Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 3,739,717 | C→T | 6.0% | L5F (CTT→TTT) | avtA → | valine‑pyruvate aminotransferase; transaminase C; alanine‑valine transaminase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,739,717 | 0 | C | T | 6.0% | 2110.6 / 22.2 | 704 | L5F (CTT→TTT) | avtA | valine‑pyruvate aminotransferase; transaminase C; alanine‑valine transaminase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (411/242); new base T (2/46); total (413/291) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.88e-17 | |||||||||||
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Only 100 of 724 total aligned reads displayed.
CTGAAGCAGGGCTACGGCTTTGTTCGTGAGCATGGCGACGATAAAGTGCTGGTCGTCTGGGCAGGGCAACAGTAACTTTTCCGGCTTCCCGTTCGTCAGTACCTCGGGAAGCCGCCAACCAGGATAAAATGTCAGCCCTAATCAGCGTTGCAGGATAAAGCACCGCTCACTCTTCAACAGACCGATTTGCACCCCAGCAAATGTAGCGTTATTGTTACCTTCCTTGCTACAGAGTTCGACAGATATCCCGCTATGACATTCTCCCTTTTTGGTGACAAATTTACCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGAAGATCTGAACGACGGTTTACGCACGCCTGGCGCGATTATGCTCGGCGGCGGTAATCCGGCGCAGATCCCGGAAATGCAGGACTACTTCCAGACGCTACTGACCGACATGCTGGAAAGTGGCAAAGCGACTGATGCACTGTGTAACTACGACGGTCCACAGGGGAAAACGGAGCTACTCACACTGCTTGCCGGAATGCTGCGCGAGAAGTTGGGTTGGGATATCG > NC_000913/3739453‑3739990 | gCTACGGCTTTGTTCGTGAGCATGGCGACGATAAAGTGCTGGTCGTCTGGGCAGGGCAACAGTAACTTTTCCGGCTTCCCGTTCGTCAGTACCTCGGGAAGCCGCCAACCAGGATAAAATGTCAGCCCTAATCAGCGTTGCAGGATAAAGCACCGCTCACTCTTCAACAGACCGATTTGCACCCCAGCAAATGTAGCGTTATTGTTACCTTCCTTGCTACAGAGTTCGCCAGATATCCCGCTATGACATTCCCCTTTTTTGGTGACAAATTTAcc > 2:309764/1‑275 (MQ=255) 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cAGATATCCCGCTATGCCATTCCCCTTTTTTGGTGACAAATTTACCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGAAGATCTGAACGACGGTTTACGCACGCCTGGCGCGATTATGCTCGGCGGCGGTAATCCGGCGCAGATCCCGGaaa < 5:817791/149‑1 (MQ=255) atatCCCGCTATGACATTCTCCTTTTTTGGTGAAAAATTTCCCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGAAGATCTGAACGACGGTTTACGCACGCCTGGCGCGATTATGCTCGGCGGCGGTAATCCGGCGCAGATCCCGGAAATGc < 7:1211335/149‑1 (MQ=255) tatCCCGCTATTACATTCTCCCTTTTTGGTGACAAATTTCCCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGAAGATCTGAACGACGGTTTACGCACGCCTGGCGCGATTATGCTCGGCGGCGGTAATCCGGCGCAGATCCCGGAAATGCa < 5:541618/149‑1 (MQ=255) tatCCCGCTATGACATTCTCCCTTTTTGGTGACAAATTTACCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGAAGATCTGAACGACGGTTTACGCACGCCTGGCGCGATTATGCTCGGCGGCGGTAATCCGGCGCAGATCCCGGAAATGCa > 7:625535/1‑149 (MQ=255) tatCCCGCTATGACATTCTCCCTTTTTGGTGACAAATTTACCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGAAGATCTGAACGACGGTTTACGCACGCCTGGCGCGATTATGCTCGGCGGCGGTAATCCGGCGCAGATCCCGGAAATGCa < 5:1400233/149‑1 (MQ=255) atCCCGCTATGACATTCTCCCTTTTTGGTGACAAATTTACCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGAAGATCTGAACGACGGTTTACGCACGCCTGGCGCGATTATGCTCGGCGGCGGTAATCCGGCGCAGATCCCGGAAATGCAg < 5:370368/149‑1 (MQ=255) tATGACATTCTCCCTTTTTGGTGACAAATTTACCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGAAGATCTGAACGACGGTTTac > 7:1391063/1‑83 (MQ=255) aTGACATGCCCCATTTTTGGTGAAAAATTTCCCCCCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGAAGATCTGAACGACGGTTTACGCACGCCTGGCGCGATTATGCTCGGCGGCGGTAATCCGGCGCAGCTCCCGGAAATGCAGGACTACtt < 7:873907/149‑1 (MQ=255) tGACATTCTCCCTTTTTGGTGACAAATTTCCCCGCCACTCCGGCACTACGCTGTCGATGGAAGATCTGAACGACGGTTTACGCACGCCTGGCGCGATTATGCTCGGCGGCGGTAATCCGGCGCAGATCCCGGAAATGCAGGACTACTTc < 7:1257748/149‑1 (MQ=255) tGACATTCTCCCTTTTTGGTGACAAATTTACCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGAAGATCTGAACGACGGTTTACGCACGCCTGGCGCGATTATGCTCGGCGGCGGTAATCCGGCGCAGATCCCGGAAATGCAGGACTACTTc > 5:478249/1‑149 (MQ=255) gACTTTCTCCTTTTTTGGTGACAATTTTACCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGAAGATCTGAACGACGGTTTACGCACGCCTGGCGCGATTATGCTCGGCGGCGGTAATCCGGCGCAGATCCCGGAAATGCAGGACTACTTcc < 7:763922/149‑1 (MQ=255) 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ccTTTTTGGTGACAATTTTACCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGAAGATCTGAACGACGGTTTACGCACGCCTGGCGCGATTATGCTCGGCGGCGGTAATCCGGCGCAGATCCCGGAAATGCAGGACTACTTCCAGACGCTAc < 7:292094/149‑1 (MQ=255) ccTTTTTGGTGACAAATTTACCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGAAGATCTGAACGACGGTTTACGCCCGCCTGGCGCGATTATGCTCGGCGGCGGTAATCAGGCGCAGATCCCGGAAATGCAGGACTACTTCCAGACGCTACTGACCGACATCCTGGAAAGTGGCAAAGCGACTGATGCACTGTGTAACTTCGACGGTCCACAGGGGAAAACGGAGCTACTCGCACTGTGTGCCGGAATCCCGGGCGCGAAGTTGGGTTGGGacac > 4:191696/1‑270 (MQ=255) | CTGAAGCAGGGCTACGGCTTTGTTCGTGAGCATGGCGACGATAAAGTGCTGGTCGTCTGGGCAGGGCAACAGTAACTTTTCCGGCTTCCCGTTCGTCAGTACCTCGGGAAGCCGCCAACCAGGATAAAATGTCAGCCCTAATCAGCGTTGCAGGATAAAGCACCGCTCACTCTTCAACAGACCGATTTGCACCCCAGCAAATGTAGCGTTATTGTTACCTTCCTTGCTACAGAGTTCGACAGATATCCCGCTATGACATTCTCCCTTTTTGGTGACAAATTTACCCGCCACTCCGGCATTACGCTGTTGATGGAAGATCTGAACGACGGTTTACGCACGCCTGGCGCGATTATGCTCGGCGGCGGTAATCCGGCGCAGATCCCGGAAATGCAGGACTACTTCCAGACGCTACTGACCGACATGCTGGAAAGTGGCAAAGCGACTGATGCACTGTGTAACTACGACGGTCCACAGGGGAAAACGGAGCTACTCACACTGCTTGCCGGAATGCTGCGCGAGAAGTTGGGTTGGGATATCG > NC_000913/3739453‑3739990 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |