| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 1,827,811 | T→G | 7.5% | K150T (AAA→ACA) | astB ← | succinylarginine dihydrolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,827,811 | 0 | T | G | 7.5% | 362.4 / 20.4 | 106 | K150T (AAA→ACA) | astB | succinylarginine dihydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (54/44); new base G (5/3); total (59/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.32e-01 | |||||||||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
TCTCGCCCGTAGACAAAAAGTTGCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGGCAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGAAGCGGAACT > NC_000913/1827664‑1827959 | tctcGCCCGTAGACAAAAAGTTGCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCttt < 4:101307/149‑1 (MQ=255) ctcGCCCGTAGACAAAAAGTTGCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCttt < 1:449291/148‑1 (MQ=255) cGCCCGTAGACAAAAAGTTGCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTa > 1:124325/1‑148 (MQ=255) 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1:660786/1‑148 (MQ=255) tcgtTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGGCAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCcaca < 1:902577/148‑1 (MQ=255) gtTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGGCAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTg < 3:794712/149‑1 (MQ=255) ttAAAGATCGCTTTTAACAGCGATTCGGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATGCTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGGCAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTgg > 4:574029/1‑149 (MQ=255) ttAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGGCAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTgg > 3:312469/1‑149 (MQ=255) tgaaTCGCTGTTAAAAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGGCAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGa > 3:728565/3‑149 (MQ=255) gaaTCGCTGTTAAAAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGGCAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGa > 1:605232/2‑148 (MQ=255) aaTCGCTGTTAAAAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGGCAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGaa > 1:102787/1‑148 (MQ=255) aaTCGCTGTTAAAAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGGCAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGAAg > 3:672684/1‑149 (MQ=255) aTCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGGCAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGAAGc < 4:59703/149‑1 (MQ=255) aTCGCTGTTAAAAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGGCAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGAAGc < 4:728565/149‑1 (MQ=255) tCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGGCAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGaa < 4:246357/146‑1 (MQ=255) tCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGGCAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGaa > 3:246357/1‑146 (MQ=255) ttttAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGGCAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGAAGCGGAAc > 4:397029/1‑149 (MQ=255) ttttAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGGCAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGAAGCGGAAc > 3:229227/1‑149 (MQ=255) tttAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGGCAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGAAGCGGAAc > 1:547541/1‑148 (MQ=255) | TCTCGCCCGTAGACAAAAAGTTGCATACCCGGTTCACCGTAATGACCGCCGAGACGATTGTGGTTTGCCGCCCCCTCATCACCGAGCAACGCTACCTGTGGCAACGCCGAATGGACGCTAAATTTCTCTTCGTCGTTAAAAATCGCTTTTAACAGCGATTCAGTGACGGGCGCTTCCAGCGAACGGTGAAATTTATTGTTCAGGTTGGCAACGGTGAGATGCACTTTGCCATCCAGCGTATCGGCAGATGGCGCGATCGTTGCCGCATTGGCTACCCACATTGGCGAAGCGGAACT > NC_000913/1827664‑1827959 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |