Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,620,218 | T→A | 5.1% | intergenic (‑58/+28) | uraA ← / ← upp | uracil permease/uracil phosphoribosyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,620,218 | 0 | T | A | 5.1% | 487.6 / 12.3 | 137 | intergenic (‑58/+28) | uraA/upp | uracil permease/uracil phosphoribosyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (71/59); new base A (3/4); total (74/63) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.03e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.36e-01 |
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
GCACCAAACATGGCGAACAAATGTTGCAAACTAAGCGGGATTGTCTGTAAAAGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGATCAATCGATGCGGTATACAGTTCGACGTCCGGGTGCGCTTTTTCC > NC_000913/2620069‑2620366 | gCACCAAACATGGCGAACAAATGTTGCAAACTAAGCGGGATTGTCTGTAAAAGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑‑AAAAAAAGCCGACTCtt < 2:1322380/149‑1 (MQ=255) cACCAAACATGGCGAACAAATGTTGCAAACTAAGCGGGATTGTCTGTAAAAGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTAATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCtt > 3:1168190/1‑149 (MQ=255) tGGCGAACAAATGTTGCAAACTAAGCGGGATTGTCTGTAAAAGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTTTAAG‑AGTCGGc < 2:888689/149‑1 (MQ=255) gCGAACAAATGTTGCAAACTAAGCGGGATTGTCTGTAAAAGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATTGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCtt < 3:1175244/149‑1 (MQ=255) gCGAACAAATGTTGCAAACTAAGCGGGATTGTCTGTAAAAGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTTTAAG‑AGTCGGCtt < 4:1250729/149‑1 (MQ=255) gAACAAATGTTGCAAACTAAGCGGGATTGTCTGTAAAAGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTa > 3:354924/1‑149 (MQ=255) aaCAAATGTTGCAAACTAAGCGGGATTGTCTGTAAAAGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTTTAAG‑AGTCGGCttttt < 2:810419/149‑3 (MQ=255) aaCAAATGTTGCAAACTAAGCGGGATTGTCTGTAAAAGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACT‑TTAAGAGTCGGCttttt < 1:1297723/149‑3 (MQ=255) aCAAATGTTGCAAACTAAGCGGGATTGTCTGTAAAAGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAat > 1:552054/1‑149 (MQ=255) aCAAATGTTGCAAACTAAGCGGGATTGTCTGTAAAAGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAat > 3:14663/1‑149 (MQ=255) cAAATGTTGCAAACTAAGCGGGATTGTCTGTAAAAGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAatt > 1:638638/1‑149 (MQ=255) cAAATGTTGCAAACTAAGCGGGATTGTCTGTAAAAGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAatt > 3:810121/1‑149 (MQ=255) aaaTGTTGCAAACTAAGCGGGATTGTCTGTAAAAGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAatta < 3:1457177/149‑1 (MQ=255) aaTGTTGCAAACTAAGCGGGATTGTCTGTAAAAGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAattat > 2:991802/1‑149 (MQ=255) aTGTTGCAAACTAAGCGGGATTGTCTGTAAAAGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAattatt < 3:194820/149‑1 (MQ=255) ttGCAAACTAAGCGGGATTGTCTGTAAAAGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTAttttt > 1:1366314/1‑149 (MQ=255) tGCAAACTAAGCGGGATTGTCTGTAAAAGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTa < 2:249390/149‑1 (MQ=255) aaaCTAAGCGGGATTGTCTGTAAAAGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTCTTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTc > 3:587532/1‑129 (MQ=255) aaaCTAAGCGGGATTGTCTGTAAAAGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTc < 4:587532/129‑1 (MQ=255) gATTGTCTGTAAAAGTGGCGGTTTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTa < 2:833374/149‑1 (MQ=255) gATTGTCTGTAAAAGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTa > 1:1361756/1‑149 (MQ=255) gATTGTCTGTAAAAGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTa < 4:14663/149‑1 (MQ=255) tCTGTAAAAGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCaaa > 2:173543/1‑149 (MQ=255) gTAAAAGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTa > 2:1477380/1‑127 (MQ=255) aaaaGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGAttt < 1:107825/149‑1 (MQ=255) aaGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTg > 2:785835/1‑149 (MQ=255) gTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTc < 1:147513/149‑1 (MQ=255) ggTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCgg > 4:564741/1‑149 (MQ=255) ggTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCgg > 4:519389/1‑149 (MQ=255) tttCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATc < 3:1291570/149‑1 (MQ=255) actcacCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCgg < 3:568704/93‑1 (MQ=255) actcacCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCg > 4:868019/1‑149 (MQ=255) ctcacCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTTTAAG‑AGTCGGc < 1:1447190/93‑1 (MQ=255) acCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTa < 2:458671/118‑1 (MQ=255) acCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTa > 1:458671/1‑118 (MQ=255) acCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGc > 3:1677450/1‑149 (MQ=255) cccGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGccc > 3:498884/1‑149 (MQ=255) cGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTCAAAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCg < 2:1696809/149‑1 (MQ=255) gATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCgca < 2:1366314/149‑3 (MQ=255) gCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGaataa < 4:882748/149‑1 (MQ=255) cACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGaataat > 3:887946/1‑149 (MQ=255) cACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGaataat < 3:563489/149‑1 (MQ=255) cACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGaataat < 1:1685933/149‑1 (MQ=255) ggCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATc < 1:941899/128‑1 (MQ=255) gcgcGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTAt < 1:785835/149‑1 (MQ=255) gcgTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTAt > 4:1289529/1‑89 (MQ=255) gcgTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTAt < 3:1289529/89‑1 (MQ=255) gcgTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATcc < 2:632738/149‑1 (MQ=255) gTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGt > 4:678978/1‑149 (MQ=255) atCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGt < 1:306096/149‑1 (MQ=255) tCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTc > 2:271962/1‑149 (MQ=255) ccTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTcc < 4:1366127/149‑1 (MQ=255) ctctGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTccc > 1:1544103/1‑149 (MQ=255) tctGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTTA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATCTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCt > 4:1660563/1‑149 (MQ=255) tctGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCt < 2:897774/149‑1 (MQ=255) tctGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCt > 1:202823/1‑149 (MQ=255) tctGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCt > 1:1078349/1‑149 (MQ=255) tGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGa < 3:1299244/149‑1 (MQ=255) tGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGa < 4:354924/149‑1 (MQ=255) tGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGa < 1:465791/149‑1 (MQ=255) gTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGaataat > 2:1503133/1‑123 (MQ=255) gTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGaataat < 1:1503133/123‑1 (MQ=255) tattatGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCa < 3:378570/139‑1 (MQ=255) gtgtTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCa < 4:1688772/133‑1 (MQ=255) ttATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAGGATTTTGTCACCGGCATCGCCGATGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGATCAATCAATGc > 3:283589/1‑149 (MQ=255) ttATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGATCAATCGATGc < 4:1015052/149‑1 (MQ=255) ttATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGATCAATCGATGc < 1:991802/149‑1 (MQ=255) ttATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGATCAATCGATGc > 3:48296/1‑149 (MQ=255) ttATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGATCAATCGATGc < 2:1599410/149‑1 (MQ=255) ttATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGATCAATCGATGc < 4:439690/149‑1 (MQ=255) aGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGATCAATCGATGCGGta > 4:1002139/1‑149 (MQ=255) ggCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGATCAATCGATGCGGtat > 2:1206402/1‑149 (MQ=255) gcgcTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCTAGTCCCGGAATAATGTATCCTTGCTCGTTCAGTCCCTGATCAATTGATGTGGtata > 4:1200181/1‑149 (MQ=255) gcgcTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGATCAATCGATGCGGtata < 1:418137/149‑1 (MQ=255) gcgcTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTGATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGATCAATCGATGCGGtata < 2:352074/149‑1 (MQ=255) tttACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGATCAATCGATGCGGTATACAGt < 1:818118/149‑1 (MQ=255) tACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGATCAATCGATGCGGTATACAGTTc < 1:1206402/149‑1 (MQ=255) tC‑AAAAAAAAGCCGGCTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGt < 1:1282821/100‑1 (MQ=255) tC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTTACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGt > 2:1282821/1‑100 (MQ=255) tC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGATCAATCGATGCGGTATACAGTTCGAc > 1:1038588/1‑149 (MQ=255) c‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGATCAATCGATGc < 2:445022/133‑1 (MQ=255) taattaaaGCCGACTTTAAG‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGATCAATCGATGCGGTATACAGTTCGACGt > 3:882706/6‑149 (MQ=255) aaaaaaaaGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCt > 1:1174901/1‑119 (MQ=255) aaaaaaaaGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCt < 2:1174901/119‑1 (MQ=255) aaaaaaaaGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGATCAATCGATGCGGTATACAGTTCGACGt > 1:1165464/1‑149 (MQ=255) aaaaaaaaGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGATCAATCGATGCGGTATACAGTTCGACGt > 2:1173673/1‑149 (MQ=255) aaaaaaaaGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGATCAATCGATGCGGTATACAGTTCGACGt > 4:690250/1‑149 (MQ=255) aaaaaaaGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGATCAATCGATGCGGTATACAGTTCGACGTc > 3:555047/1‑149 (MQ=255) taaaGCCGACTTTAAG‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGATCAATCGATGCGGTATACAGTTCGACGTCCgg > 4:1340660/2‑149 (MQ=255) aaaGCCGACT‑TTAAGAGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGATCAATCGATGCGGTATACAGTTCGACGTCCggg > 2:426371/1‑149 (MQ=255) aaGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCAGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGATCAATCGATGCGGTATACAGTTCGACGTCCGGGt < 4:1168190/149‑1 (MQ=255) ccGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTAACCGTGCTCGTTCAGTCCCTGATCAATCGATGCGGTATACAGTTCGACGTCCGGGTgcg > 3:1596705/1‑149 (MQ=255) gACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGATCAATCGATGCGGTATACAGTTCGACGTcc > 4:1069228/1‑140 (MQ=255) gACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGATCAATCGATGCGGTATACAGTTCGACGTcc < 3:1069228/140‑1 (MQ=255) gACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGATCAATCGATGCGGTATACAGTTCGACGTCCGGGTGCGCt > 1:834946/1‑149 (MQ=255) tctTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGATCAATCGATGCGGTATACAGTTCGACGTCCGGGTGCGCtttt < 2:1165464/149‑1 (MQ=255) tctTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGATGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCACTGATCAACCAATGCGGTCTACAGTTCGACGTCCGGGTGCGCtttt > 4:602123/1‑149 (MQ=255) ttAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGATCAATCGATGc < 3:214161/116‑1 (MQ=255) ttAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGATCAATCGATGCGGTATACAGTTCGACGTCCGGGTGCGCTTTTTc < 4:249173/149‑1 (MQ=255) tAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGATCAATCGATGCGGTATACAGTTCGACGTCCGGGTGCGCTTTTTcc < 1:1626193/149‑1 (MQ=255) | GCACCAAACATGGCGAACAAATGTTGCAAACTAAGCGGGATTGTCTGTAAAAGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGATCAATCGATGCGGTATACAGTTCGACGTCCGGGTGCGCTTTTTCC > NC_000913/2620069‑2620366 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |