New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 916053 = | 111 (0.810) | 3 (0.020) | 3/510 | 11.8 | 2.3% | intergenic (‑6/‑420) | aqpZ/ybjD | aquaporin Z/putative OLD family ATP‑dependent endonuclease; DUF2813 family protein |
? | NC_000913 | 923904 = | 148 (1.100) | coding (641/2277 nt) | clpA | ATPase and specificity subunit of ClpA‑ClpP ATP‑dependent serine protease, chaperone activity | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
ACAACCTGGGCAATTACGTAGCCAACGACTTCTTTTGCCGGAAAACGTCCGCCAGCCCATAAACCAATAGTGACCGCCGGGTTAAAATGACCACCAGAAATATGACCAACAGCAAAGGCCATCGTCAGAACGGTCAGACCGAACGCCAACGCCACGCCGGCAAAACCAATGCCTAATTCCGGGAAGCCTGCGGCCAGTACAGCACTACCACAGCCACCAAAAACAAGCCAGAAAGTACCAAAACATTCAGCTGCTAATTTTCTGAACATATCCACCACAATTAAAAATTGACCCTGTGAAAAATATGGTCGTTTTATAGGGTCGTCGTAAAAAAGTGACGACGGAAATAATGCGCGGCTATTTTAAAAACGAAGGCGAGTCATTCACCAGATAAATAAATCCAGTAAATTTGATTTAGGGCAACAGCGGGTTGCCCCATATAGTCATTTGTCTGATTGACAGTGTAGTGCACGCAAAAGATTTAATCCTTTAGGCGTAATAAAAAATAATTTATCATGCTAATTATTTGATTTTGTTGTTTTTGCA > NC_000913/915779‑916324 | caaaCCAGGGCAATTACGTACACACTGACGTCCTTTGCCCGAAAACTGCCGCAAGCCCATAAACCAACAGTGACCGCCGGGTTAAAATGACCACCAGAAATATGACCCACAGCAAAGGCCATCGTCAGAACGGTCCGACCGAACGCCAACGCCACGCCGGCAAAACCAATGCCTAATTCCGGGAAGCCTGCGGCCAGTACAGCACTACCACAGCCACCAAAAACAAGCCAGAAAGTACCAAAACATTCAGCTGCTAATTTTCTGAACATATccac < 2:442780/273‑1 (MQ=255) aCAACCTGGGCAATTACGTAGCCAACGACTTCTTTTGCCGGAAAACGTCCGCCAGCCCATAAACCAATAGTGACCGCCGGGTTAAAATGACCACCAGAAATATGACCAACAGCAAAGGCCATCGTCAGAACGGTCAGACCGAACGCCAACGCCACGCCGGCAAAACCAATGCCTAATTCCGGGAAGCCTGCGGCCAGTACAGCACTACCACAGCCACCAAAAACAAGCCAGAAAGTACCAAAACATTCAGCTGCTAATTTTCTGAACATATccac > 1:115540/1‑275 (MQ=255) aaCCAGGCCAAGTCCGTAACCAACCAATTCCTTTGCCAAAAAGCGTCCGCCAGCCCAAAAACCAAAAGTGACCGCCGGGTTAAAATGACCACCAGAAATATGACCAACAGCAAAGGCCATCGTCAGAACGGTCAGACCGAACGCCAACGCCACGCCGGCAAAACCAATGCCTAATTCCGGGAAGCCTGCGGCCAGTACAGCACTACCACAGCCACCAAAAACAAGCCAGAAAGTACCAAAACATTCAGCTGCTAATTTTCTGAACATATccacca < 3:621053/275‑1 (MQ=255) ccTGGGCAATTACGTAGCCAACGACTTCTTTTGCCGGAAAACGTCCGCCAGCCCATAAACCAATAGTGACCGCCGGGTTAAAATGACCACCAGAAATATGACCAACAGCAAAGGCCATCGTCAGAACGGTCAGACCGAACGCCAACGCCACGCCGGCAAAACCAATGCCTAATTCCGGGAAGCCTGCGGCCAGTACAGCACTACCACAGCCACCAAAAACAAGCCAAAAAGTACCAAAAACTTCAGCTGCTAATTTTCTGAACATAACcaacac > 3:520012/1‑274 (MQ=255) ggCAATTACGTAGCCAACGACTTCTTTCGCCGGAAAACGTCCGCCAGCCCATAAACCAATAGTTACCGCCGGGTTAAGATGACCACCAGCAATATGCCCAACAGCAAAGGCCATCGTCAGAACGGTCAGACCGAACGCCAACGCCACGCCGGCAAAACCAATGCCTAATTCCGGGAAGCCTGCGGCAAGTACAGCACTACCACAGCCACCAAAAACAAGCCAGAAAGTACCAAAACATTCAGCTGCTAATTTTCTGAACATATCCACCACAATTa < 1:763911/275‑1 (MQ=255) ttACGTAGCCAACGACTTCTTTTGCCGGAAAACGTCCGCCAGCCCATAAACCAATAGTGACCGCCGGGTTAAAATGACCACCAGAAATATGACCAACAGCAAAGGCCATCGTCAGAACGGTCAGACCGAACGCCAACGCCACGCCGGCAAAACCAATGCCTAATTCCGGGAAGCCTGCGGCCAGTACAGCACTACCACAGCCACCAAAAACAAGCCAGAAAGTACCAAAACATTCAGCTGCTAATTTTCTGAACATATCCACCACAATTAAAAAt > 3:132157/1‑275 (MQ=255) ttACGTAGCCAACGACTTCTTTTGCCGGAAAACGTCCGCCAGCCCATAAACCAATAGTGACCGCCGGGTTAAAATGACCACCAGAAATATGACCAACAGCAAAGGCCATCGTCAGAACGGTCAGACCGAACGCCAACGCCACGCCGGCAAAACCAATGCCTAATTCCGGGAAGCCTGCGGCCAGTACAGCACTACCACAGCCACCAAAAACAAACCAGAAAGTACCAAAACATTCATCTCCTAATTTTCTGAACATATCCACCACAATTAAAAAt > 1:632127/1‑275 (MQ=255) tACGTAGCCAACGACTTCTTTTGCCGGAAAACGTCCGCCAGCCCATAAACCAATAGTGACTGCCGGGTTAAAATGACCACCAGAAATTTGACCAACAGCAAAGGCCATCGTCAGAACGGTCAGACTGAACGCCAACGCCACGCCGGCAAAAACAATGCCTAATTCCGGGAAACCTGCGGCCATGACAGCACTACCACAGCCACCAAAAACAAACCAGAAAATACCCACACACTACGCTGACAATTTTCTAAACAAATACACCACAAATcaaaaac > 3:659986/1‑273 (MQ=255) tACGTAGCCAACGACTTCTTTTGCCGGAAAACGTCCGCCAGCCCATAAACCAATAGTGACCGCCGGGTTAAAATGACCACCAGAAATATGACCAACAGCAACGGCCATCGTCAGAACGGTCAGACCGAACGCCAACGCCACGCCGGCAAAACCAATGCCTAATTCCGGGAAGCCTGCGGCCAGTACAGCACTACCACCGCCACCAAAAACAAGCCAGACAGTACCAAAACATTCAGCAGCCAATGTTATGAACATAACAAACACAATTAAAAAtt > 3:596267/1‑275 (MQ=255) tAGCCAACGACTTCTTTTGCCGGAAAACGTCCGCCAGCCCATAAACCAATAGTGACCGCCGGGTTAAAATGACCACCAGAAATATGACCAACAGCAAAGGCCATCGTCAGAACGGTCAGACCGAACGCCAACGCCACGCCGGCAAAACCAATGCCTAATTCCGGGAAGCCTGCGGCCAGTACAGCACTACCACAGCCACCAAAAACAAGCCAGAAAGTACCAAAACATTCAGCTGCTAATTTTCTGAACATATCCACCACAATTAAAAATTGAcc < 1:555502/275‑1 (MQ=255) 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ttggCCGGAAAAAGTCCGCCAGCCCATAAACCAATAGTGACCGCCGGGTTAAAATGACCACCAGAAATATGACCAACAGCAAAGGCCATCGTCAGAACGGTCAGACCGAACGCCAACGCCACGCCGGCAAAACCAATGCCTAATTCCGGGAAGCCTGCGGCCAGTACAGCACTACCACAGCCACCAAAAACAAGCCAGAAAGTACCAAAACATTCAGCTGCTAATTTTCTGAACATATCCACCACAATTAAAAATTGACCCTGTGAAAAATATgg < 2:203258/272‑1 (MQ=255) tGCCGGAAAACGTCCGCCAGCCCATAAACCAATAGTGACCGCCCAGTTAAAATGAACACCAGAAATATGACCAACAGCAAAGACCATCGTCAGAACGGTCAGACCGAACGCCAACGCCACTCCGGCAAAACCAATGCCTAATTCCGGGAAGCCTGCGGCCAGTACAGCACTACCACAGCCACCAAAAACAAGCCAGAAAGTACCAAAACATTCAGCTGCTAATTTTCTGAACATATCCACCACAATTAAAAATTGACCCTGTGAAAAATATGGTc < 2:352772/275‑1 (MQ=255) aacgcgAAAACGACCGCCAGCCCATAAACCAAAAGAGACCGCCAGGTTAAAATGACCACCAGAAAAATGACCAACAGCAAAGGCCATCGTCAGAACGGTCAGACCGAACCCCAACGCCACGCCGGCAAAACCAATGCCTAATTCCGGAAAGCCTGCGGCCAGTACAGCACTACCACAGCCACCAAAAACAAGCCAGAAAGTACCAAAACATTCAGCTGCTAATTATCTGAACATATCCACCACAATTAAAAATTGACCCTGTGAAAAATATGGTc < 3:135374/270‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |