| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,577,660 | C→T | 5.5% | intergenic (‑68/+71) | gntK ← / ← gntR | gluconate kinase 2/d‑gluconate inducible gluconate regulon transcriptional repressor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,577,660 | 0 | C | T | 5.5% | 659.6 / 18.3 | 198 | intergenic (‑68/+71) | gntK/gntR | gluconate kinase 2/d‑gluconate inducible gluconate regulon transcriptional repressor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (88/99); new base T (4/7); total (92/106) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.49e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.42e-01 | |||||||||||
Only 100 of 199 total aligned reads displayed.
TTCACTGGCGACCGCAGATTTGCCGCTGCCCGATACGCCCATCAAGACGTAAATGTGGTGATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGTGAAACCTAAATCTAACATTTTCGGTGTCACAGATTCGCCACGAATACGC > NC_000913/3577512‑3577806 | tCACTGGCGACCGCAGATTTGCCGCTGCCCGATACGCCCATCAAGACGTAAATGTGGTGATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCg < 1:191967/149‑1 (MQ=255) cGCAGATTTGCCGCTGCCCGATACGCCCATCAAGACGTAAATGTGGTGATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCGGCTGGACAatgttac < 1:197445/149‑6 (MQ=255) cGCAGATTTGCCGCTGCCCGATACGCCCATCAAGACGTAAATGTGGTGATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCGGCTGGACAatgttac < 4:1586181/149‑6 (MQ=255) cAGATTTGCCGCTGCCCGATACGCCCATCAAGACGTAAATGTGGTGATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGaa < 3:1296625/149‑1 (MQ=255) cAGATTTGCCGCTGCCCGATACGCCCATCAAGACGTAAATGTGGTGATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGaa < 3:1487330/149‑1 (MQ=255) aGATTTGCCGCTGCCCGATACGCCCATCAAGACGTAAATGTGGTGATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAg < 4:1425508/149‑1 (MQ=255) gCTGCCCGATACGCCCATCAAGACGTAAATGTGGTGATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCGGCTGGACAatg < 2:3532/133‑2 (MQ=255) tGCCCGATACGCCCATCAAGACGTAAATGTGGTGATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATatccatc < 4:1140805/149‑1 (MQ=255) ccGATACGCCCATCAAGACGTAAATGTGGTGATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATccatccat < 3:1185293/149‑1 (MQ=255) gCCCATCAAGACGTAAATGTGGTGATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAatat > 2:1576318/1‑134 (MQ=255) ccATCAAGACGTAAATGTGGTGATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGaa > 1:435752/1‑125 (MQ=255) ccATCAAGACGTAAATGTGGTGATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAgt < 3:748587/149‑1 (MQ=255) ccATCAAGACGTAAATGTGGTGATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAgt > 4:360685/1‑149 (MQ=255) ccATCAAGACGTAAATGTGGTGATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAgt < 1:665804/149‑1 (MQ=255) ccATCAAGACGTAAATGTGGTGATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAgt > 1:1066766/1‑149 (MQ=255) aTCAAGACGTAAATGTGGTGATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAgtgt < 4:1474551/149‑1 (MQ=255) tCAAGACGTAAATGTGGTGATCATGGTTAGTCGTGCTCAAATTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGta > 1:934040/1‑149 (MQ=255) tCAAGACGTAAATGTGGTGATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGta > 3:1272804/1‑149 (MQ=255) aCGTAAATGTGGTGATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAgt < 3:982063/149‑1 (MQ=255) aCGTAAATATGGTGCTCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGCTAACTGTTATCGGTAACCTTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAgt < 3:1413668/149‑1 (MQ=255) aaaTGTGGTGATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGa < 3:1634849/149‑1 (MQ=255) aaaTGTGGTGATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGa < 4:1066746/149‑1 (MQ=255) tggtgATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTAc < 3:267606/149‑1 (MQ=255) tggtgATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTAc > 1:1084586/1‑149 (MQ=255) gATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCTAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGa > 2:1465344/1‑140 (MQ=255) aTCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCaa < 4:908793/149‑1 (MQ=255) tCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTaa < 2:783034/124‑1 (MQ=255) tCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTaa > 1:783034/1‑124 (MQ=255) aTGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTaa > 1:908697/1‑122 (MQ=255) aTGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTaa < 2:908697/122‑1 (MQ=255) aTGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAAtt > 1:628732/1‑149 (MQ=255) tGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAAttt < 3:636906/149‑1 (MQ=255) gTTAGTCGTGCTCAAAGTGTTGCCCCAACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTtgt < 2:108876/149‑1 (MQ=255) gTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTtgt < 1:535956/149‑1 (MQ=255) ttAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTtgtg < 1:457077/149‑1 (MQ=255) tAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTgg < 3:385075/149‑1 (MQ=255) aGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTggg < 4:780643/149‑1 (MQ=255) gTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGc < 4:1555779/149‑1 (MQ=255) tCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCt < 4:322116/149‑1 (MQ=255) tCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCt > 1:584587/1‑149 (MQ=255) gCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTaaa < 1:1496419/149‑1 (MQ=255) cTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAAt > 2:887485/1‑149 (MQ=255) tCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATa > 1:56598/1‑149 (MQ=255) tCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATa > 1:275490/1‑149 (MQ=255) cAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAg < 2:275490/149‑1 (MQ=255) aaaGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGACGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAATGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGTCTTAAATAGa > 3:1011871/1‑149 (MQ=255) aaaGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGa < 1:1126344/149‑1 (MQ=255) aaGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGAt < 1:1456730/149‑1 (MQ=255) aaGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGAt < 2:934040/149‑1 (MQ=255) tggtgCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCg < 2:828028/149‑1 (MQ=255) gCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAat < 2:1414943/81‑1 (MQ=255) gCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAGTATCTATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCg > 3:1223811/1‑149 (MQ=255) ccccACAATACAAGAATTAAAAATGTTAAGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGt > 3:1079411/1‑149 (MQ=255) cccACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTg > 1:1663679/1‑149 (MQ=255) cccACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTg > 3:531438/1‑149 (MQ=255) cccACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTg > 2:1054865/1‑149 (MQ=255) ccACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATaa < 2:1241297/102‑1 (MQ=255) cacaATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGAc < 3:144266/149‑1 (MQ=255) tACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGt < 2:558993/149‑1 (MQ=255) tACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGt < 4:1223811/149‑1 (MQ=255) cAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGTGa > 4:659075/1‑149 (MQ=255) cAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGTGa > 1:815614/1‑149 (MQ=255) aaGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGTGaa > 4:376475/1‑149 (MQ=255) aaGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGTGaa > 2:1542887/1‑149 (MQ=255) aaGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGTGaa > 4:582866/1‑149 (MQ=255) aaGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGTGaa > 1:1263599/1‑149 (MQ=255) aaGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGGTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAACGTGaa > 3:1183254/1‑149 (MQ=255) gAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAg > 1:1572619/1‑84 (MQ=255) gAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGTGAAAc < 1:1578088/149‑1 (MQ=255) aaTTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATcc < 4:544251/128‑1 (MQ=255) aaTTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATcc > 3:544251/1‑128 (MQ=255) aaTTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGTGAAAcc > 3:1372465/1‑149 (MQ=255) aaaaTGTTACGGGTAACTGGTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGTGAAACCTAAAt > 1:411788/1‑149 (MQ=255) tcttACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGTGAAACCTAAATCTaa < 4:1079411/147‑1 (MQ=255) tGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGTGAAACCTAAATCTaa < 1:1054865/149‑1 (MQ=255) gTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGTGAAACCTAAATCTAAc > 4:611191/1‑149 (MQ=255) tttcGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGt > 3:1121275/4‑124 (MQ=255) ggTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGTGAAACCTAAATCTAACATTTTc < 2:1066766/149‑1 (MQ=255) ggTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGTGAAACCTAAATCTAACATTTTc < 2:1590935/149‑1 (MQ=255) gTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGTGAAACCTAAATCTAACATTTTCg < 1:86609/149‑1 (MQ=255) gTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGTGAAACCTAAATCTAACATTTTCg > 2:1709371/1‑149 (MQ=255) gTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGTGAAACCTAAATCTAACATTTTCg > 2:41929/1‑149 (MQ=255) tAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGTGAAACCTAAATCTAACATTTTCgg > 1:345164/1‑149 (MQ=255) aaCTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGTGAAACCTAAATCTAACATTTTCGgt < 2:1485963/149‑1 (MQ=255) aaCTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGTGAAACCTAAATCTAACATTTTCGgt < 2:584587/149‑1 (MQ=255) tGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGTGAAACCTAAATCTAACATTTTCGGTGTc > 1:1046552/1‑149 (MQ=255) ttATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGGCTTAAGTGta < 4:1188938/63‑1 (MQ=255) tCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGTGAAACCTAAATCTAACATTTTCGGTGTCACAGa > 3:771651/1‑149 (MQ=255) tCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGTGAAACCTAAATCTAACATTTTCGGTGTCACAGa < 3:1619238/149‑1 (MQ=255) gTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGta < 3:219002/57‑1 (MQ=255) gTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGta > 4:219002/1‑57 (MQ=255) gTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTgg > 1:1466542/1‑84 (MQ=255) gataTTGTCCGGCTGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAAt > 2:616180/4‑90 (MQ=255) taTTGTCCGGCTGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGAt > 4:1457665/2‑92 (MQ=255) cATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGTGAAACCTAAATCTAACATTTTCGgt < 2:1625093/134‑1 (MQ=255) cATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGTGAAACCTAAATCTAACATTTTCGgt > 1:1625093/1‑134 (MQ=255) cATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGTGAAACCTAAATCTAACATTTTCGGTGTCACAGATTCGCCa > 3:1665364/1‑149 (MQ=255) aTTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGTGAAACCTAAATCTAACATTTTCGGTGTCACAGATTCGCCAc > 3:1464282/1‑149 (MQ=255) aTTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGTGAAACCTAAATCTAACATTTTCGGTGTCACAGATTCGCCAc > 2:1137413/1‑149 (MQ=255) aGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGTGAAACCTAAATCTAACATTTTCGGTGTCACAGATTc > 1:1416342/1‑137 (MQ=255) | TTCACTGGCGACCGCAGATTTGCCGCTGCCCGATACGCCCATCAAGACGTAAATGTGGTGATCATGGTTAGTCGTGCTCAAAGTGGTGCCCCCACAATACAAGAATTAAAAATGTTACGGGTAACTGTTATCGGTAACATTGTCCAGCCGGACAATATCAGAAGCAATATCCATCCATGCCTTAAGTGTATAAGTGTGAGCTACTTCAAATTTGTGGGCTTAAATAGATCCGCCCGGTGACAAGGTGAAACCTAAATCTAACATTTTCGGTGTCACAGATTCGCCACGAATACGC > NC_000913/3577512‑3577806 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |