| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 438160 = | 98 (0.990) | 7 (0.070) | 7/252 | NT | 7.2% | intergenic (‑25/+155) | yajO/dxs | 2‑carboxybenzaldehyde reductase/1‑deoxyxylulose‑5‑phosphate synthase, thiamine triphosphate‑binding, FAD‑requiring |
| ? | NC_000913 | 438267 = | 85 (0.880) | intergenic (‑132/+48) | yajO/dxs | 2‑carboxybenzaldehyde reductase/1‑deoxyxylulose‑5‑phosphate synthase, thiamine triphosphate‑binding, FAD‑requiring | |||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
AGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATTTCTTCCTGAGTTCCTTGCGGAATAAAGAAGTCC > NC_000913/438120‑438414 | aGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAattatt < 2:430952/148‑1 (MQ=255) ggggTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTAttt > 2:34206/1‑148 (MQ=255) ggggTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTa < 4:418790/149‑1 (MQ=255) cactcctgctatgcttaagaaattattcatagactctaaATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTAttt > 2:154839‑M1/40‑148 (MQ=255) ggTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTaga < 3:4406/149‑1 (MQ=255) gTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTagag > 3:119878/1‑149 (MQ=255) tGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGt > 2:260326/1‑148 (MQ=255) gTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCt < 4:477775/149‑1 (MQ=255) gctatgcttaagaaattattcatagactctaaATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTa > 4:833158‑M1/33‑149 (MQ=255) aTTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCGTACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGACTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCTGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTa < 1:260326/148‑1 (MQ=255) ttGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTagag < 4:816404/143‑1 (MQ=255) tgctgcCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGaata > 2:674895/1‑148 (MQ=255) ctgcCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGaataat < 2:434677/148‑1 (MQ=255) gcCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAAttt > 1:857706/1‑148 (MQ=255) 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tCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAg < 4:314863/149‑1 (MQ=255) ccTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGc < 3:829141/149‑1 (MQ=255) tGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCAt > 3:824616/1‑149 (MQ=255) gCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATa < 4:119878/149‑1 (MQ=255) tagactctaaataattcgagttgcaggaaggcggcaaacgagtgaagccccaggagcttacataagtaagtgactggggtgaacgaatgcagccgcagcacatgcaacttgaagtatTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGc > 4:833158‑M2/118‑149 (MQ=255) 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cATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAggagtgg < 1:288699/148‑1 (MQ=255) ATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCa < 4:581845‑M1/140‑1 (MQ=255) ATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCa > 3:581845‑M1/1‑140 (MQ=255) taattcgagttgcaggaaggcggcaaacgagtgaagccccaggagcttacataagtaagtgactggggtgaacgaatgcagccgcagcacatgcaacttgaagtatTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAggagtggag > 1:842764‑M2/107‑148 (MQ=255) ttCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTGTGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAgg > 3:214738/1‑149 (MQ=255) 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ttGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCt > 2:199272/1‑103 (MQ=255) ttGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATTTCTTcc > 1:747525/1‑148 (MQ=255) gccgccTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATTTCTTCCTGa < 4:543140/149‑1 (MQ=255) cgccTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATTTCTTCCTGAGt > 3:619009/1‑149 (MQ=255) gccTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATTTCTTCCTGAGt < 2:372252/148‑1 (MQ=255) cTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATTTCTTCCTGAGTTcc < 4:214738/149‑1 (MQ=255) cTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATTTCTTCCTGAGTTcc > 3:383028/1‑149 (MQ=255) cTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATTTCTTCCTGAGTTCCTTg < 2:219424/148‑1 (MQ=255) aCTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATTTCTTCCTGAGTTCCTTGCGGAAt > 3:698854/1‑149 (MQ=255) cTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATTTCTTCCTGAGTTCCTTGCGGAAt > 2:133677/1‑148 (MQ=255) tCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATTTCTTCCTGAGTTCCtt < 4:261049/140‑1 (MQ=255) tCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATTTCTTCCTGAGTTCCtt > 3:261049/1‑140 (MQ=255) tCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATTTCTTCCTGAGTTCCTTGCGGAATa > 2:242010/1‑148 (MQ=255) cGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATTTCTTCCTGAGTTCCTTGCGGAATaa > 1:75875/1‑148 (MQ=255) aaTTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCAttt > 2:604139/1‑122 (MQ=255) aaTTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCAttt < 1:604139/122‑1 (MQ=255) aaTTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATTTCTTCCTGAGTTCCTTGCGGAATAaaga > 3:747095/1‑149 (MQ=255) aaTTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATTTCTTCCTGAGTTCCTTGCGGAATAaaga < 4:23949/149‑1 (MQ=255) attattTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATTTCTTCCTGAGTTCCTTGCGGAATAaagaa < 4:81007/149‑1 (MQ=255) attattTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATTTCTTCCTGAGTTCCTTGCGGAATAaaga < 1:188992/148‑1 (MQ=255) atTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATTTCTTCCTGAGTTCCTTGCGGAATAAAGAAGTc < 4:824616‑M2/147‑1 (MQ=255) atTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATTTCTTCCTGAGTTCCTTGCGGAATAAAGAAGTc < 3:467312‑M2/147‑1 (MQ=255) | AGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTATGCCAGCCAGGCCTTGATTTTGGCTTCCATACCAGCGGCATCGAGGCCGAGTTCGGCGCGCATTTCTTCCTGAGTTCCTTGCGGAATAAAGAAGTCC > NC_000913/438120‑438414 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |