Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 481,225 | 0 | T | G | 9.6% | 378.6 / 29.2 | 122 | intergenic (‑517/+29) | tomB/acrB | Hha toxicity attenuator; conjugation‑related protein/multidrug efflux system protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (57/53); new base G (8/4); total (65/57) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.76e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.22e-01 |
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
ATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAACCACCACAAAGAATACCGGAACGAAGAAGATTGCCAGTACCGTTGCGGTCAC > NC_000913/481077‑481370 | aTCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCt > 2:1061557/1‑149 (MQ=255) aTTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCCTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTAcg > 4:1276866/1‑149 (MQ=255) gcTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCt < 3:406975/149‑1 (MQ=255) 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aGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAACCACCACAAAGAATACCGGAACGAAGAAGATTGCCAGTACCGTTGCgg < 1:32626/149‑1 (MQ=255) aGGCCGCGTAAGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAACCACCACAAAGAATACCGGAACGAAGAAGATTGCCAGTACCGTTGCgg > 2:922565/1‑149 (MQ=255) ggCCGCTTACGCTGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCTATCTCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAACCACCACAAAGAATACCGCAACGAAGAAGATCGCCAGTACCGTTGCGGt > 1:814330/1‑149 (MQ=255) ggCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAACAACCACAAAGAATACCGGAACGAAGAAGATTGCCAGTACCGTTGCGGt < 2:113200/149‑1 (MQ=255) ccGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAACCACCACAAAGAATACCGGAACGAAGAAGATTGCCAGTACCGTTGCGGTCa > 4:2299/1‑149 (MQ=255) cGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCCGTGCTCGACATCTTCATTCTTGCGGCTCAAGCGGGGGCGAACGACCAAAAAGAATAACGGAACGAAGAAGATTGCCAGTACCGTTGAGGTGAc > 4:511370/1‑149 (MQ=255) | ATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAACCACCACAAAGAATACCGGAACGAAGAAGATTGCCAGTACCGTTGCGGTCAC > NC_000913/481077‑481370 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |