| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3621553 | NA (NA) | 4 (0.040) | 4/244 | NT | 100% | coding (2362/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | NC_000913 | = 3621603 | 0 (0.000) | coding (2412/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
AGACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGGGGCTGGCGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGGCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGCTGTCT > NC_000913/3621455‑3621750 | aGACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGGGGCTGGCGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGC > 4:8910‑M2/1‑149 (MQ=255)aGACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGGGGCTGGCGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGC > 3:709181‑M2/1‑149 (MQ=255) gACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGGGGCTGGCGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGC < 1:544460‑M2/148‑1 (MQ=255) gACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGGGGCTGGCGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGC > 2:87368‑M2/1‑148 (MQ=255) aCCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCtgtccggtatacagcggttcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagt > 3:71418‑M2/1‑58 (MQ=255) aCCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCtgtccggtatacagcggttcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagt < 4:71418‑M2/129‑72 (MQ=255) aCAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCtgtccggtatacagcggttcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttc < 2:360269‑M2/129‑77 (MQ=255) aCAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCtgtccggtatacagcggttcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttc > 1:360269‑M2/1‑53 (MQ=255) ggCAGGCtgtccggtatacagcggttcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaat < 2:368103‑M2/148‑142 (MQ=255) gCAGGCtgtccggtatacagcggttcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgc < 4:33085‑M2/149‑144 (MQ=255) cAGGCtgtccggtatacagcggttcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgc > 2:910954‑M2/1‑5 (MQ=255) aGGCtgtccggtatacagcggttcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcac > 4:16607‑M2/1‑4 (MQ=255) aGGCtgtccggtatacagcggttcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcac > 4:226967‑M2/1‑4 (MQ=255) aGGCtgtccggtatacagcggttcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcac > 4:313744‑M2/1‑4 (MQ=255) aGGCtgtccggtatacagcggttcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcac > 4:630888‑M2/1‑4 (MQ=255) aGGCtgtccggtatacagcggttcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgca > 1:696664‑M2/1‑4 (MQ=255) ggCtgtccggtatacagcggttcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcacc > 4:62605‑M2/1‑3 (MQ=255) gCtgtccggtatacagcggttcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccg < 3:190805‑M2/149‑148 (MQ=255) gCtgtccggtatacagcggttcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccg > 3:596911‑M2/1‑2 (MQ=255) gCtgtccggtatacagcggttcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccg < 3:750660‑M2/149‑148 (MQ=255) gCtgtccggtatacagcggttcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccg < 4:596911‑M2/149‑148 (MQ=255) gCtgtccggtatacagcggttcgccagcccctgcgcgttgtacgcatgtctggtctcatgctgccagagcagtgcttccgtctgcgggtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcacc > 1:489623‑M2/1‑2 (MQ=255) | AGACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGGGGCTGGCGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGGCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCCTGCTGTCT > NC_000913/3621455‑3621750 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |