| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 2,581,762 | G→A | 5.3% | A339V (GCC→GTC) | ypfG ← | DUF1176 family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,581,762 | 0 | G | A | 5.3% | 591.1 / 13.8 | 184 | A339V (GCC→GTC) | ypfG | DUF1176 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (90/82); new base A (6/4); total (96/88) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.51e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
ATGTTGGTCTGAAAGGGGCAATTGTCGGGATGACGGGTTACGGGGAATCTGCTCCGGCGGATAAGCTGTTCCCGTTCTTTGGCTTTACCGCCGAGAATATTGTGGCAAAAGCG‑CATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGCCTGAATGCCACAATCGCTTAATCCGCGCCCTTTCGCTAAGGTCACCAGTTCACGCGATTTCTCATCAAATGTTGCGTTCATCAGTTCCAGTTCATTCGTCTCCTGACCGTTGTTGAACGGCAAACGCAACCGAACCGGGCGCGAAGCTAGTGGCTTTTTACGCGACACAATCCATGCCAAATCAA > NC_000913/2581497‑2582032 | gTTGGTCTGAAAGGGGCAATTGTCGGGATGACGGGTTACGGGGCATCTGCTCCGGCGGATAAGCTGTTCCCGTTCTTTGGCTTTACCGCCGAGAATATTGTGGCAAAAGCG‑CATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGCATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAGCGTATTATCTGGCCTACTTGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGGGCTCCACCACGTGGGCAAGGctgccggcac > 4:128569/1‑265 (MQ=255) 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(MQ=255) cAGACGCCTGGCCCACGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCTCCTGAATGc < 8:938876/97‑1 (MQ=255) cAGACGCCTGGCCCACGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGCCTGAATGc > 7:938876/1‑97 (MQ=255) | ATGTTGGTCTGAAAGGGGCAATTGTCGGGATGACGGGTTACGGGGAATCTGCTCCGGCGGATAAGCTGTTCCCGTTCTTTGGCTTTACCGCCGAGAATATTGTGGCAAAAGCG‑CATAAGGTGCTGGGAGTGAAAGGTGCCTGATGGTGATTGCCGGATGCTGATTGCCGGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCCGGCCTACAGCGTCTTATCCGGCCTACATGTCCCGCCATTTTGTTTAACGGGTGATCCACAACGTGGGCCAGGCGTCTGGCCCATGCCAGTTATCGCAGGTGGGTTCTGCGGCGTAACGCACCAGGCGAAAACGCTGACCGTCAAAGCGCCAGCGCGCCTGAATGCCACAATCGCTTAATCCGCGCCCTTTCGCTAAGGTCACCAGTTCACGCGATTTCTCATCAAATGTTGCGTTCATCAGTTCCAGTTCATTCGTCTCCTGACCGTTGTTGAACGGCAAACGCAACCGAACCGGGCGCGAAGCTAGTGGCTTTTTACGCGACACAATCCATGCCAAATCAA > NC_000913/2581497‑2582032 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |