New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_000913 | 807425 = | 177 (0.730) | intergenic (‑144/+8) | ybhC/ybhB | acyl‑CoA thioesterase, lipoprotein/kinase inhibitor homolog, UPF0098 family |
Only 100 of 256 total aligned reads displayed.
CGGGCGAGAAGAGGTACCAGGCGCGGTTTGATCAGAAGGACGTTGATCGGGCGGGGTTGAGCTACAGGCGGTCAGCGTCACGCCAAAAGCCAATGCCAGCGCCAGACGGGAAACTGAAAATGTGTTCACAGGTTGCTCCGGGCTATGAAATAGAAAAATGAATCCGTTGAAGCCTGCTTTTTTATACTAACTTGAGCGAAACGGGAAGGTAAAAAGACAAAAAGTTGTTTTTAATACCTTTAAGTGATACCAGATGGCATTGCGCCATCTGGCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGACCATCGCGCCGCTGGCACCTTCATCGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTGCGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCATTGCTACCAGACCAGAGCCAAACCCTTG > NC_000913/807153‑807678 | ggCGAGAAGAGGTACCAGGCGCGGTTTGATCAGAAGGACGTTGATCGGGCGGGGTTGAGCTACAGGCGGTCAGCGTCACGCCAAAAGCCAATGCCAGCGCCAGACGGGAAACTGAAAATGTGTTCACAGGTTGCTCCGGGCTATGAAATAGAAAAATGAATCCGTTGAAGCCTGCTTTTTTATACTAACTTGAGCGAAACGGGAAGGTAAAAAGACAAAAAGTTGTTTTTAATCCCTTTAAGTGATACCAGATGGCATTGCGCCATCTGGCagag > 2:263658/1‑275 (MQ=255) 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gTCAGCGTCACGCCAAAAGCCAATGCCAGCGCCAGACGGGAAACTGAAAATGTGTTCACAGGTTGCTCCGGGCTATGAAATAGAAAAATGAATCCGTTGAAGCCTGCTTTTTTATACTAACTTGAGCGAAACGGGAAGGTAAAAAGACAAAAAGTTGTTTTTAATACCTTTAAGTGATACCAGATGGCATTGCGCCATCTGGCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGCGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGatc > 2:368285/1‑272 (MQ=255) tCACGCCAAAAGCCAATGCCAGCGCCAGACGGGAAACTGAAAATGTGTTCACAGGTTGCTCCGGGCTATGAAATAGAAAAATGAATCCGTTGAAGCCTGCTTTTTTATACTAACTTGAGCGAAACGGGAAGGTAAAAAGACAAAAAGTTGTTTTTAATACCTTTAAGTGATACCAGATGGCATTGCGCCATCTGGCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGACCATCgcgc > 2:690950/1‑274 (MQ=255) tCACAGGTTGCTCCGGGCTATGAAATAGAAAAATGAATCCGTTGAAGCCTGCTTTTTTATACTAACTTGAGCGAAACGGGAAGGTAAAAAGACAAAAAGTTGTTTTTAATACCTTTAAGTGATACCAGATGGCATTGCGCCATCTGGCa < 7:1163142/149‑1 (MQ=255) acaGGTTGCTCCGGGCTATGAAATAGAAAAATGAATCCGTTGAAGCCTGCTTTTTTATACTAACTTGAGCGAAACGGGAAGGTAAAAAGACAAAAAGTTGTTTTTAATACCTTTAAGTGATACCAGATGGCATTGCGCCATCTGGCaga < 6:1503227/149‑1 (MQ=255) 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tttAAGTGATACCAGATGGCATTGCGCCATCTGGCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGACCATCGCGCCGCTGGCACCTTCATCGACATCAATACGTTCTatat > 6:1288079/1‑149 (MQ=255) tAAGTGATACCAGATGGCATTGCGCCATCTGGCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGACCATCGCGCCGCTGGCACCTTCATCGAAATCAATACGTTCTATAACCATCGCGTGAACCGTAACAATGTAACGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTGCGCCGACGTACCGAGTTTTACCAAATCCGGTAAGCGTCTGCAAAACCGCGTTGGGGATTGATACCCAACCagag > 4:235718/1‑275 (MQ=255) tcactctgCCAGATGGCGCAATGCCATCTGGCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGACCATCGCGCCGCTGGCACCTTCATCGACATCAATACGTTCTATATCCa < 7:714802‑M1/141‑1 (MQ=255) ctctgccagatggcgcaatgccatctggTAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGACCATCGCGCCGCTGGCACCTTCATCGACATCAATACGTTCTATATCCAgcg > 7:901693‑M2/29‑149 (MQ=255) tgccagatggcgcaatgccatctggTAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGACCATCGcgccgc < 5:924489‑M2/82‑1 (MQ=255) tgccagatggcgcaatgccatctggCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGaaa < 6:472000‑M2/54‑1 (MQ=255) aCCAGATGGCATTGCGCCATCTGGCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGACCATCGCGCCGCTGGCACCTTCATCGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTGCGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCATTGCTACCAGACCAGAGCCAAAccc > 2:636976/1‑275 (MQ=255) CAGATGGCATTGCGCCATCTGGCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGACCATCGCGCCGCTGGCACCTTCATCGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGaa < 7:1124781‑M1/149‑1 (MQ=255) CAGATGGCATTGCGCCATCTGGCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGACCATCGCGCCGCTGGCACCTTCATCGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGaa < 8:701298‑M1/149‑1 (MQ=255) agatggcgcaatgccatctggCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGgc > 6:742223‑M2/22‑56 (MQ=255) agatggcgcaatgccatctggCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGgc < 5:742223‑M2/35‑1 (MQ=255) AGATGGCATTGCGCCATCTGTCAGAGACAATAACTAAACATCGCACTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCAACCATCGCGCCGCTGGCACCCCAATCGACATCAATACACCCTATCTCCAGCGCGTGAAc > 8:279562‑M1/1‑149 (MQ=255) AGATGGCATTGCGCCATCTGGCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGACCATCGCGCCGCTGGCACCTTCATCGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAAc > 8:341554‑M1/1‑149 (MQ=255) GCATTGCGCCATCTGGCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTGATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGt > 4:440433‑M1/1‑65 (MQ=255) GCATTGCGCCATCTGGCAGAGTGATTAACTAA‑CATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGACCATCGCGCCGCTGGCACCTTCATCGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTaaa > 6:1381757‑M1/1‑149 (MQ=255) CATTGCGCCATCTGGCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGACCATCGCGCCGCTGGCACCTTCATCGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTGCGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCATTGCTACCAGACCAGAGCCAAAcc < 2:238884‑M1/265‑1 (MQ=255) tGCGCCATCTGGCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGACCATCGCGCCGCTGGCACCtt > 4:427294/1‑103 (MQ=255) aatgccatctggCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGACCATCGCGCCGCTGGCACCTTCATCGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAAt < 5:517480‑M2/137‑1 (MQ=255) cgcCATCTGGCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGACCATCGCGCCGCTGGCACCTTCATCGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGt < 5:940673/149‑1 (MQ=255) gccatctggCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGACCATCGCGCCGCTGGCACCTTCATCGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTa < 5:1699136‑M2/140‑1 (MQ=255) gccatctggCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGACCATCGCGCCGCTGGCACCTTCATCGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTa < 6:1526641‑M2/140‑1 (MQ=255) ccatctggCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGACCATCGCGCCGCTGGCACCTTCATCGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAg > 6:924636‑M2/9‑149 (MQ=255) catctggCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGACCATCGCGCCGCTGGCACCTTCATCGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGc > 7:786903‑M2/8‑149 (MQ=255) catctggCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGACCATCGCGCCGCTGGCACCTTCATCGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGc > 6:495168‑M2/8‑149 (MQ=255) catctggCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGACCATCGCGCCGCTGGCACCTTCATCGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGc < 5:797747‑M2/142‑1 (MQ=255) ctggCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGACCATCGCGCCGCTGGCACCTTCATCGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGAt > 7:1687884‑M2/5‑149 (MQ=255) ctggCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGACCATCGCGCCGCTGGCACCTTCATCGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGAt < 6:256185‑M2/145‑1 (MQ=255) | CGGGCGAGAAGAGGTACCAGGCGCGGTTTGATCAGAAGGACGTTGATCGGGCGGGGTTGAGCTACAGGCGGTCAGCGTCACGCCAAAAGCCAATGCCAGCGCCAGACGGGAAACTGAAAATGTGTTCACAGGTTGCTCCGGGCTATGAAATAGAAAAATGAATCCGTTGAAGCCTGCTTTTTTATACTAACTTGAGCGAAACGGGAAGGTAAAAAGACAAAAAGTTGTTTTTAATACCTTTAAGTGATACCAGATGGCATTGCGCCATCTGGCAGAGTGATTAACTAAACATCGCAGTAATCGAGGCGCTTGCCAGAGAGTGGAAATGAACGTTAAACCCGACCATCGCGCCGCTGGCACCTTCATCGACATCAATACGTTCTATATCCAGCGCGTGAACGGTAAAAATGTAGCGATGAGTTTCGCCTTTCGGCGGTGCTGCGCCATCGTACCCGGTTTTACCAAAGTCGGTACGCGTCTGCAAAACGCCGTCTGGCATTGCTACCAGACCAGAGCCAAACCCTTG > NC_000913/807153‑807678 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |