| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3621980 | NA (NA) | 5 (0.020) | 4/274 | NT | 100% | coding (2789/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | NC_000913 | = 3622019 | 0 (0.000) | coding (2828/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
GGCGAACTCATCCGCATCAGCAGCCCGCGCCAGACCCGGAGTTACAGCTACAGCACCACCGGCAGGCTGACCGGCGTTCACACCACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGTGACGCGCACTATCTTTACCGGTATGACCGTCACGGCAGGCTGACAGAGAAAACCGACCTCATCCCGGAAGGGGTTATCCGCACGGATGATGAGCGGACTCACCGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACGGGTGTGGCGGCGTGAACGGGACCTGACGGGCTGGATGTCGCTGTCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGGCTG > NC_000913/3621778‑3622293 | agagccagcagccgcatCAGCAGCCCGCGCCAGACCCGGAGTTACAGCTACAGCACCACCGGCAGGCTGACCGGCGTTCACACCACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGTGACGCGCACTATCTTTACCGGTATGACCGTCACGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtg > 2:633447‑M2/9‑242 (MQ=255) caGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGTGACGCGCACTATCTTTACCGGTATGACCGTCACGG > 5:1371482‑M2/1‑121 (MQ=255) caGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGTGACGCGCACTATCTTTACCGGTATGACCGTCACGG < 6:1371482‑M2/121‑1 (MQ=255) ccGTGACGCGCACTATCTTTACCGGTATGACCGTCACGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatcc < 8:1102769‑M2/144‑106 (MQ=255) ccGTGACGCGCACTATCTTTACCGGTATGACCGTCACGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatcc > 7:1102769‑M2/1‑39 (MQ=255) ccGTGACGCGCACTATCTTTACCGGTATGACCGTCACGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgc < 5:1537185‑M2/136‑98 (MQ=255) ccGTGACGCGCACTATCTTTACCGGTATGACCGTCACGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgc > 6:1537185‑M2/1‑39 (MQ=255) cGTCACGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgccggtggtgctgtagctgtaactccgggtctggcgcgggctgctgatgcgg > 4:283532‑M2/1‑8 (MQ=255) cGTCACGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgccggtggtgctgtagctgtaactccgggtctggcg > 1:9672‑M2/1‑8 (MQ=255) cGTCACGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggt > 4:58658‑M2/1‑8 (MQ=255) cGTCACGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacggga > 1:179349‑M2/1‑8 (MQ=255) cGTCACGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacggga < 3:179349‑M2/102‑95 (MQ=255) gTCACGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgccggtggtgctgtagctgtaactccgggtctggcgcgggctgctgatgcggatgagttcgccgttgtcgttccaggtgtaatcgcggtcagacagcaggctgttcaggtgctggctctgtaactgcc < 2:418710‑M2/275‑269 (MQ=255) gTCACGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgccggtggtgctgtagctgtaactccgggtctggcgcgggctgctgatgcggat > 2:382879‑M2/1‑7 (MQ=255) gTCACGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgc > 5:481990‑M2/1‑7 (MQ=255) gTCACGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgc > 5:67124‑M2/1‑7 (MQ=255) gTCACGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgc < 5:464755‑M2/149‑143 (MQ=255) gTCACGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgc > 6:438854‑M2/1‑7 (MQ=255) gTCACGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgc < 7:1566561‑M2/149‑143 (MQ=255) gTCACGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgc < 7:205073‑M2/149‑143 (MQ=255) gTCACGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgc < 8:934940‑M2/149‑143 (MQ=255) gTCACGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggt > 2:120092‑M2/1‑7 (MQ=255) gTCACGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggtt > 5:1721305‑M2/1‑7 (MQ=255) gTCACGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggtt < 6:1721305‑M2/75‑69 (MQ=255) tCACGGgcgatccggttatccggccacatgttgagggtgctttccgggtgccgctccgggtcggggaggcggttaccttccgtgtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgccggttgtgctgtagctgtaactccgggtctggcgcgggctgctgatgcggatgagttcgccgttgtcgttccaggtgtaatcgcggtcagacagcaggctgttcaggtgctggctctgtaactgcccggc > 1:268949‑M2/1‑6 (MQ=255) tCACGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgccggtggtg < 4:720604‑M2/156‑151 (MQ=255) tCACGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgcc < 8:1310000‑M2/149‑144 (MQ=255) tCACGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgcc > 7:1265170‑M2/1‑6 (MQ=255) tCACGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgt > 7:248674‑M2/1‑6 (MQ=255) tCACGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgcgtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgcc > 7:1595660‑M2/1‑6 (MQ=255) tCACGGgcgatacggttatccggccaaatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgt < 8:248674‑M2/130‑125 (MQ=255) cACGGgctatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgccg > 8:879608‑M2/1‑5 (MQ=255) cACGGgcgatacggttgtccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgccggtggtgctgtagctgtaactccgggtctggcgcgggctgctgatgcggatgagttcgccgttgtcgttccaggtgtaatcgcggtcagacagcaggctgttcaggtgctggctctgtaactgcccggc > 1:118460‑M2/1‑5 (MQ=255) cACGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgccg > 8:14627‑M2/1‑5 (MQ=255) cACGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgccg > 7:684461‑M2/1‑5 (MQ=255) aCGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgct > 5:228706‑M2/1‑4 (MQ=255) aCGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgct < 6:228706‑M2/118‑115 (MQ=255) cGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgccggt < 8:671371‑M2/149‑147 (MQ=255) cGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgccggt > 8:1122678‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgccggt > 6:1159112‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgccggt < 6:1344257‑M2/149‑147 (MQ=255) cGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgccggt > 6:315954‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcgga < 5:509227‑M2/103‑101 (MQ=255) cGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcgga > 6:509227‑M2/1‑3 (MQ=255) cGGgcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacggga < 2:3856‑M2/97‑95 (MQ=255) tggcgatacggttgaccgggcgcaggctgggggggttgtccgtgggccgtcccgtgtcgggctggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatcccgtttcgctgcggtggtgtgaccgccggtcagcctgccgttggggctgtagctgtaactccgggtctggcgcgggctgctgatgcggatgagttcgccgttgtcgttccaggtgtaatcgcggtcagacagcaggctgttcaggtgctggctctgtaactgcccggc > 4:624585‑M2/2‑2 (MQ=255) gggtgatacggttatccggacacatgctgagggtgctgtcggggtgcaggtccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggagtgaacgccggtcagcctgccggtggtgctgtagcagtaactccgggtctggcgcgggctgctgatgcggatgagttcgccgttgtcgttccaggtgtaaacgcggtcagacagcaggctgttcaggtgctggctctgtaactgcccggc > 2:26409‑M2/1‑2 (MQ=255) gggcgttacggttctcgcgccacgtgctggggttgctgtctgtggtcggctccgggtcgggcaggcggttaccttccgggtctttggcatacggactccggttatccagcttcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgccggtggtgctgtggctgtaactccgggtctggcgcgggctgctaatgcggatgagttcgccgttgtcgttccaggtgtaatcgcggtcagacagcaggctgttcaggtgctggctctgtaactgcccggc > 4:272942‑M2/1‑2 (MQ=255) gggcgatgcgggtgtcgggtccgatgctgggggtgcggtccgggtgcagtgccgggtcggggatgtggtggcctgccggggctgggggataggggatggggatatccagattcgctgcgggggtgtgaacgccggtcagcctgccggtggtgctgtagcggtaactccgggtctggcgcgggctgctgatgcggatgagttcgcggttgtcgttccaggtgtaatcgcggtcagacagcaggctgttcaggtgctggctctgtaactgcccggc > 4:527878‑M2/1‑2 (MQ=255) gggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgccggtggtgctgtagctgtaactccgggtctggcgcgggctgctgatgcggatgagttcgccgttgtcgttccaggtgtaatcgcggtcagacagcaggctgttcaggtgctggctctgtaactgcccggc > 2:169268‑M2/1‑2 (MQ=255) gggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgccggtggtgctgt > 2:720609‑M2/1‑2 (MQ=255) gggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgccggtg < 6:1492097‑M2/149‑148 (MQ=255) gggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgccggtg > 5:554909‑M2/1‑2 (MQ=255) gggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgccggtg > 5:1018724‑M2/1‑2 (MQ=255) gggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgccggtg > 5:662998‑M2/1‑2 (MQ=255) gggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgccggtg > 5:1431942‑M2/1‑2 (MQ=255) gggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgccggtg < 7:984294‑M2/149‑148 (MQ=255) gggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgccggtg < 7:98245‑M2/149‑148 (MQ=255) gggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgccggtg > 5:509236‑M2/1‑2 (MQ=255) 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gggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggt > 8:1532785‑M2/1‑2 (MQ=255) ggcgttacggttatccggccacatgctgagggtgcggtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgccggtggtgctgtagctgtaactccgggtctggcgcgggctgctgatgcggatgagttcgccgttgtcgttccaggtgtaatcgcggtcagacagcaggctgttcaggtgctggctctgtaactgcccggca > 2:122917‑M2/1‑1 (MQ=255) ggcgatagggtgaaccggacaaatgctgagggtgcggtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttacctgccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgccggtggtgctgtagctgtaactccgggtctggcgcgggctgctgatgcggatgagttcgccgctgtcgttccaggtgtaatcgcggtcagacagcaggctgttcaggtgctggctctgtaactgcccggcag > 2:120841‑M2/1‑1 (MQ=255) 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6:454885‑M2/1‑1 (MQ=255) ggcgatacggttatccggccacatgctgagggtgctgtccgggtgcagctccgggtcgggcaggcggttaccggccgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattcgctgcggtggtgtgaacgccggtcagcctgccggtggtgctgtagctgtaactccgggtctggcgcgggctgctgatgcggatgagttcgccgttgtcgttccaggtgtaatcgcggtcagacagcaggctgttcaggtgctggctctgtaactgcccggc > 2:436400‑M2/1‑1 (MQ=255) | GGCGAACTCATCCGCATCAGCAGCCCGCGCCAGACCCGGAGTTACAGCTACAGCACCACCGGCAGGCTGACCGGCGTTCACACCACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGTGACGCGCACTATCTTTACCGGTATGACCGTCACGGCAGGCTGACAGAGAAAACCGACCTCATCCCGGAAGGGGTTATCCGCACGGATGATGAGCGGACTCACCGGTACCATTACGACAGTCAGCACCGGCTGGTGCACTACACGCGGACACAATATGAAGAGCCGCTGGTCGAAAGTCGCTATCTTTACGACCCGCTGGGCCGCAGGGTGGCAAAACGGGTGTGGCGGCGTGAACGGGACCTGACGGGCTGGATGTCGCTGTCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGGCTG > NC_000913/3621778‑3622293 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |