| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,638,584 | 0 | A | T | 5.9% | 546.5 / 16.5 | 153 | F23L (TTT→TTA) | bamB | BamABCDE complex OM biogenesis lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (68/76); new base T (3/6); total (71/82) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.05e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.61e-01 | |||||||||||
Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
AGACAACGTTGTCCGCCAGTGCCGGATGAAGATTGGAATAGAAGTTGCCAATGCCGCTACCAACGGAAGTGCTCCACGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTAAACAGCGAACAGCCGCTTAAAAGGGTAACGGAAAGCAGTCCTGGCAGCAGTAATTTACGCAATTGCATCGGGTCCCTCTCAGATGGACAAATTATTAATTTTCATCTGCATCATTTCGCTCAGTGCCGGAGTAACATCGCTTTTCA > NC_000913/2638436‑2638730 | aGACAACGTTGTCCGCCAGTGCCGGATGAAGATTGGAATAGAAGTTGCCAATGCCGCTACCAACGGAAGTGCTCCACGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTa > 1:1315562/1‑149 (MQ=255) aCAACGTTGTCCGCCAGTGCCGGATGAAGATTGGAATAGAAGTTGCCAATGCCGCTACCAACGGAAGTGCTCCACGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTaaa < 2:212472/149‑1 (MQ=255) aCAACGTTGTCCGCCAGTGCCGGATGAAGATTGGAATAGAAGTTGCCAATGCCGCTACCAACGGAAGTGCTCCACGCCGTGGTCGGCGTAAACTGGTTTTCAACGGTTGGCAATGGGGACATCTTTACCACATCTTCTTCGCTGTTaaa > 3:1130991/1‑149 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |