| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3246148 | 134 (0.830) | 17 (0.100) +GTGCA |
3/486 | 15.3 | 11.1% | coding (925/1299 nt) | exuT | hexuronate transporter |
| ? | NC_000913 | 3246149 = | 140 (0.840) | coding (926/1299 nt) | exuT | hexuronate transporter | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 158 total aligned reads displayed.
AATGTCCGTTGGTCAGATCCTGCGTAACCGTCAGTTCTGGGGTATCGCGCTGCCGCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGC‑‑‑TGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCAATTATGCTGCTGTGTATCGGTGGTTTTGCCCACCAGGCACTGTCTGGCGCGCTGATTACGCTCTCTTCCGATGTGTTTGGTCGTAACGAAGTGGCAACGGCAAACGGTTTAACCGGGATGTCCGCATGGCTGGCAAGTACGCTGTTTGCGCTGGTTGTCGGTGCACTGGCTGACACCATCGGCTTCAGCCCGCTGTTCGCAGTTCTGGCAGTGTTCGA > NC_000913/3245874‑3246425 | aaTGTCCGTTGGTCCGATCCTGCGTAACCGTCCGGTCTGGGGTATCGCGCTGCCGCGTGTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTg < 4:115285/278‑1 (MQ=255)aaTGTCCGTTGGTCAGTGCCTGCGTACCCGTCAGTTCTGGGGTATCGCGCTGCCGCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGTGGTACTTTTTACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTg < 2:496903/278‑1 (MQ=255)aaTGTCCGTTGGGCCGATCCTGCGTAACCGGCAGTTCTGGGGTATCGCGCTGCCGCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTg < 2:108979/278‑1 (MQ=255) aTGTCCGTTTGTCAGACCCTGGGTAACCGTCGATTCGGGGGTATCGCGCTGCCGCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGCTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTg < 2:151045/277‑1 (MQ=255) ttCCGTTGGTCGGTTCCTGCGGACCCGTCAGTTCTGTGGTGTCGCGTGGCCGCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGTGGTACTTTTACCGCATGGATCCCGCTGTTCATGTGTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATTGCGATGTTCGCCGGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCa < 4:667424/276‑1 (MQ=255) gTCCGTTGGTCAGATCCTGCGTAACCGTCAGTTCTGGGGTATCGCGCTGCCGCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCTCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGATTACCTGCCGTCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGTTTGGTGCAg > 2:140325/1‑278 (MQ=255) gTCCGTTGGTCAGATCCGGCGTCACCGTCAGTTCTGGGGTATCGCGCTGCCTCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTTAAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCAGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTg < 1:629030/275‑1 (MQ=255) ttGGTCGGATCCTGCGTAACCGTCAGTTCTGGGGTATCGCGCTGCCGCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTTCCGCTGCTGTTTCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCGGGGTGCAGTg > 1:499153/1‑275 (MQ=255) ggTCAGAGCCAGCGTAAACGTCAGTTCTGGGGTATCGCGCTGCCTCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGATTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGCTGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGC‑‑‑t < 1:131867/275‑1 (MQ=255) aGATCCTGCGTAACCGTCAGTTCTGGGGTATCGCGCTGCCGCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGAGATGTTCGCCTGGATGCCGCTGCTGTTTTCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCAGCGTCTGTTCCAGCGTTGGTGTGGTGTGACTCTTCTCGTTCCCTGTAAGGTGGTCGTAACGATGGGTGCAGTGC‑‑‑TGATGAtt > 4:180587/1‑278 (MQ=255) aTCCTGCGTAACCGTCAGTTCTGGGGTATCGCGCTGCCGCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGC‑‑‑Tgatgat < 1:211718/275‑1 (MQ=255) cattcGTAACCGTCAGTGCTTGGGTATCGCGCTGCCGTGTTTCCTGGCAGCACCGGCCTGAGGTACTTTGAACGCGTGGACTCCGCTGTTCATATTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGGTCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGC‑‑‑TGATGATTGGcc < 2:152216/274‑1 (MQ=255) gCGTAACCGTCAGTTCTGGGGTATCGCGCTGCCGCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCCGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATTGTCGTAACGCTggtt > 2:660174/1‑254 (MQ=255) gCGTAACCGTCAGTTCTGGGGTATCGCGCTGCCGCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGTTCGTAACGGTGGGTGGCGTGC‑‑‑GTATGATTGGcc > 3:692321/1‑275 (MQ=255) ctgaaCCGTGCGTTCTGGGGTATGCGGCTGCCGTGTTTCCTGGCGGATCCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTCAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGGTATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGC‑‑‑TGATGATTGGCCCggg < 4:269474/275‑1 (MQ=255) tCTGGGGTATCGGGCGGCCGCGGTTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGCGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGC‑‑‑TGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGc < 3:208148/275‑1 (MQ=255) tCTGGGGTATCGCGCGGCCGCGTTTCCTTGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTGTAACGCGTGGGTCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAAATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGC‑‑‑TGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGc < 1:777194/275‑1 (MQ=255) tCTGGGGTATCGCGCGGCCGCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGC‑‑‑TGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGc < 1:324408/275‑1 (MQ=255) gggTATCGCGCTGCCGCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGC‑‑‑TGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGt > 3:66523/1‑275 (MQ=255) gaTCGCGCTGCCGCGTTTCCTGGCAGAACCGGGCTGGGGTTCTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGGGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGC‑‑‑TGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCa < 1:772747/274‑1 (MQ=255) tCGCGCTGCCGCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTTGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTATGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGC‑‑‑TGATGATTGTCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCCCCaa > 2:56987/1‑277 (MQ=255) tCGCGCTGCCGCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGC‑‑‑TGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCAcc > 1:621192/1‑275 (MQ=255) tCGCGCTGCCGCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGC‑‑‑TGATGATGGGCCCGGGTTGGATCGGCCTGTTCAcc > 1:922496/1‑275 (MQ=255) tCGCGCTGCCGCGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGGCGTAACGCTGGGTGCGGTGC‑‑‑TGCTGATTGGCCCGGGGATGGTCGGCCttgtcccccac > 2:468752/1‑268 (MQ=255) gcgcTGCCGTGTTTCCTGGCAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGC‑‑‑TGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAAc < 2:187814/276‑1 (MQ=255) 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cAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGC‑‑‑TGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCAATTAtg < 1:87264/275‑1 (MQ=255) cAGAACCGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGC‑‑‑TGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCAATTAtg < 1:659415/275‑1 (MQ=255) ccGGCCTGGGGTACTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGC‑‑‑TGATGATTGGCCCGGGTTTGAGCGGCCTGTTCGCCCACCCGTTTGTCGCAAGTTggctgccggg > 2:525958/1‑274 (MQ=255) tgaggTTCTTGTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGTCTTTAACCTGAAAGGGATCGCGATGTTCGCCTGGACGCCGATGAGGTTTGCTGAGCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGGTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGC‑‑‑TGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCAATTATGCTGCTGTGTATCgg < 4:248373/275‑1 (MQ=255) cTTTTAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATCGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGTTGGTCGTAACGCTGGGTCCAGTGC‑‑‑TGATGATTGGCCCGGGTCTGATCGGCCTGTTCACCAACCCTTATTGCGCCATTATTCTGCTTTGTTTCggttgt > 3:423647/1‑275 (MQ=255) ttttAACGCGTGGATCCCGCTGTTCATGTTTAAAGTTTACGGCTTTAACCTGAAAGAGATTGCGATGTTCGCCTGGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTAGGTTGTATCCTCGGTGGTTACGTGACGCCGCTGTTCCAGCGTTGGGTTGGTGTGAACCTGTTCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGC‑‑‑TGATGGTTGGCCAGGGTATGATGGTCCTGTTCCCCACAACGAATGTCGCAATTGTCCTTCTGTGTAtgcgtcact > 3:48719/1‑267 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |