Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,620,220 | 0 | A | G | 5.0% | 459.3 / 9.6 | 139 | intergenic (‑60/+26) | uraA/upp | uracil permease/uracil phosphoribosyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (71/61); new base G (3/4); total (74/65) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.05e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.02e-01 |
Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
TGGCGAACAAATGTTGCAAACTAAGCGGGATTGTCTGTAAAAGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCTTTAATTATTTTTATTCTTTATTTCGTACCAAAGATTTTGTCACCGGCATCGCCGAGGCCCGGAATAATGTATCCGTGCTCGTTCAGTCCCTGATCAATCGATGCGGTATACAGTTCGACGTCCGGGTGCGCTTTTTCCAG > NC_000913/2620079‑2620368 | tGGCGAACAAATGTTGCAAACTAAGCGGGATTGTCTGTAAAAGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTTTAAG‑AGTCGGc < 2:888689/149‑1 (MQ=255) gCGAACAAATGTTGCAAACTAAGCGGGATTGTCTGTAAAAGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATTGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTCTTAA‑AGTCGGCtt < 3:1175244/149‑1 (MQ=255) gCGAACAAATGTTGCAAACTAAGCGGGATTGTCTGTAAAAGTGGCGGTCTTTCACTCACCCCGATAGCACGGCGCGTCATAGTATTATCCTCTGTATTATGTGTTATAGGCGCTTTACTC‑AAAAAAAAGCCGACTTTAAG‑AGTCGGCtt < 4:1250729/149‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |