| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3808942 | 296 (2.990) | 3 (0.030) | 3/250 | NT | 1.1% | coding (403/1278 nt) | waaA | 3‑deoxy‑D‑manno‑octulosonic‑acid transferase (KDO transferase) |
| ? | NC_000913 | = 3809028 | 259 (2.700) | coding (489/1278 nt) | waaA | 3‑deoxy‑D‑manno‑octulosonic‑acid transferase (KDO transferase) | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 311 total aligned reads displayed.
TCAACCGTTTCCTGAATAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTG > NC_000913/3808880‑3809176 | aaCCGTTTCCTGAATAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGTGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATgc > 3:571915‑M2/1‑147 (MQ=255) ccGTTTCCTGAATAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATgcc < 2:534718‑M2/148‑4 (MQ=255) cGTTTCCTGAATAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGAAAATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATgcca < 2:882664‑M2/148‑5 (MQ=255) tttCCTGAATAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCaaa > 1:32631/1‑148 (MQ=255) ttCCTGAATAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAAc < 1:641833/148‑1 (MQ=255) ttCCTGAATAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAAc < 1:548200/148‑1 (MQ=255) ttCCTGAATAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACt < 3:369527/149‑1 (MQ=255) tCCTAAATAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTg < 3:128817/149‑1 (MQ=255) ccTGAATAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTgg < 3:93053/149‑1 (MQ=255) cTGAATAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTggg > 3:76711/1‑149 (MQ=255) tGAATAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTggg > 2:297897/1‑148 (MQ=255) tGAATAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGt > 4:213726/1‑149 (MQ=255) gAATAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGt > 2:449750/1‑148 (MQ=255) gAATAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTa > 3:171775/1‑149 (MQ=255) aTAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTaaa > 4:120741/1‑149 (MQ=255) cGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTcgtc < 1:834482/148‑1 (MQ=255) gACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTcgtccg > 4:698909/1‑149 (MQ=255) aCCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTcgtccgt > 4:807764/1‑149 (MQ=255) aCTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATg < 2:76476‑M2/119‑2 (MQ=255) aCTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATg > 1:76476‑M2/1‑118 (MQ=255) aCTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTtgc < 3:199850/149‑1 (MQ=255) gtTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAAGTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGcgtc < 3:444989/149‑1 (MQ=255) gATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGcgtcgt < 1:191760/148‑1 (MQ=255) ttATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGTCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTGTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTAt > 1:499647/1‑148 (MQ=255) aTGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTa < 2:456645/148‑1 (MQ=255) tGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACg < 4:758305/149‑1 (MQ=255) gAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGcgtcgt < 2:562910/141‑1 (MQ=255) gAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGc > 2:667307/1‑148 (MQ=255) gAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGc > 1:234035/1‑148 (MQ=255) gAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCt < 4:592808/149‑1 (MQ=255) gAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCt > 4:249904/1‑149 (MQ=255) gAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCt > 3:723607/1‑149 (MQ=255) aCCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGAt < 4:156555/149‑1 (MQ=255) ccGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGAt < 1:742697/148‑1 (MQ=255) gAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATtg > 1:708850/1‑148 (MQ=255) aCTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATtgct > 2:633077/1‑148 (MQ=255) aTGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATgccatagttcggtttccataatcaacaccagtttagggtcgactttattcaggaaac < 2:459131‑M2/148‑58 (MQ=255) gCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATgccatagttcggtttccataatcaacaccagtttagggtcgactttattcag < 4:54286‑M2/140‑53 (MQ=255) cTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAAt > 3:641897/1‑149 (MQ=255) tAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATg > 4:792034/1‑149 (MQ=255) aCCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATgaa < 3:249904/149‑1 (MQ=255) aCCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATga < 2:170934/148‑1 (MQ=255) aCCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATga < 1:532756/148‑1 (MQ=255) aCCGGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCACAAAATgaa > 4:468772/1‑149 (MQ=255) ccTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATgaa > 2:346403/1‑148 (MQ=255) ccTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATgaa < 1:346403/148‑1 (MQ=255) cTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCt < 3:454393/128‑1 (MQ=255) tGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCaaa > 2:846806/1‑141 (MQ=255) tGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCaaa < 1:846806/141‑1 (MQ=255) tGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATgaagaa < 3:826767/149‑1 (MQ=255) tGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATgaagaa < 3:214387/149‑1 (MQ=255) gATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATgaagaa > 1:887784/1‑148 (MQ=255) aTTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAagaaga < 4:641897/149‑1 (MQ=255) tGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGAt < 2:42536/148‑1 (MQ=255) tGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATg < 4:600175/149‑1 (MQ=255) ggcggcgCTACATAAACGTACAATTCCGCTGGTGATCGCTAACCCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATAACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGAt < 1:47203/147‑1 (MQ=255) ggcgCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTg < 3:693123/149‑1 (MQ=255) aCATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGt > 2:523988/1‑148 (MQ=255) cATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGttt < 4:692379/149‑1 (MQ=255) aTAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGtttt > 4:813954/1‑149 (MQ=255) tAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGtttt > 1:130467/1‑148 (MQ=255) aaaCGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTtgt < 4:433932/149‑1 (MQ=255) aaaCGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTtg < 1:528134/148‑1 (MQ=255) gTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATgaag < 3:804744/126‑1 (MQ=255) gTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTtgt > 4:834655/1‑145 (MQ=255) tAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGgcgc > 3:431401/1‑149 (MQ=255) tAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGgcg < 1:375897/148‑1 (MQ=255) aTTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGAt < 3:411368/104‑1 (MQ=255) aTTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGAt > 4:411368/1‑104 (MQ=255) ttCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCaa < 1:421853/58‑1 (MQ=255) gATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAaat > 2:130917/1‑148 (MQ=255) gATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATGCGTCCGACGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAaat < 1:449750/148‑1 (MQ=255) aTCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAaataa < 3:158473/149‑1 (MQ=255) cGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATc < 4:329586/149‑1 (MQ=255) cTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAg < 3:792034/149‑1 (MQ=255) aaCGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAgg < 2:687522/148‑1 (MQ=255) gcgcgACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGTGAc > 3:283084/1‑149 (MQ=255) cgACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGTGACCg > 1:152244/1‑148 (MQ=255) gACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGTGACCGtt > 4:372611/1‑149 (MQ=255) aCTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGTGACCGtt > 2:413370/1‑148 (MQ=255) aCTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGTGACCGtt > 2:385585/1‑148 (MQ=255) ctctctGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGTGACCGTTa < 2:705015/148‑1 (MQ=255) tctctGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAAt > 3:858792/1‑89 (MQ=255) tctctGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAAt < 4:858792/89‑1 (MQ=255) ctGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGTGACCGTTACCgg > 1:287773/1‑148 (MQ=255) ctGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGTGACCGTTACCgg > 2:22877/1‑148 (MQ=255) ccGCTCGGCCGCAGGTTATGTCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGcc > 4:446661/1‑149 (MQ=255) ccGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGcc > 3:499524/1‑149 (MQ=255) cGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGCTACCGGTAACGGtcacc < 1:669352/148‑5 (MQ=255) gCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGCAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCt > 2:798424/1‑148 (MQ=255) cTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTg > 1:105919/1‑148 (MQ=255) cGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGaa < 1:96217/148‑1 (MQ=255) cGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATgaa < 4:216605/76‑1 (MQ=255) gCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCg < 1:597727/148‑1 (MQ=255) gCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCg < 2:812493/148‑1 (MQ=255) gCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGa < 3:61893/149‑1 (MQ=255) gTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCaaaa > 3:597779/1‑67 (MQ=255) gTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGt < 3:816216/118‑1 (MQ=255) aTGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTc < 2:738068/148‑1 (MQ=255) aTGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCt < 3:882858/149‑1 (MQ=255) | TCAACCGTTTCCTGAATAAAGTCGACCCTAAACTGGTGTTGATTATGGAAACCGAACTATGGCCTAACCTGATTGCGGCGCTACATAAACGTAAAATTCCGCTGGTGATCGCTAACGCGCGACTCTCTGCCCGCTCGGCCGCAGGTTATGCCAAACTGGGTAAATTCGTCCGTCGCTTGCTGCGTCGTATTACGCTGATTGCTGCGCAAAATGAAGAAGATGGTGCACGTTTTGTGGCGCTGGGCGCAAAAAATAATCAGGTGACCGTTACCGGTAGCCTGAAATTCGATATTTCTG > NC_000913/3808880‑3809176 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |