| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,630,921 | 0 | A | T | 5.8% | 544.5 / 15.9 | 154 | intergenic (+56/+37) | yfgI/guaA | nalidixic acid resistance protein, putative periplasmic protein/GMP synthetase (glutamine aminotransferase) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (71/74); new base T (3/6); total (74/80) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.89e-01 | |||||||||||
Only 100 of 166 total aligned reads displayed.
GACGCCAACAGAAATATGACTGAAGGCGGTCGCGATCTGATGAAAAGCGTGGGCAAAGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTGCAGGGTCAAATCATTCCCACTCAATGGTAGCTGGCGGCTTGCCGCTGATGTCATACACCACGCGGGAAATACCGTTCACTTCATTGATAATGCGGTTGGAAACGCGACCGAGGAAATCGTAC > NC_000913/2630773‑2631069 | gACGCCAACAGAAATATGACTGAAGGCGGTCGCGATCTGATGAAAAGCGTGGGCAAAGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTgtagta > 3:1486510/1‑149 (MQ=255) gCCAACAGAAATATGACTGAAGGCGGTCGCGATCTGATGAAAAGCGTGGGCAAAGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACa > 1:1485081/1‑149 (MQ=255) cAACAGAAATATGACTGAAGGCGGTCGCGATCTGATGAAAAGCGTGGGCAAAGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACaga < 4:357256/149‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |