 2:115089/115‑1 (MQ=255) ggCAGAACGCTTAAATCGTGGCGTCCTGAAACGAAAAACGGACCTCCGTGGAGGTCCGTTTATATGAATTTGGTGCCCGGACTCGGAATCGAACCAAGGACACGGGGAtttt > 7:349277/1‑112 (MQ=255) cAGAACGCTTAAATCGTGGCGTCCTGAAACGAAAAACGGACCTCCGTGGAGGTCCGTTTATATGAATTTGGTGCCCGGACTCGGAATCGAACCAAGGACACGGGGATTTTCAATCCCCTGCTCTACCGACTGAGCTATCCGGGCAACgg < 8:659940/149‑1 (MQ=255) aGAACGCTTAAATCGTGGCGTCCTGAAACGAAAAACGGACCTCCGTGGAGGTCCGTTTATATGAATTTGGTGCCCGGACTCGGAATCGAACCAAGGACACGGGGATTTTCAATccc < 2:341511/116‑1 (MQ=255) aGAACGCTTAAATCGTGGCGTCCTGAAACGAAAAACGGACCTCCGTGGAGGTCCGTTTATATGAATTTGGTGCCCGGACTCGGAATCGAACCAAGGACACGGGGATTTTCAATCCCCTGCTCTACCGACTGAGCTATCCGGGCAACgg < 5:521608/148‑1 (MQ=255) aTCGTGGCGTCCTGAAACGAAAAACGGACCTCCGTGGAGGTCCGTTTATATGAATTTGGTGCCCGGACTCGGAATCGAACCaa > 7:448431/1‑83 (MQ=255) aTCGTGGCGTCCTGAAACGAAAAACGGACCTCCGTGGAGGTCCGTTTATATGAATTTGGTGCCCGGACTCGGAATCGAACCaa < 8:448431/83‑1 (MQ=255) tCGTGGCGTCCTGAAACGAAAAACGGACCTCCGTGGAGGTCCGTTTATATGAATTTGGTGCCCGGACTCGGAATCGAACCAAGGACACGGGGATTTTCAATCCCCTGCTCTACCGACTGAGCTATCCGGGCAACGGGGCGCATTAAAc < 6:896952/148‑1 (MQ=255) gCGTCCTGAAACGAAAAACGGACCTCCGTGGAGGTCCGTTTATATGAATTTGGTGCCCGGACTCGGAATCGAACCAAGGACACGGGGATTTTCAATCCCCTGCTCTACCGACTGAGCTATCCGGGCAACGGGGCGCATTAAACCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCCAATTTCAGTAAACGCGATTCAACTGCTTAAGATTGCGGCAAATCGCTTCTTTTCTGTGTTTCTGTCAGGTCAATGCACCACCCTGGCGGCAGCGGGCGAAGCGCAg > 4:194340/1‑274 (MQ=255) cGTCCTGAAACGAAAAACGGACCTCCGTGGAGGTCCGTTTATATGAATTTGGTGCCCGGACTCGGAATCGAACCAAGGACACGGGGATTTTCAATCCCCTGCTCTACCGACTGAGCTATCCGGGCAACGGGGCGCATTAAACCGTAATc < 8:666379/149‑1 (MQ=255) tCCTGAAACGAAAAACGGACCTCCGTGGAGGTCCGTTTATATGAATTTGGTGCCCGGACTCGGAATCGAACCAAGGACACGGGGATTTTCAATCCCCTGCTCTACCGACTGAGCTATCCGGGCAACGGGGCGCATTAAACCGTAATCt > 5:552721/1‑148 (MQ=255) tGAAACGAAAAACGGACCTCCGTGGAGGTCCGTTTATATGAATTTGGTGCCCGGACTCGGAATCGAACCAAGGACACGGGGATTTTCAATCCCCTGCTCTACCGACTGAGCTATCCGGGCAACGGGGCGCATTAAACCGTAATCTGcac > 7:283259/1‑149 (MQ=255) 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aaaCGGACCTCCGTGGAGGTCCGTTTATATGAATTTGGTGCCCGGACTCGGAATCGAACCAAGGACACGGGGATTTTCAATCCCCTGCTCTACCGACTGAGCTATCCGGGCAACGGGgcg > 4:38204/1‑120 (MQ=255) aaCGGACCTCCGTGGAGGTCCGTTTATATGAATTTGGTGCCCGGACTCGGAATCGAACCAAGGACACGGGGATTTTCAATCCCCTGCTCTACCGACTg < 6:695116/98‑1 (MQ=255) aaCGGACCTCCGTGGAGGTCCGTTTATATGAATTTGGTGCCCGGACTCGGAATCGAACCAAGGACACGGGGATTTTCAATCCCCTGCTCTACCGACTGAGCTATCCGGGCAACGGGGCGCATTAAACCGTAATCTGCACATCTCGTCaa > 8:287144/1‑149 (MQ=255) aaCGGACCTCCGTGGAGGTCCGTTTATATGAATTTGGTGCCCGGACTCGGAATCGAACCAAGGACACGGGGATTTTCAATCCCCTGCTCTACCGACTGAGCTATCCGGGCAACGGGGCGCATTAAACCGTAATCTGCACATCTCGTCa < 6:302910/148‑1 (MQ=255) aaCGGACCTCCACGGAGGTCCGTTTATATGAATTTGGTGCCCGGACTCGGAATCGAACCAAGGACACGGGGATTTTCAATCCCCTGCTCTACCGACTGa < 8:788589/99‑1 (MQ=255) aaCGGACCTCCACGGAGGTCCGTTTATATGAATTTGGTGCCCGGACTCGGAATCGAACCAAGGACACGGGGATTTTCAATCCCCTGCTCTACCGACTGa > 7:788589/1‑99 (MQ=255) aCGGACCTCCACGGAGGTCCGTTTATATGAATTTGGTGCCCGGACTCGGAATCGAACCAAGGACACGGGGATTTTCAATCCCCTGCTCTACCGACTGAGCTATCCGGGCAACGGGGCGCATTAAACCGTAATCTGCACATCTCGTCaa > 6:377220/1‑148 (MQ=255) cGGACCTCCACGGAGGTCCGTTTATATGAATTTGGTGCCCGGACTCGGAATCGAACCAAGGACACGGGGATTTTCAATCCCCTGCTCTACCGACTGAGCTATCCGGGCAACGGGGCGCATTAAACCGTAATCTGCACATCTCGTCAAc > 6:289945/1‑148 (MQ=255) ggACCTCCGTGGAGGTCCGTTTATATGAATTTGGTGCCCGGACTCGGAATCGAACCAAGGACACGGGGATTTTCAATCCCCTGCTCTACCGACTGAGCTATCCGGGCAACGGGGCGCAtt < 2:38205/120‑1 (MQ=255) gACCTCCACGGAGGTCCGTTTATATGAATTTGGTGCCCGGACTCGGAATCGAACCAAGGACACGGGGATTTTCAATCCCCTGCTCTACCGACTg > 6:73874/1‑94 (MQ=255) gACCTCCACGGAGGTCCGTTTATATGAATTTGGTGCCCGGACTCGGAATCGAACCAAGGACACGGGGATTTTCAATCCCCTGCTCTACCGACTg < 5:73874/94‑1 (MQ=255) cTCCGTGGAGGTCCGTTTATATGAATTTGGTGCCCGGACTCGGAATCGAACCAAGGACACgg > 7:712961/1‑62 (MQ=255) cGTGGAGGTCCGTTTATATGAATTTGGTGCCCGGACTCGGAATCGAACCAAGGACACGGGGATTTTCAATCCCCTGCTCTACCGACTGAGCTATCCGGGCAACGGGGCGCATTAAACCGTAATCTGCACATCTCGTCAAcc > 4:393363/1‑141 (MQ=255) gTGGAGGTCCGTTTATATGAATTTGGTGCCCGGACTCGGAATCGAACCAAGGACACGGGGATTTTCAATCCCCTGCTCTACCGACTGAGCTATCCGGGCAACGGGGCGCATTaaa > 8:113739/1‑115 (MQ=255) gTGGAGGTCCGTTTATATGAATTTGGTGCCCGGACTCGGAATCGAACCAAGGACACGGGGATTTTCAATCCCCTGCTCTACCGACTGAGCTATCCGGGCAACGGGGCGCATTaaa < 7:113739/115‑1 (MQ=255) | AGAAAATCTCATCAGTCGCCGTTCAGACCGGTGTTGTGCTTTATGGATGCGTTACGCTCCTGATGACGTCATTTGACGTTCAACAGCATCACGGGGCCGCACGACATTTCACGTCAGTTAGTGCTATAGCTCAGGAACAAATTTTCCCGAATTGGGATATGCCCGCAAATTGCTGGTGATGTGGGGAGAATCTGGTTGAGTTCGGTAGAATTGATTTGGAGGCAGAACGCTTAAATCGTGGCGTCCTGAAACGAAAAACGGACCTCCGTGGAGGTCCGTTTATATGAATTTGGTGCCCGGACTCGGAATCGAACCAAGGACACGGGGATTTTCAATCCCCTGCTCTACCGACTGAGCTATCCGGGCAACGGGGCGCATTAAACCGTAATCTGCACATCTCGTCAACCTAATTTCAGTAAAAGCGATTCAACTGCTTAAGATTGCGGCAAATCGCTTCTTTTCTGTGTTTCTGTCAGGTCAATGCACCACCCTGGCGGCAGCGGGCGAAGCGCAGGATATCTTCCGCCA > NC_000913/4362261‑4362788 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |