Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,888,030 | 0 | A | T | 5.0% | 855.1 / 25.2 | 242 | intergenic (‑39/+31) | rnd/fadD | ribonuclease D/acyl‑CoA synthetase (long‑chain‑fatty‑acid‑‑CoA ligase) |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (115/112); new base T (7/5); total (124/118) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.69e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.82e-01 |
Only 100 of 249 total aligned reads displayed.
CGGATCGCGCAGGATCGCTTTCAGCGGTGACCAGTCGGTGATCCCGAGTGGATCGATTAGCGCCAGATGCTCGCCATCGAAAAGTTGAATCAACCCCAGCTGCGGGTAATAAGTGCGCGTACGAACAAATTCAGTATCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCATCGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTTCTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAACCGGCGTCTGACGA‑CTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCGGTAACTCATCACGAAACTCCACCAGCTTCGGTACTTTGTATCCCGTGAGCTGACGGCGGCAAAAAGTCACCAGTGACTCTTCGGTAAGCGATGGATCTTTTTTCACTACGAAGATTTTCACCGCTTCACCACTGGAGCCGGAAGGTACGCCAACAGCCGCGAC > NC_000913/1887773‑1888300 | gCTTTCAGCGGTGACCAGTCGGTGATCCCGAGTGGATCGATTAGCGCCAGATGCTCGCCATCGAAAAGTTGAATCAACCCCAGCTGCGGGTAATAAGTGCGCGTACGAACAAATTCAGTATCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCATCGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTTCTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAACCGGCGTCTGACGA‑CTGACTTAACGCTc < 2:354794/274‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |