New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4228431 = | 193 (1.050) | 11 (0.060) | 8/248 | NT | 5.6% | coding (701/1632 nt) | yjbB | putative Na+/Pi‑cotransporter |
? | NC_000913 | 4228451 = | 182 (1.020) | coding (721/1632 nt) | yjbB | putative Na+/Pi‑cotransporter |
Only 100 of 230 total aligned reads displayed.
TGTACTGCTGACCGCGACTCTGACCGCCGCAGGCATTATCTCCTTCCCCGTGGCGCTCTGTCTGGTGATTGGTGCTAACCTCGGTTCCGGTCTGCTGGCAATGCTCAACAACAGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCTGGTGGGTAGCCTGATTATCCTGCCGTTTGTCCATTTGCTGGCAGAGACAATGGGGAAGTTGTCATTGCCAAAAGCGGAACTGGTGATCTATTTCCACGTCTTCTACAACCTTGTACGTTGCCTGGTCA > NC_000913/4228303‑4228598 | ttgtagaagacgtggaaatagatcaccagttccgcttttggcaatgacaacttccccattgtctctgccagcaaatggacaaacggcaggataatcaggctacccaccagcttaaacagcagactaccCAGCCCGCCGTGTCGCGCTgg > 2:51990‑M1/129‑149 (MQ=255) ttgtagaagacgtggaaatagatcaccagttccgcttttggcaatgacaacttccccattgtctctgccagcaaatggacaaacggcaggataatcaggctacccaccagcttaaacagcagactaccCAGCCCGCCGTGTCGCGCTgg > 4:1207095‑M1/129‑149 (MQ=255) tgTACTGCTGACCGCGACTCTGACCGCCGCAGGCATTATCTCCTTCCCCGTGGCGCTCTGTCTGGTGATTGGTGCTAACCTCGGTTCCGGTCTGCTGGCAATGCTCAACAACAGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTgg < 2:253317/149‑1 (MQ=255) tgTACTGCTGACCGCGACTCTGACCGCCGCAGGCATTATCTCCTTCCCCGTGGCGCTCTGTCTGGTGATTGGTGCTAACCTCGGTTCCGGTCTGCTGGCAATGCTCAACAACAGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTgg < 3:730832/149‑1 (MQ=255) tgtagaagacgtggaaatagatcaccagtttcgcttttggcaatgacaacttccccattgtctctgccagcaaatggacaaacggcaggataatcaggctacccaccagcttaaacagcagactaccCAGCCCGCCGTGTCGCGCTggg > 1:1112787‑M1/128‑149 (MQ=255) tgctgACCGCGACTCTGACCGCCGCAGGCATTATCTCCTTCCCCGTGGCGCTCTGTCTGGTGATTGGTGCTAACCTCGGTTCCGGTCTGCTGGCAATGCTCAACAACAGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGt > 2:1589415/1‑149 (MQ=255) gcgACTCTGACCGCCGCAGGCATTATCTCCTTCCCCGTGGCGCTCTGTCTGGTGATTGGTGCTAACCTCGGTTCCGGTCTGCTGGCAATGCTCAACAACAGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGtt > 4:881791/1‑149 (MQ=255) ctctGACCGCCGCAGGCATTATCTCCTTCCCCGTGGCGCTCTGTCTGGTGATTGGTGCTAACCTCGGTTCCGGTCTGCTGGCAATGCTCAACAACAGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAg < 2:1547717/149‑1 (MQ=255) gACCGCCGCAGGCATTATCTCCTTCCCCGTGGCGCTCTGTCTGGTGATTGGTGCTAACCTCGGTTCCGGTCTGCTGGCAATGCTCAACAACAGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtgg > 3:1540263/1‑149 (MQ=255) aCCGCCGCAGGCATTATCTCCTTCCCCGTGGCGCTCTGTCTGGTGATTGGTGCTAACCTCGGTTCCGGTCTGCTGGCAATGCTCAACACCAGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggt > 1:1137890/1‑149 (MQ=255) ccgccgCAGGCATTATCTCCTTCCCCGTGGCGCTCTGTCTGGTGATTGGTGCTAACCTCGGTTCCGGTCTGCTGGCAATGCTCAACAACAGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg < 4:437685/149‑1 (MQ=255) ccgccgCAGGCATTATCTCCTTCCCCGTGGCGCTCTGTCTGGTGATTGGTGCTAACCTCGGTTCCGGTCTGCTGGCAATGCTCAACAACAGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg < 3:40295/149‑1 (MQ=255) ccgccgCAGGCATTATCTCCTTCCCCGTGGCGCTCTGTCTGGTGATTGGTGCTAACCTCGGTTCCGGTCTGCTGGCAATGCTCAACAACAGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg > 1:573177/1‑149 (MQ=255) ccgccgCAGGCATTATCTCCTTCCCCGTGGCGCTCTGTCTGGTGATTGGTGCTAACCTCGGTTCCGGTCTGCTGGCAATGCTCAACAACAGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg > 3:1152746/1‑149 (MQ=255) cgcAGGCATTATCTCCTTCCCCGTGGCGCTCTGTCTGGTGATTGGTGCTAACCTCGGTTCCGGTCTGCTGGCAATGCTCAACAACAGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCTGGTGGGTa < 3:108965/149‑1 (MQ=255) cAGGCATTATCTCCTGCCCCGTGGCGCTCTGTCTGGTGATTGGTGCTAACCTCGGTTCCGGTCTGCTGGCAATGCTCAACAACAGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCTGGTGGGTAGc > 4:1246262/1‑149 (MQ=255) cATTATCTCCTTCCCCGTGGCGCTCTGTCTGGTGATTGGTGCTAACCTCGGTTCCGGTCTGCTGGCAATGCTCAACAACAGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCTGGTGGGTAGCCTGa < 2:1257815/149‑1 (MQ=255) tctcCTTCCCCGTGGCGCTCTGTCTGGTGATTGGTGCTAACCTCGGTTCCGGTCTGCTGGCAATGCTCAACAACAGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCTGGTGGGTAGCCTGATTATc < 1:1589415/149‑1 (MQ=255) tctcCTTCCCCGTGGCGCTCTGTCTGGTGATTGGTGCTAACCTCGGTTCCGGTCTGCTGGCAATGCTCAACAACAGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCTGGTGGGTAGCCTGATTATc < 3:560301/149‑1 (MQ=255) ccTTCCCCGTGGCGCTCTGTCTGGTGATTGGTGCTAACCTCGGTTCCGGTCTGCTGGCAATGCTCAACAACAGTGCCGCCGATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCTGGTGGGTAGCCTGATTATCCTg > 4:1001320/1‑149 (MQ=255) cTTCCCCGTGGCGCTCTGTCTGGTGATTGGTGCTAACCTCGGTTCCGGTCTGCTGGCAATGCTCAACAACAGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTgg > 1:596592/1‑107 (MQ=255) ttCCCCGTGGCGCTCTGTCTGGTGATTGGTGCTAACCTCGGTTCCGGTCTGCTGGCAATGCTCAACAACAGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCTGGTGGGTAGCCTGATTATCCTGcc > 2:1636274/1‑149 (MQ=255) ttCCCCGTGGCGCTCTGTCTGGTGATTGGTGCTAACCTCGGTTCCGGTCTGCTGGCAATGCTCAACAACAGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCTGGTGGGTAGCCTGATTATCCTGcc < 1:1636274/149‑1 (MQ=255) ccccGTGGCGCTCTGTCTGGTGATTGGTGCTAACCTCGGTTCCGGTCTGCTGGCAATGCTCAACAACAGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCTGGTGGGTAGCCTGATTATCCTGCCGt > 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tAACCTCGGTTCCGGTCTGCTGGCAATGCTCAACAACAGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCTGGTGGGTAGCCTGATTATCCTGCCGTTTGTCCATTTGCTGGCAGAGACAATGGGGa > 1:463093/1‑149 (MQ=255) acaaacggcaggataatcaggctacccaccagcttaaacagcagactaccCAGCCCGCCGTGTCGCGCTgg < 2:848741‑M1/21‑1 (MQ=255) acaaacggcaggataatcaggctacccaccagcttaaacagcagactaccCAGCCCGCCGTGTCGCGCTgg > 1:848741‑M1/51‑71 (MQ=255) cTCGATTCTGGTCTGCTGCCAATGCTCAGCAACAGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGCTAGTCTGCTGCTTAAGCTGGTGGGTAGCCTGATTATCCTGCCGTTTGTCCATTTGCTTGCAGACACAATGCGGAAGtt > 2:1653537/1‑149 (MQ=255) tCGGTTCCGGTCTGCTGGCAATGCTCAACAACAGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCTGGTGGGTAGCCTGATTATCCTGCCGTTTGTCCATTTGCTGGCAGAGACAATGGGGAAGTTg < 2:1356882/149‑1 (MQ=255) ttCCGGTCTGCTGGCAATGCTCAACAACAGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCTGGTGGGTAGCCTGATTATCCTGCCGTTTGTCCATTTGCTGGCAGAGACAATGGGGAAGTTGTCAt < 3:1242092/149‑1 (MQ=255) 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gCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCTGGTGGGTAGCCTGATTATCCTGCCGTTTGTCCATTTGCTGGCAGAGACAATGGGGAAGTTGTCATTGCCAAAAGCGGAACTGGTGATCTATTTCCACGtcttc < 2:423175/147‑1 (MQ=255) gCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCTGGTGGGTAGCCTGATTATCCTGCCGTTTGTCCATTTGCTGGCAGAGACAATGGGGAAGTTGTCATTGCCAAAAGTGGAACTGGTGATCTATTTCCACGTCTTCCACaa > 1:1228954/1‑149 (MQ=255) AGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCTGGTGTGTAGCCTGATTATCCTGCCGTTTGTCCATTTGCTGGCAGAGACAATg < 1:879251‑M1/91‑1 (MQ=255) AGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCTGGTGTGTAGCCTGATTATCCTGCCGTTTGTCCATTTGCTGGCAGAGACAATg > 2:879251‑M1/1‑91 (MQ=255) CCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCTGGTGGGTAGCCTGATTATCCTGCCGTTTGTCCATTTGCTGGCAGAGACAATGGGGAAGTTGTCATTGCCAAAAGCGGAACTGGTGATCTATTTCCACGTCTTCTACAACCtt > 3:782944‑M1/1‑149 (MQ=255) ccgccgTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCTGGTGGGTAGCCTGATTATCCTGCCGTTTGTCCATTTGCTGGCAGAGACAATGGGGAAGTTGTCATTGCCAAAAGCGGAACTGGTGATCTATTTCCACGTCTTCTACAACCTTg < 2:944633/149‑1 (MQ=255) cgccgTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCTGGTGGGTAGCCTGATTATCCCGCCGTTTGTCCATTTGCTGGCAGAGACAATGGGGAAGTTGTCATTGCCAAAAGCGGAACTGGTGATCTATTTCCACGtct < 1:192786/136‑1 (MQ=255) cgccgTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCTGGTGGGTAGCCTGATTATCCCGCCGTTTGTCCATTTGCTGGCAGAGACAATGGGGAAGTTGTCATTGCCAAAAGCGGAACTGGTGATCTATTTCCACGtct > 2:192786/1‑136 (MQ=255) gacacggcgggctgGGTAGTCTGCTGTTTAAGCTGGTGGGTAGCCTGATTATCCTGCCGTTTGTCCATTTGCTGGCAGAGACAATGGGGAAGTTGTCATTGCCAAAAGCGGAACTGGTGATCTATTTCCACGTCTTCTACAACCTTGTa < 2:1112787‑M2/135‑1 (MQ=255) ccgTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCTGGTGGGTAGCCTGATTATCCTGCCGTTTGTCCATTTGCTGGCAGAGACAATGGGGAAGTTGTCATTGCCAAAAGCGGAACTGGTGATCTATTTCCACGTCTTCTACACCCTTGTAc > 2:80216/1‑149 (MQ=255) tgtCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCTGGTGGGTAGCCTGATTATCCTGCCGTTTGTCCATTTGCTGGCAGAGACAATGGGGAAGTTGTCAt < 2:683930/95‑1 (MQ=255) cgcgCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCTGGTGGGTAGCCTGATTATCCTGCCGTTTGTCCATTTGCTGGCAGAGACAATGGGGAAGTTGTCATTGCCAAAAGTGGAACTGGTGATCTATTTCCACGTCTTCCACAACCTTGTACGTTGcc < 2:1228954/149‑1 (MQ=255) cgcgCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCTGGTGGGTAGCCTGATTATCCTGCCGTTTGTCCATTTGCTGGCAGAGACAATGGGGAAGTTGTCATTGCCAAAAGCGGAACTGGTGATCTATTTCCACGTCTTCTACAACCTTGTACGTTGcc < 1:1077952/149‑1 (MQ=255) cgcgCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCTGGTGGGTAGCCTGATTATCCTGCCGTTTGTCCATTTGCTGGCAGAGACAATGGGGAAGTTGTCATTGCCAAAAGCGGAACTGGTGATCTATTTCCACGTCTTCTACAACCTTGTACGTTGcc < 4:290438/149‑1 (MQ=255) cgcgCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCTGGTGGGTAGCCTGATTATCCTGCCGTTTGTCCATTTGCTGGCAGAGACAATGGGGAAGTTGTCATTGCCAAAAGCGGAACTGGTGATCTATTTCCACGTCTTCTACAACCTTGTACGTTGcc < 1:1539340/149‑1 (MQ=255) cgcgCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCTGGTGGGTAGCCTGATTATCCTGCCGTTTGTCCATTTGCTGGCAGAGACAATGGGGAAGTTGTCATTGCCAAAAGCGGAACTGGTGATCTATTTCCACGTCTTCTACAACCTTGTACGTTGcc < 1:792162/149‑1 (MQ=255) gcgcTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCTGGTGGGTAGCCTGATTATCCTGCCGTTTGTCCATTTGCTGGCAGAGACAATGGGGAAGTTGTCATTGCCAAAAGCGGAACTGGTGATCTATTTCCACGTCTTCTACAACCTTGTACGTTGCCt < 3:1424719/149‑1 (MQ=255) gcgcTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCTGGTGGGTAGCCTGATTATCCTGCCGTTTGTCCATTTGCTGGCAGAGACAATGGGGAAGTTGTCATTGCCAAAAGCGGAACTGGTGATCTATTTCCACGTCTTCTACAACCTTGTACGTTGCCt < 2:345781/149‑1 (MQ=255) gcgcTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCTGGTGGGTAGCCTGATTATCCTGCCGTTTGTCCATTTGCTGGCAGAGACAATGGGGAAGTTGTCATTGCCAAAAGCGGAACTGGTGATCTATTTCCACGTCTTCTACAACCTTGTACGTTGCCt < 2:147813/149‑1 (MQ=255) tgGGTAGTCTGCTGTTTAAGCTGGTGGGTAGCCTGATTATCCTGCCGTTTGTCCATTTGCTGGCAGAGACAATGGGGAAGTTGTCATTGCCAAAAGCGGAACTGGTGATCTATTTCCACGTCTTCTACAACCTTGTACGTTGCCTGGTc < 1:206993‑M2/147‑1 (MQ=255) | TGTACTGCTGACCGCGACTCTGACCGCCGCAGGCATTATCTCCTTCCCCGTGGCGCTCTGTCTGGTGATTGGTGCTAACCTCGGTTCCGGTCTGCTGGCAATGCTCAACAACAGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCTGGTGGGTAGCCTGATTATCCTGCCGTTTGTCCATTTGCTGGCAGAGACAATGGGGAAGTTGTCATTGCCAAAAGCGGAACTGGTGATCTATTTCCACGTCTTCTACAACCTTGTACGTTGCCTGGTCA > NC_000913/4228303‑4228598 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |