New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 3787895 = | 487 (2.920) | 4 (0.020) | 4/494 | 14.7 | 0.86% | coding (1058/1260 nt) | envC | activator of AmiB,C murein hydrolases, septal ring factor |
? | NC_000913 | = 3787891 | 458 (2.860) | coding (1054/1260 nt) | envC | activator of AmiB,C murein hydrolases, septal ring factor | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 491 total aligned reads displayed.
TTCGCGACCGCCAGAAAGAAGCGACGCGCAAAGGCACCACCTACAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTC‑TGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCAGAGCGCACTGGTGAGCGTTGGTTCGCAGGTTCGCGCGGGCCAGCCGATTGCACTGGTGGGCAGCAGTGGCGGTCAGGGTCGGCCTT‑CACTCTATTTCGAAATTCGCCGCCAGGGTCAGGCGGTCAATCCACAGCCGTGGTTGGGAAGATAAGTTTTGTTTCCATTTCGTCGTAACGTTCTTGCATTTGCCGCTCTGTTGGCGCTCTCCTCCCCCGTACTTGCTGG > NC_000913/3787619‑3788171 | tCGCGACCGCCAGAAAGAAGCGACGCGCAAAGGCACCACCTACAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTC‑TGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCCGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCCAAGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCGGCATGGCTACGGTCtggtg > 2:535788/1‑277 (MQ=255) tCGCGACCGCCAGAAAGAAGCGACGCGCAAAGGCACCACCTACAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTC‑TGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATAGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGAGTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTTCAAGGCTACGGGCgggtgg > 2:336889/1‑278 (MQ=255) gcgAACGCCAGAAAGGAGCGACGCGCAAAGGCACCACCTACAAACCGAACGAAAGGGAAAAATCGCTGATGCCCCGTGCCGGTGGTC‑GGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTATGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCtggtggt < 4:248805/277‑1 (MQ=255) gACCGCCAGAAAGAAGCGACGCGCAAAGGCACCACCTACAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTC‑TGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCtggtgg < 1:500927/274‑1 (MQ=255) ccGCCAGAAAGAAGCGACGCGCAAAGGCACCCCCTACAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTC‑TGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCtggtggtgg < 1:631348/275‑1 (MQ=255) ccAGAAAGAAGCGACGCGCAAAGGCACCACCTACAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTC‑TGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGGGGTTg > 2:381497/1‑278 (MQ=255) caaaaagacGCACCGCGCAAAGGCACCACCGACAAACCGACCGAAAGCGAAGAATCGCGGATGTCCCGTACCGGTGGTC‑TGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCtggtggtggtgg < 3:244090/271‑1 (MQ=255) agaaaaaaGCGACGCGCAAAGGCACCACCTACAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTC‑TGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGtt < 1:385849/275‑1 (MQ=255) aagaggCGACGCGCAAAGGCACCACCTACAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTC‑TGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAg < 1:864681/275‑1 (MQ=255) aagaagGGACCGCCAAAGGCCCCACCGACAAGCCTGCCGAGAGCGAAAAATCGCTGATGGCCCGTACCGGTGGTC‑TGGGCGCGCCGGGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAg < 1:890409/275‑1 (MQ=255) aagaagGGAAGCGCAAAGGCACCACCTACAAACCGACCGAAAGCGAAAAAGAGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTC‑TGGGCGCGCCGCGTGGTAAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAATTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAg < 3:350144/275‑1 (MQ=255) aagaagCGACGGGCAAAGGCACCACATACAAACCGGCCGAAAGCGAAAAAACGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTC‑TGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAg < 1:455024/275‑1 (MQ=255) aaaacacggagcgcAAAGGCACCACCGACAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTC‑TGGGCGCGCCGCGTGGTCCGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAg < 1:150006/265‑1 (MQ=255) agCGACGCGCAAAGGCACCACCTACAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTC‑TGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGCTCGCGGGCCGACGCTGCATCGATATGGCGCACAGCTACAGAGTGAATTATGCTGGAAAGGGATGGTTATCGGTGCTTATGAAGGTACTGAAGTTAAATCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTTGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGCTTGAGCATGGTa > 2:736077/1‑278 (MQ=255) gACGGGCAAAGGCACCACCTACAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTC‑TGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCGTTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTaaa < 2:396193/277‑1 (MQ=255) gACCCGCAAAGGCCCCACCCTCAAACCGACCAAAAGCGAAAAGTCGCTTGTGTCCCGTACCGGTGGCC‑GTGGCGCGCCGCGGGGTCAGGCCTTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTa < 3:766652/275‑1 (MQ=255) cgcgCAAAGGCACCACCTACAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTC‑TGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTaaa > 1:577195/1‑275 (MQ=255) cgcAAATGCACCACCGACAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTC‑TGGGGGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAgg < 2:428150/275‑1 (MQ=255) cgcAAAGGCACCACCTACAAACCGGCCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTC‑TGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAgg < 2:121420/275‑1 (MQ=255) cccacacaccacccgaccgaAAGCGAAGAAACGTGGATGTCGCAGACGGGGGTGC‑TGGGCGCGCTGCGGGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTGGCGGGCGGGCGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTAAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAGGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGAAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGa < 3:496157/262‑1 (MQ=255) cccaaaaaCCGACCGAAAGCGACAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTC‑TGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTa < 2:594621/272‑1 (MQ=255) catACAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTC‑TGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTa < 2:206324/275‑1 (MQ=255) 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aCAATCCGAACGAAAGCGAAAAAGCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTC‑TGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCGGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGc < 2:658154/278‑1 (MQ=255) cAAACCGACCGAAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTC‑TGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTCCGGCt > 2:283675/1‑278 (MQ=255) aaaCCGACCGAAGGAGAAAAATCGCGGATGTCCCGTACCGGTGGGC‑TGGGCGCGCCGCGTGTTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCt < 2:265122/277‑1 (MQ=255) accgaAAGCGAAAACTCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTC‑TGGGCGAGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCa < 2:504248/278‑1 (MQ=255) accgaAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTC‑TGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATTGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGGGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATaa > 1:300823/1‑275 (MQ=255) accgaAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTC‑TGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACCGGGTGAATTCCGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGAATGCCGACGGTAGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCGACGGGCGGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGGAAAGGGGACATGAGTCTTTGCGGcatgaa > 3:456716/1‑270 (MQ=255) accgaAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTC‑TGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTATGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGGCGGGTGATGCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCGGGTGGGGGTGGGTGAGCGTGGTAAAGGCGACATGAGTCGTTACGGATATAATCa > 2:177665/1‑278 (MQ=255) accgaAAGCGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTC‑TGGGCGCGCAGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGTAGGTACTGAAGTTAAAGCGATCGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGTCATGAGCCTTTACGGCTATaa > 1:348805/1‑275 (MQ=255) cGAAAAATCGCTGATGTCCCGTACCGGTGGTC‑TGGGCGCGCCGCGTGGTCAGGCATTCTGGCCGGTTCGCGGGCCGACGCTGCATCGCTATGGCGAACAGCTACAGGGTGAATTACGCTGGAAAGGTATGGTTATCGGTGCTTCTGAAGGTACTGAAGTTAAAGCGATTGCCGACGGTCGGGTGATTCTGGCTGACTGGCTGCAAGGCTACGGTCTGGTGGTGGTGGTTGAGCATGGTAAAGGCGACATGAGTCTTTACGGCTATAATCAGAGCGCAc > 2:95286/1‑278 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |