| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,288,032 | 0 | C | A | 8.5% | 722.1 / 42.0 | 212 | intergenic (+22/‑58) | yraH/yraI | putative fimbrial‑like adhesin protein/putative periplasmic pilin chaperone |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (98/96); new base A (10/8); total (108/104) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.07e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
GCAAAAGTAGGCTCTTTTGCTGGCATAGCGGCAACAGGTGTGGGTATCCGTATTGACGATGCGGAAAGCGGAAACATTATGCCACTGAATGCTATGGGCAATGATAACACGGTTTATCAGATCCCGGCGGAATCCAATGGTATTGTCAATGTTGACCTCATCGCTTACTACGTATCAACCGTAGTTCCATCAGAAATCACCCCAGGGGAAGCAGACGCTATCGTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTATCTGACCTGTCAGATAACGCCCTTTTCCTTCCTCTTTCTCGTTGTATCAGGTTGAAAAATAACTATGTCAAAACGAACATTCGCGGTGATATTAAC‑CTTGTTGTGTAGCTTCTGTATTGGCCAGGCGCTTGCAGGAGGAATCGTTTTACAGCGAACGCG‑AGTGATCTATGATGCCAGCCGCAAAGAGGCTGCGTTACCTGTCGCAAACAAAGGCGCAGAAACGCCTTATTTACTGCAATCATGGGTAGATAATATAGATGGTAAA > NC_000913/3287762‑3288290 | gCTCTTTTGCTGGCATAGCGGCAACAGGTGTGGGTATCCGTATTGACGATGCGGAAAGCGGAAACATTATGCCACTGAATGCTATGGGCAATGATAAGACGGTTTATCAGATCCCGGCGGAATCCAATGGTATTGTCAATGTTGACCTCATCGCTTACTACGTATCAACCGTAGTTCCATCATAAATCACCCCCGGGGAAGCAGACGCTATCGTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGTGTTATCTGACCttgcatatgacctc > 4:10311/1‑262 (MQ=255) 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GCAAAAGTAGGCTCTTTTGCTGGCATAGCGGCAACAGGTGTGGGTATCCGTATTGACGATGCGGAAAGCGGAAACATTATGCCACTGAATGCTATGGGCAATGATAACACGGTTTATCAGATCCCGGCGGAATCCAATGGTATTGTCAATGTTGACCTCATCGCTTACTACGTATCAACCGTAGTTCCATCAGAAATCACCCCAGGGGAAGCAGACGCTATCGTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTATCTGACCTGTCAGATAACGCCCTTTTCCTTCCTCTTTCTCGTTGTATCAGGTTGAAAAATAACTATGTCAAAACGAACATTCGCGGTGATATTAAC‑CTTGTTGTGTAGCTTCTGTATTGGCCAGGCGCTTGCAGGAGGAATCGTTTTACAGCGAACGCG‑AGTGATCTATGATGCCAGCCGCAAAGAGGCTGCGTTACCTGTCGCAAACAAAGGCGCAGAAACGCCTTATTTACTGCAATCATGGGTAGATAATATAGATGGTAAA > NC_000913/3287762‑3288290 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |