| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,888,032 | 0 | T | A | 6.1% | 459.2 / 15.0 | 130 | intergenic (‑41/+29) | rnd/fadD | ribonuclease D/acyl‑CoA synthetase (long‑chain‑fatty‑acid‑‑CoA ligase) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (57/65); new base A (3/5); total (60/70) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.25e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
AGTGCGCGTACGAACAAATTCAGTATCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAACCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCGGTAACTCATCACGAAACTCCACCAGCTTCGGTACTTTGTATCC > NC_000913/1887884‑1888180 | aGTGCGCGTACGAACAAATTCAGTATCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGAtt > 4:43792/1‑149 (MQ=255) gTGCGCGTACGAACAAATTCAGTATCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTa > 1:1417940/1‑149 (MQ=255) gTGCGCGTACGAACAAATTCAGTATCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTa > 2:1253086/1‑149 (MQ=255) 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AGTGCGCGTACGAACAAATTCAGTATCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCAT‑CGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTT‑CTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAACCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCGGTAACTCATCACGAAACTCCACCAGCTTCGGTACTTTGTATCC > NC_000913/1887884‑1888180 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |