Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,888,032 | 0 | T | A | 7.0% | 590.5 / 24.1 | 170 | intergenic (‑41/+29) | rnd/fadD | ribonuclease D/acyl‑CoA synthetase (long‑chain‑fatty‑acid‑‑CoA ligase) |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (81/77); new base A (7/5); total (88/82) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.68e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
AGTGCGCGTACGAACAAATTCAGTATCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCATCGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTTCTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCGGTAACTCATCACGAAACTCCACCAGCTTCGGTACTTTGTATC > NC_000913/1887884‑1888179 | gTGCGCGTACGAACAAATTCAGTATCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCATCGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTTCTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTa > 1:994824/1‑149 (MQ=255) gcgTACGAACAAATTCAGTATCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCATCGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCCAATTGTTTTCTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAACACGCCGGATTAA‑CCg < 1:1158158/149‑1 (MQ=255) cgTACGAACAAATTCAGTATCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCATCGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTTCTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCgg < 2:793511/149‑1 (MQ=255) 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aaaaaaCGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCGGTAACTCATCACGAAACTCCACCAGCTTc > 3:930106/1‑149 (MQ=255) aaaaaaCGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCACAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCGGTAACTCATCACGAAACTCCACCAGCTTc > 1:1129374/1‑149 (MQ=255) aaaaaCGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCAc > 1:1467181/1‑80 (MQ=255) aaaaaCGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCAc < 2:1467181/80‑1 (MQ=255) gaCGCCGGTTAAT‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCGGTAACTCATCACGAAACTCCACCAGCTTCGGTa > 2:607385/2‑149 (MQ=255) gaCGCCGGTTAAT‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCGGTAACTCATCACGAAACTCCACCAGCTTCGGTa > 3:1671936/2‑149 (MQ=255) gaCGCCGGTTAAT‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCGGTAACTCATCACGAAACTCCACCAGCTTCGGTa > 4:1068022/2‑149 (MQ=255) gaCGCCGG‑TTAATCCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCGGTAACTCATCACGAAACTCCACCAGCTTCGGTa > 3:821627/2‑149 (MQ=255) caggATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGGCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCGGTAACTCATCACGAAGCTCCACCAGCTTCGGTACttt < 4:1447263/147‑1 (MQ=255) cGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAAttttt > 4:494478/1‑95 (MQ=255) cGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAAttttt < 3:494478/95‑1 (MQ=255) ttAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCGGTAACTCATCACGAAACTCCACCAGCTTCGGTACTTTGTATc < 1:230095/149‑1 (MQ=255) | AGTGCGCGTACGAACAAATTCAGTATCCAGGGCTATCGCCGGAAAGGCACGGACGGCTTCACACAAAGAAGCCAGCGCATCGTCCGTGGTAATCATTTGGTAATTCAAATTGTTTTCTCTTTAGTGGGCGTC‑AAAAAAAACGCCGGATTAA‑CCGGCGTCTGACGACTGACTTAACGCTCAGGCTTTATTGTCCACTTTGCCGCGCGCTTCGTCACGTAATTCTCGTCGCAAAATTTTTCCGACGTTAGATTTCGGTAACTCATCACGAAACTCCACCAGCTTCGGTACTTTGTATC > NC_000913/1887884‑1888179 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |