| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,373,177 | G→A | 5.2% | G96S (GGC→AGC) | arnF → | undecaprenyl phosphate‑alpha‑L‑ara4N exporter; flippase ArnEF subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,373,177 | 0 | G | A | 5.2% | 642.2 / 16.1 | 194 | G96S (GGC→AGC) | arnF | undecaprenyl phosphate‑alpha‑L‑ara4N exporter; flippase ArnEF subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (103/80); new base A (7/3); total (110/84) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.20e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.86e-01 | |||||||||||
Only 100 of 194 total aligned reads displayed.
CCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTAT > NC_000913/2373032‑2373324 | ccGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCt > 3:1256973/1‑149 (MQ=255)ccGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCt < 1:904718/149‑1 (MQ=255) gATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTggg > 4:1472216/1‑149 (MQ=255) tGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCt > 1:548886/1‑141 (MQ=255) tGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAggg > 3:701399/1‑149 (MQ=255) cTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACttt > 4:1276532/1‑149 (MQ=255) cTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACttt > 3:356682/1‑149 (MQ=255) cGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATGAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACttttt < 1:130124/149‑1 (MQ=255) ctgctgGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCt < 3:486139/149‑1 (MQ=255) ctgGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACtt < 2:863770/139‑1 (MQ=255) ctgGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACtt > 1:863770/1‑139 (MQ=255) tgGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGaaa < 3:503086/149‑1 (MQ=255) ggTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTgg < 2:1686363/126‑1 (MQ=255) ggTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTgg > 1:1686363/1‑126 (MQ=255) gTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGaaa < 2:1039792/146‑1 (MQ=255) ttATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCac > 2:546305/1‑149 (MQ=255) aTCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGaa < 4:790604/125‑1 (MQ=255) gCTTTCCGTTTTTTGTCGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTgg > 2:524552/1‑149 (MQ=255) tttCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTTAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGa < 2:1010382/149‑1 (MQ=255) tttCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTg < 2:1297888/146‑1 (MQ=255) tttCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTg > 1:1297888/1‑146 (MQ=255) tttCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGa > 2:915855/1‑149 (MQ=255) ttttttGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGcc > 4:389300/1‑149 (MQ=255) tttttGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCt < 2:284575/149‑1 (MQ=255) ttgttgGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGta < 1:713436/149‑1 (MQ=255) tgttgGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGtat < 4:1612029/149‑1 (MQ=255) tgttgGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGtat < 2:702178/149‑1 (MQ=255) gttgGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGtatt > 4:466917/1‑149 (MQ=255) ttgGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTg < 4:291331/121‑1 (MQ=255) ttgGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGtatta > 2:1499566/1‑149 (MQ=255) gTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGa < 3:792259/133‑1 (MQ=255) gTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGa > 3:536045/1‑149 (MQ=255) gTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGa > 4:20668/1‑149 (MQ=255) gTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGa > 3:99189/1‑149 (MQ=255) tataAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAg > 3:858101/1‑149 (MQ=255) tataAAACACTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAg > 3:1555057/1‑149 (MQ=255) ataAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGaaa > 2:380945/1‑119 (MQ=255) taAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGa > 3:810187/1‑146 (MQ=255) taAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGa < 4:810187/146‑1 (MQ=255) aaaaCGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCgg > 4:371460/1‑149 (MQ=255) aaaaCGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCgg < 4:1661932/149‑1 (MQ=255) aaaaCGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCgg < 4:361108/149‑1 (MQ=255) aaaaCGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCgg < 3:782803/149‑1 (MQ=255) aaaCGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGaa > 3:140161/1‑98 (MQ=255) aaaCGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGaa < 4:140161/98‑1 (MQ=255) aaaCGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCggg < 4:858101/149‑1 (MQ=255) aaCGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGt < 3:1465101/149‑1 (MQ=255) aCGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGtt < 2:1214394/149‑1 (MQ=255) aCGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGtt < 3:386905/149‑1 (MQ=255) gCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGa < 3:1620036/149‑1 (MQ=255) cTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGAt < 4:58953/149‑1 (MQ=255) aTAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTg > 3:1447608/1‑149 (MQ=255) tAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTACTATGAGCGGGTTGATGCTGa < 4:232789/149‑1 (MQ=255) cTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGAtttt > 1:367620/1‑149 (MQ=255) ttGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTc > 2:859198/1‑149 (MQ=255) ttGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTc > 1:152712/1‑149 (MQ=255) gcTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGc > 3:206282/1‑149 (MQ=255) cTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGcc > 2:1308479/1‑149 (MQ=255) cTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGcc < 1:115016/149‑1 (MQ=255) aaGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAgg < 3:1045319/78‑1 (MQ=255) aaGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAgg > 4:1045319/1‑78 (MQ=255) cAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATg > 3:32540/1‑118 (MQ=255) tGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGa > 3:1491953/1‑125 (MQ=255) cTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGAt > 2:1421676/1‑117 (MQ=255) cTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGAt < 1:1421676/117‑1 (MQ=255) ttGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTa > 2:1130167/1‑149 (MQ=255) tATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCt < 4:71812/120‑1 (MQ=255) gAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTcc > 2:577037/1‑149 (MQ=255) ttATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGtattat > 1:1551843/1‑90 (MQ=255) ttATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGtattat < 2:1551843/90‑1 (MQ=255) ttATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGTTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTg > 4:66682/1‑149 (MQ=255) ttATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGtt < 1:727221/99‑1 (MQ=255) ttATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGtt > 2:727221/1‑99 (MQ=255) ttATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTg > 1:137010/1‑149 (MQ=255) gTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTaca > 4:364579/1‑149 (MQ=255) tATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTacac < 1:1004042/149‑1 (MQ=255) gATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCt > 4:1373107/1‑99 (MQ=255) gATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCt < 3:1373107/99‑1 (MQ=255) gATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGcc > 2:812149/1‑149 (MQ=255) aTTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCg > 4:824318/1‑149 (MQ=255) cTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTcc > 4:1561083/1‑149 (MQ=255) ttCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTccc > 4:1356562/1‑149 (MQ=255) ttCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTccc > 2:445927/1‑149 (MQ=255) ttCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTccc > 4:37913/1‑149 (MQ=255) tCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCa < 4:536045/149‑1 (MQ=255) aTGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTcc < 1:178233/144‑1 (MQ=255) aTGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCGGCCACTTTACACTGCCGTTcc > 2:178233/1‑144 (MQ=255) tcccTTCCCAGCCGGGAAGTGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATc > 1:1001138/4‑149 (MQ=255) tcccTTCCCAGCCGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGTTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATc > 3:601035/4‑149 (MQ=255) tcccTTCCCAGCCGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATc > 4:307407/4‑149 (MQ=255) tACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCg > 2:1337757/1‑149 (MQ=255) aCTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCgg > 1:1339407/1‑149 (MQ=255) aCTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCgg > 4:937056/1‑149 (MQ=255) cTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCggg < 3:811673/149‑1 (MQ=255) ttCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCgggg > 2:618932/1‑149 (MQ=255) ttCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCgggg > 3:73069/1‑149 (MQ=255) ttCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCgggg > 1:390291/1‑149 (MQ=255) ttCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTACTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCATGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCgggg < 4:1239329/149‑1 (MQ=255) tCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGc > 3:1218390/1‑149 (MQ=255) ccGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCgggg > 1:770998/1‑146 (MQ=255) | CCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTACACTGCCGTTCCCACTCATCGGGGCTAT > NC_000913/2373032‑2373324 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |