| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,657,599 | 0 | T | A | 6.7% | 878.9 / 40.3 | 255 | intergenic (+32/+387) | hdeD/arrS | acid‑resistance membrane protein/antisense sRNA ArrS, function unknown |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (107/130); new base A (9/8); total (116/139) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.18e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 267 total aligned reads displayed.
TGTGTTGCAGGGGTTATTCGCCTGATGAGTTGGTATCGTCAGCGTTCAATGAAAGGCAGCTGGCTACAGCTCGTTATTGGTGTGCTGGATATCGTCATTGCCTGGATATTCCTTGGTGCAACGCCGATGGTGTCTGTAACGCTGGTTTCCACACTGGTGGGAATTGAACTGATATTTAGCGCCGCCAGCCTGTTCAGCTTCGCCAGTTTGTTCGTTAAGCAGCAATAATTACCCCGGTTGTCACCCGGATCATAGTCACTTGATGTGACTATGATCCGATTAATACTCTCTCCGCTACGCAGTGTTGTAGATCAATTGCGCACTATCATTGAAATAATTACCTGCTAGTGATTATTTCAACCTACTGAATTTCATCTAATTTTTTTCACTCTATGGCAAATTAGCCATTTCAAACATTATCATGGCTGATATTTTCCGTAGTCAGGTTTAATGTTTTAAAAGTGCTGTGGGAAAGTGAACAAAGAGTTCCGTAAGCGTTGATGCTATGGGCGGTTAA > NC_000913/3657340‑3657856 | gttgtTGCACGGGTTGTTCTCCTTTTGACTTTGGTTCGTCGTGGTTCAATGAAAGTCAGCTGGTTATAGCTCGTTATTTGTTCGCTGGCTATCTTTCTTGCCTGGATATTCCTTGGTGCACTGCCGATGGGTTCTTTAACGCTGGTTTCCACACTGGTGGGAATTGAACTGATATTTATCGCCGCCAGCCTGTTCAGCTTCGCCAGTTTGTTCGTTAAGCAGCAATAATTACCCCGGTTGTCACCCGGATCATAGTCACTTGATGTGACTATGAt < 4:622477/273‑1 (MQ=255) 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ataatTACCCCGGTTGTCACCCGGATCATAGTCACTTGATGTGACTATGATCCGATTAATACTCTCTCCGCTACGCAGTGTTGTAGATCAATTGCGCACTATCATTGAAATAATTACCTGCTAGTGATTATTTCAACCTACTGAATTTc < 6:1539590/149‑1 (MQ=255) ttACCCCGGTTGTCACCCGGATCATAGTCACTTGATGTGACTATGATCCGATTAATACTCTCTCCGCTACGCAGTGTTGTAGATCAATTGCGCACTATCAtt > 7:769934/1‑102 (MQ=255) ttACCCCGGTTGTCACCCGGATCATAGTCACTTGATGTGACTATGATCCGATTAATACTCTCTCCGCTACGCAGTGTTGTAGATCAATTGCGCACTATCATTGAAATAATTACCTGCTAGTGATTATTTCAACCTACTGAATTTCATc < 5:208555/148‑1 (MQ=255) ttACCCCGGTTGTCACCCGGATCATAGTCACTTGATGTGACTATGATCCGATTAATACTCTCTCCGCTACGCAGTGTTGTAGATCAATTGCGCACTATCATTGAAATAATTACCTGCTAGTGATTATTTCAACCTACTGAATTTCATc > 6:208555/1‑148 (MQ=255) cGGTTGTCACCCGGATCATAGTCACTTGATGTGACTATGATCCGATTAATACTCTCTCCGCTACGCAGTGTTGTAGATCAATTGCGCACTATCATTGAAATAATTACCTGCTAGTGATTATTTCAACCTACTGAATTTCATCTAAtttt < 5:1091923/149‑1 (MQ=255) ttGTCACCCGGATCATAGTCACTTGATGTGACTATGATCCGATTAATACTCTCTCCGCTACGCAGTGTTGTAGATCAATTGCGCACTATCATTGAAATAATTACCTGCTAGTGATTATTTCAACCTACTGAATTTCATCTAAttttttt < 8:494550/149‑1 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cGGATCATAGTCACTTGATGTGACTATGATCCGATTAATACTCTCTCCGCTACGCAGTGTTGTAGATCAATTGCGCACTATCATTGAAATAATTACCTGCTAGTGATTATTTCAACCTACTGAATTTCATCTAATTTTTTTCACTCTAt < 8:1222232/149‑1 (MQ=255) aTCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCGATTAATACTCTCTCCGCTACGCAGTGTTGTAGATCAATTGCGCACTATCATTGAAATAATTACCTGCTAGTGattat > 7:1392822/1‑107 (MQ=39) aTCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCGATTAATACTCTCTCCGCTACGCAGTGTTGTAGATCAATGGCGCACTATCATTGAAATAATTACCTGCTAGTGattat < 8:1392822/107‑1 (MQ=38) tCATAGTCACTTGATGTGACTATGATCCGATTAATACTCTCTCCGCTACGCAGtgttgt < 8:677345/59‑1 (MQ=255) tCATAGTCACTTGATGTGACTATGATCCGATTAATACTCTCTCCGCTACGCAGtgttgt > 7:677345/1‑59 (MQ=255) tCATAGTCACATCAAGTGACTATGATCCGATTAATACTCTCTCCGCTACGCAGTGTTGTAGATCAATTGCGCACTATCATTGAAATAATTACCTGCTAGTGATTATTTCAACCTACTGAATTTCATCTAATTTTTTTCACTCTATGGCa > 6:1298669/1‑149 (MQ=255) tAGTCACATCAAGTGACTATGATCCGATTAATACTCTCTCCGCTACGCAGTGTTGTAGATCAATTGCGCACTATCATTGAAATAATTACCTGCTAGTGATTATTTCAACCTACTGAATTTCATCTAATTTTTTTCACTCTATGGCAAAt > 8:261584/1‑149 (MQ=255) gTCACTTGATGTGACTATGATCCGATTAATACTCTCTCCGCTACGCAGTGTTGTAGATCAATTGCGCACTATCATTGAAATAATTACCTGCTAGTGATTATTTCAACCTACTGAATTTCATCTAATTTTTTTCACTCTATGGCAAATTa > 5:515061/1‑149 (MQ=255) gTCACTTGATGTGACTATGATCCGATTAATACTCTCTCCGCTACGCAGTGTTGTAGATCAATTGCGCACTATCATTGAAATAATTACCTGCTAGTGATTATTTCAACCTACTGAATTTCATCTAATTTTTTTCACTCTATGGCAAATTa < 7:1008628/149‑1 (MQ=255) aCTTGATGTGACTATGATCCGATTAATACTCTCTCCGCTACGCAGTGTTGTAGATCAATTGCGCACTATCATGGAAATAATTACCTGCTAGTGATTATTTCAACCTACTGAATTTCATCTAATTTTTTTCa > 8:1014040/1‑131 (MQ=255) ttGATGTGACTATGATCCGATTAATACTCTCTCCGCTACGCAGTGTTGTAGATCAATTGCGCACTATCATTGAAATAATTACCTGCTAGTGATTATTTCAACCTACTGAATTTCATCTAATTTTTTTCACTCTATGGCaaa < 6:369143/141‑1 (MQ=255) | TGTGTTGCAGGGGTTATTCGCCTGATGAGTTGGTATCGTCAGCGTTCAATGAAAGGCAGCTGGCTACAGCTCGTTATTGGTGTGCTGGATATCGTCATTGCCTGGATATTCCTTGGTGCAACGCCGATGGTGTCTGTAACGCTGGTTTCCACACTGGTGGGAATTGAACTGATATTTAGCGCCGCCAGCCTGTTCAGCTTCGCCAGTTTGTTCGTTAAGCAGCAATAATTACCCCGGTTGTCACCCGGATCATAGTCACTTGATGTGACTATGATCCGATTAATACTCTCTCCGCTACGCAGTGTTGTAGATCAATTGCGCACTATCATTGAAATAATTACCTGCTAGTGATTATTTCAACCTACTGAATTTCATCTAATTTTTTTCACTCTATGGCAAATTAGCCATTTCAAACATTATCATGGCTGATATTTTCCGTAGTCAGGTTTAATGTTTTAAAAGTGCTGTGGGAAAGTGAACAAAGAGTTCCGTAAGCGTTGATGCTATGGGCGGTTAA > NC_000913/3657340‑3657856 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |