New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2320481 | 93 (0.830) | 3 (0.030) +CAGGCAGG |
3/444 | 10.0 | 3.1% | coding (439/1827 nt) | atoS | sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with AtoC |
? | NC_000913 | 2320482 = | 98 (0.830) | coding (440/1827 nt) | atoS | sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with AtoC | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
GGCACTAGGCGATCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATCCGCGCATTAAATGCAGAACTTGCCCCCATTACCGAAAATATCACTCACGCCTTCCCTGGCATCGGTGCTGGTTATTACAACAAAATGCTGGATGCGATAATCACCTACGCGCCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑AAATACCCCTTTAGTTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCGAAGATATTCGCCGCCAGGCCTGGAAAATGGATGTGAGGATTATCATTGTGCTCACCGCTGGTTTGCTGATAAGCCTGCTGTTGATTGTCCTTTTCTCCCGTCGCCTGAGCGCCAATATTGATATCATCACCGATGGCCTCTCGACTCTGGCACAAAATATTCCCACTCGATTACCAC > NC_000913/2320222‑2320754 | ggaaCTAGGCTATCGCTACGCACCCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCCTATCCGCGCATTAAATGCAGAACTTGCCCCCATTACCGAAAATATCACTCACGCCTTCCCTGGCATCGGTGCTGGTTATTACAACAAAATGCTGGATGCGATAATCACCTACGCGCCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑AAATACCCCTTTAGTTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGCAGGCAGGTgcg < 4:351451/273‑1 (MQ=255) aTCGCTATGATCTCTACATCGACTTCCCACGTGCGGCGCGTAACCGCGCATTAAATGCAGAACTTGCCCCCATTACCGAAAATATCACTCACGCCTTCCCTGGCATCGGTGCTGGTTATTACAACAAAATGCTGGACGCCATAATCACCTACGCGCCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGACCACCCTGGTCCAGAAGTGAAACGTAC‑AAATACACCTTTAGTTTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGCAGGCGGGTACacgggactat > 3:437072/1‑268 (MQ=255) aTCGCTATGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATCCGCGCATTAAATGCAGAACTTGCCCCCATTACCGAAAATATCACTCACGCCTTCCCTGGCATCGGTGCTGGTTATTACAACAAAATGCTGGATGCGATAATCACCTACGCGCCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑AAATACCCCTTATGTTTCTG‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGCAGTCAGGTGCGCGGCGatat > 1:367605/1‑274 (MQ=255) tGATCTCTACATCGACTTACCACGTGAGGAGCGTATCCGCGCATTAAATGCAGAACTTGCCCCCATTACCGAAAGTATCACTCACGCCTTCCCTGGCATCGGTGCTGGTTATTACAACAAAATGCTGGATGCGATAATCACCTACGCGCCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑AAATACCCCTTTAGTTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAAtt > 1:372953/1‑275 (MQ=255) ccggaCATCGACGAACCCAGGGTGGAGCTTATCCGATGAGTAAATGCAGTACCTGCCCCCATTACCGAAACTATCACGCACGCCTTCCTTAGCATCGTTGCGGGTTATTACAACAAAATGCTGGATGCGATAATCACCTACGCGCCTTCCGCGCTAAATGAGAATAATATCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTCGCGAAGTTATGCGTAC‑AAATACCCCTTTAGTTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAAt < 4:663282/271‑1 (MQ=255) tctacacagtcatACCACATGATGCTCGTACCCGCGCATTAAATGCAGACCCTGCCCCCATTACCGAAACGATCACTCACGCCTTCCCTGTCATCGGTGCTGGTTATTACAACAAAATGCTGGATGCGATAATCACCTACGCGCCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTCGCGAAGTGCTGCGTAC‑AAATACCCCTTTAGTTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGc < 4:514229/264‑1 (MQ=255) cGACTTACCACGTGAGGAGCGTATCCGCGCATTAAATGCAGAACTTGCCCCCATTACCGAAAATATCACTCACGCCTTCCCTGGCATCGGTGCTGGTTATTACAACAAAATGCTGGATGCGATAATCACCTACGCGCCTTTAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑AAATATCCCTTTAGTTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑TAGGCAGCCAGGTGAGCGGCGATATTTTGAATTCaa > 2:514229/1‑266 (MQ=255) cGACTTACCACGTGAGGAGCGTATCCGCGCATTAAATGCAGAACTTGCCCCCATTACCGAAAATATCACTCACGCCTTCCCTGGCATCGGTGCTGGTTATTACAACAAAATGCTGGATGCGATAATCACCTACGCGCCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑AAATACCCCTTTAGTTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGCGGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTCCCCAt > 2:610663/1‑276 (MQ=255) gctttACCCCTTGAGGCGCTGACCCGCGAATTAAATGCAGTACTTGCCCCCACTACCCACAATATCACTCACACCTCCCCCTGCATGGGTGCTGGTTATTACAACACAATGCTGGATGCGATAATCACCTACGCGCCTTCAGCGCTATATCAGACTATTGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑AAATTCCCCTTTAGTTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGCAGGCAAGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTCCCCAtt < 4:532795/273‑1 (MQ=255) aCTTACCACGTGAGGAGCGTATCCGCGCATTAAATGCAGAACTTGCCCCCATTACCGAAAATATCACTCACGCCTTCCCTGGCATCGGTGCTGGTTATTACAACAAAATGCTGGATGCGATCATCACCTACGCGCCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑CAATAACCCTTTAGTTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGTCGTCAGGTGCTCGGGGATATTTTCAATTCAATTCTCCCCAtt > 3:139125/1‑275 (MQ=255) aCTTACCACGTGAGGAGCGTATCCGCGCATTAAATGCAGAACTTGCCCCCATTACCGAAAATATCACTCACGCCTTCCCTGGCATCGGTGCTGGTTATTACAACAAAATGCTGGATGCGATAATCACCTACGCGCCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑AAATACCCCTTTAGTTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTCCCCATTg > 2:11341/1‑276 (MQ=255) ttACCACGTGAGGAGCGTATCCGCGCATTAAATGCAGAACTTGCCCCCATTACCGAAAGTATCACTCACGCCTTCCCTGGCATCGGTGCTGGTTATTACAACAAAATGCTGGATGCGATAATCACCTACGCGCCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑AAATACCCCTTTAGTTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTCCCCATTGa < 3:372953/275‑1 (MQ=255) acgtatagagCGTATCCGCTCGTAAATCGCAGAACTCGCCCCCATTACCTAAAATAACCCTCCCGCTTCACCTCGCATCAGTGCTGTTTATTACAACAAAATGCTGGATGCGGTAATCACCTACGCGACATCAGCGCTATATCAGAATAATGGCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCGGGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑AAATACCCCTTTAGTTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTCCCCATTGAGCGTaa < 4:11341/269‑1 (MQ=255) aTCCGCGCATTAAATGCAGAACTTGCCCCCATTACCGAAAATATCACTCACGCCTTCCCTGGCATCGGTGCTGGTTATTACAACAAAATGCTGGATGCGATAATCACCTACGCGCCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑AAATACCCCTTTAGTTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCt < 3:448044/275‑1 (MQ=255) cgcATTAAATGCAGGACTTGCCCCCATTACCGAAAATATCACTCACGCCTTCCCTGGCATCGGTGCTGGTTATTACAACAAAATGCTGGATGCGATAATCACCTACGCGCCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑AAATACCCCTTTAGTTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCt < 1:528114/275‑1 (MQ=255) cATTAAATGCAGAACTTGCCCCCATTACCGAAAATATCACTCACGCCTTCCCTGGCATCGGTGCTGGTTATTACAACAAAATGCTGGATGCGATAATCACCTACGCGCCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCAACCTGGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑AAATACCCCTTTAGTTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGCAGGCAGGTTCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTCCACATTGAGCGTAATGGTGAAATCCGCGGCtata > 2:549058/1‑276 (MQ=255) aGAACTTGCCCCCATTACCGAAAATATCACTCACGCCTTCCCTGGCATCGGTGCTGGTTATTACAACAAAATGCTGGATGCGATAATCACCTACGCGCCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑AAATACCCCTTTAGTTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCa < 1:529023/275‑1 (MQ=255) gCCCCCATTACCGAAAATATCACTCACGCCTTCCCTGGCATCGGTGCTGGTTATTACAACAAAATGCTGGATGCGATAATCACCTACGCGCCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑AAATACCCCTTTAGTTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAAtt > 1:206990/1‑275 (MQ=255) ccccATTACCGAAAATATCACTCACGCCTTCCCTGGCATCGGTGCTGGTTATTACAACAAAATGCTGGATGCGATAATCACCTACGCGCCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑AAATACCCCTTTAGTTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTCCCCAtt > 2:453519/1‑229 (MQ=255) ccccATTACCGAAAATATCACTCACGCCTTCCCTGGCATCGGTGCTGGTTATTAAAACAAAATGCTGGATGCGATAATCACCTACGCGCCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑AAATACCCCTTTAGTTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTCCCCAtt < 4:453519/229‑1 (MQ=255) ccATTACCGAAAATATCACTCACGCCTTCCCGGGCATCGGTGCTGGTTATTACAACAAAATGCTGGATGCGATAATCACCTACGCGCCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑AAATACCCCTTTAGTTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCg < 2:653382/276‑1 (MQ=255) aaaaTATCACTCACGCCTTCCCTGGCATCGGTGCTGGTTATTACAACAAAATGCTGGATGCGATAATCACCTACGCGCCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑AAATACCCCTTTAGTTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCCCCCCATTGAGCGTAATGTTGAAATCCTCGGCTCTATCGGGCCCAATGAATTAACCGAAGATAtt > 1:242440/1‑275 (MQ=255) aaTATCACTCACGCCTTCCCTGGCATCGGTGCTGGTTATTACAACAAAATGCTGGATGCGATAATCACCTACGCGCCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑AAATACCCCTTTAGTTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCGAAGATATTcg > 1:529651/1‑275 (MQ=255) tcactcacGCCTTCCCTGGCATCGGTGCTGGTTATTACAACAAAATGCTGGATGCGATAATCACCTACGCGCCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑AAATACCCCTTTAGTTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCGAAGATATTcgccgc < 1:115433/275‑1 (MQ=255) ccTGGCATCGGTGCTGGTTATTACAACAAAATGCTGGATGCGATAATCACCTACGCGCCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑AAATACCCCTTTAGTTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTCCCACTTAGGCGTAATGGTCAAATCCTCGGCTATAACTGGGCCAATGAATTAACAGAAGATCTTTGCCGCCAGGCCTGGaaaaag > 4:158688/1‑274 (MQ=255) gtaTCAGTTCTAGTTATTACAACAAAATGCTGTATGCGATAATCACCTACGCGCCTTCAGCGCTATATCAGAATAATATCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGGTGCGAAGTTATGCGTAC‑AAATACCCCTTTAGTTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGTCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCGCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCGAAGATATTCGCCGCCAGGCCTGGAAAATGGAtg < 2:679542/274‑1 (MQ=255) gCATCGGTGCTGTTTACTAAAACAAAATGCTGGATGCGATAATCACCTACGCGCCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑AAATACCCCTTTAGTTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCGAAGATATTTGCCGCCAGGCCTGGAAAATGGAtg < 2:158688/276‑1 (MQ=255) cATCGGTGCTGGTTATTACAACAAAATGCTGGATGCGATAATCACCTACGCGCCTTAAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑AAATACCCC‑TTAGTTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCGAAGATATTCGCCGCCAGGCCTGGAAAATGGAtgtg < 2:488977/276‑1 (MQ=255) cGGTGCTGGTTATTAAACCAAAATGCTGAATGCGATAATAACCTACGCGCCTTACACGCTATATCGGAATAATGTCTGCGTTACCATTGCTGAAGATCACCCTGGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑AATTACCCCTTTAGTTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCGAAGATATTCGCCGCCAGGCCTGGAAAATGGATGTGAg < 4:26682/276‑1 (MQ=255) tcTGGTTGTTACAAAAAAAAGATGATCGCGTTAATCTCCTACGCGCCTTCAGCGCTATATCAGAATAGGGTCGGCGTTACCACTCCCGCAGATACCCCTTGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑AAATCCCCCTTTAGTGGTTT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGCAGGCAGGTGGGCGGCGATATATTGAATTAAAGGCTACCCGTTGGGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCGAATGAATTAACCGAAGATAGTCGCCGCCAGGCCTGTAAAATGAATGTGAGGAt < 3:367605/274‑1 (MQ=255) tGGTTATTACAACAAAATGCTGGATGCGATAATCACCTACGCGCCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑AAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCGAAGATATTCGCCGCCAGGCCTGGAAAATGGAtgt > 3:166797/1‑275 (MQ=255) tattaCAACAAAATGCTGGATGCGATAATCACCTACGCGCCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑AAATACCCCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCGAAGATATTCGCCGCCAGGCCTGGAAAATGGAtgt < 1:166797/271‑1 (MQ=255) taCAACAAAATGCTGGATGCGATAATCACCTACGCGCCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑AAATACCCCTTTAGTTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTc > 2:520597/1‑164 (MQ=255) taCAACAAAATGCTGGATGCGATAATCACCTACGCGCCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑AAATACCCCTTTAGTTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCGAAGATATTCGCCGCCAGGCCTGGAAAATGGa > 3:11484/1‑257 (MQ=255) taCAACAAAATGCTGGATGCGATAATCACCTACGCGCCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑AAATACCCCTTTAGTTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCGAAGATATTCGCCGCCAGGCCTGGAAAATGGATGTGAGGATTATCATtgt > 2:552613/1‑275 (MQ=255) taCAACAAAATGCTGGATGCGATAATCACCTACGCGCCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑AAATACCCCTTTAGTTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGAAGGCAGGTgcgc > 1:215383/1‑147 (MQ=255) atcaaAATGGTGGATGCGATAAGGACCTGCGCGCCGTCAGCGGTAGATCAGAATGATGGCGGCGGTACCAGTGCCGCAGAGCACCCTGGGCGGGAAGTGATGCGTAC‑AAGTACCCCTTTGGTTTAGT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTCCCCGTTGAGCGTAATGGTGAAAGCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCGAAGATATTCGCCGCCAGGCCTGGAAAATGGATGTGAGGATTATCATTGTGCt < 4:552613/273‑1 (MQ=255) aacaaAATGCTGGATGCGATAATCACCTACGCGCCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑AAATACCCCTTTAGTTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAAt < 4:520597/164‑1 (MQ=255) acaaAATGCTGGATGCGATAATCACCTACGCGCCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑AAATACCCCTTTAGTTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCGAAGATATTCGCCGCCAGGCCTGGAAAATGGAtgtg < 1:11484/257‑1 (MQ=255) acaaAATGCTGGATGCGATAATCACCTACGCGCCTTCAGCGCTATATCAGAATAATGTCGGCGTTACCATTGCCGCAGATCACCCTGGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑AAATACCCCTTTAGTTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGAAGGCAGGTGCgcggcg < 3:215383/147‑1 (MQ=255) aaaaTGCTGGATGCGGTAATCACCTTCGCGCCTTCAGCGCTATATTCGAATAATGTCTGCGTTCCCATTGCCGCAGGTCACCCTCGTCGCGAAGTGATGCGTAC‑AAATACCCCTTTAGTTTATT‑‑‑‑‑‑‑‑CAGGCAGGCAGGTGCTCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTCCCCATTGAGCGTAATGGTGAAATCCTCGGCTATATCTGGGCCAATGAATTAACCGAAGATATTCGCCGACAGGCCTGGAAAATGGATGTGAGGATTATCATTGTGCTCAc < 3:206990/275‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |