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tatCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCT‑CGCATGGGGAGACCCCACACTACCACCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCAGGCAAATTCTGttt > 8:244502/1‑149 (MQ=255) tatCAGCACGCTAAAGTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCT‑CGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCAGGCAAATTCTGTTTTATCAGACCGCTTCTGCGTTCTGATTTAATCTGTATCAGGCTGAAAATCTTCTCTCATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTCa < 2:191497/245‑1 (MQ=25) atCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCT‑CGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCAGGCAAATTCTGtttt > 6:1134303/1‑149 (MQ=38) tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCT‑CGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCAGGCAAATTCTGTTTTa > 6:624906/1‑149 (MQ=38) tCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCT‑CGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCAGGCAAATTCTGTTTTa < 7:1168602/149‑1 (MQ=38) cAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCT‑CGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCAGGCAAATTCTGTTTTAt < 8:1158440/149‑1 (MQ=38) cAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCT‑CGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCAGGCAAATTCTGTTTTAt < 8:1344133/149‑1 (MQ=37) aGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCT‑CGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCAGGCAAATTCTGTTTTATc > 8:1038440/1‑149 (MQ=35) aCGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCT‑CGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCAGGCAAATTCTGTTTTATCAGa < 6:855126/149‑1 (MQ=33) gCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCT‑CGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCAGGCAAATTCTGTTTTATCAGa < 7:1234483/147‑1 (MQ=32) gCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCT‑CGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCAGGCAAATTCTGTTTTATCAGa > 8:1234483/1‑147 (MQ=32) gCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCT‑CGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCAGGCAAATTCTGTTTTATCAGAcc > 5:1359962/1‑149 (MQ=32) cTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCT‑CGCATGGGGAGACCCCACACTACCGTCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCAGGCAAATTCTGTTTTATCAGACCg > 5:1290791/1‑149 (MQ=17) cTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCT‑CGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTGACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTAGGACCACCGCGCTACGGCGGCCAGGCAAATTCTGTTTTATCAGa > 7:1233981/1‑146 (MQ=12) cTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCT‑CGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCCGGCAAATTCTGTTTTATCAGACCGCTTCTGCGTTCTGATTTAATCTGTATCAGGCTTAAAATCTTCTCTCATNCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTTTACGGTTAAGCCTCACCGTTCCTTAGTCCCGGTTAGCCCAACCCATCGCTgcg > 3:68345/1‑273 (MQ=11) cTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCT‑CGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCAGGCAAATTCTGTTTTATCAGa < 8:1233981/146‑1 (MQ=32) cTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCT‑CGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCAGGCAAATTCTGTTTTATCAGACCg > 7:1171713/1‑149 (MQ=32) cTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCT‑CGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCAGGCAAATTCTGTTTTATCAGACCGc > 4:354853/1‑150 (MQ=32) cTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCT‑CGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCATTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCAGGCAAATTCTGTTTTATCAGACAGCTTCTGCGTTCTGATTTCATCTGTATCAGGCTGAAAATCTTCTCTCATCCGCCAAAACAGCTTAGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTCACGGTTCATTAGTa > 2:93712/1‑248 (MQ=14) tAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCT‑CGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCAGGCAAATTCTGTTTTATCAGACCGc > 6:988075/1‑149 (MQ=31) aaaTTTGATGCCTGTCAGTTCCCTACTCG‑CGCATGGGGAGACCCCACCCGACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTACTGAGTGCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTCCGGCCGCCAGGCAAATTCTGTTTTATCAGACCGCTTCTGCGTTCTGATTTAATCTGTATCAGGCTGAAAATCTTCTCTCATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTCACGGTTCATTAGTACCGGTTAGCTCAACGCATCGCTGCGCTTa < 4:236605/275‑1 (MQ=2) aaaTTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCT‑CGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCAGGCAAATTCt < 6:1096769/133‑1 (MQ=11) aaaTTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCT‑CGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCAGGCAAATTCt > 5:1096769/1‑133 (MQ=11) | CGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACTGCCGCCAGACAAATTCTTTTCTAATCTGCCGAACTTTAACCTAAAAAGTGGTGCTGATACCCAGAGTCGAACTGGGGACCTCACCCTTACCAAGGGTGCGCTCT‑ACCAACTGAGCCATATCAGCACGCTAAATTTGATGCCTGGCAGTTCCCTACTCT‑CGCATGGGGAGACCCCACACTACCATCGGCGCTACGGCGTTTCACTTCTGAGTTCGGCATGGGGTCAGGTGGGACCACCGCGCTACGGCCGCCAGGCAAATTCTGTTTTATCAGACCGCTTCTGCGTTCTGATTTAATCTGTATCAGGCTGAAAATCTTCTCTCATCCGCCAAAACAGCTTCGGCGTTGTAAGGTTAAGCCTCACGGTTCATTAGTACCGGTTAGCTCAACGCATCGCTGCGCTTA > NC_000913/3423474‑3423935 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |