| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1769517 = | 100 (0.730) | 4 (0.030) | 3/498 | 11.6 | 3.9% | coding (444/1113 nt) | ydiK | UPF0118 family inner membrane protein |
| ? | NC_000913 | = 1769513 | 99 (0.750) | coding (440/1113 nt) | ydiK | UPF0118 family inner membrane protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
GGCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTATTGCTTTGCTGGTTAACAGTATCGTCGACGGCAGCGGCCCGCTAATTAAAGCCATTTCCAGCGGTGACATGACGTTACCCGATCTGGCGTGGCTTAATACCATTCCGGTGATTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGCTGGATATGGGGGGGACGGCGATCATGGCGAAAGTCCGCCCTTATATTGGCA‑CCACCACCACCTGGTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCGGGCGCTTTATGGTGCATTGTGCGCTGATGCTTCTCTTCAGTGCCCTGCTGTACTGGCGCGGTGAACAGGTGGCACAAGGCATTCGCCATTTTGCAACCCGTCTGGCAGGCGTTCGCGGAGATGCCGCCGTGCTGCTGGCGGCACAGGCTATCCGCGCGGTGGCGCTGGGTGTGGTGGTGACGGCGTTAGTACAGGCAGTGCT‑TGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTA > NC_000913/1769254‑1769787 | ggCCGCCGTTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTATTGCTTTGCTGGTTAACAGTATCGTCGACGGCAGCGGCCCGCTAATTAAAGCCATTTCCAGCGGTGACATGACGTTACCCGATCTGGCGTGGCTTAATACCATTCCGGTGATTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGCTGGATATGGGGGGGACGGCGATCATGGCGAAAGTCCGCCCTTATATTGGCA‑CCACCACCACCTg < 1:6641/275‑1 (MQ=255)ggCCGCCGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTATTGCTTTGCTGGTTAACAGTATCGTCGACGGCAGCGGCCCGCTAATTAAAGCCATTTCCAGCGGTGACATGACGTTACCCGATCTGGCGTGGCTTAATACCATTCCGGTGATTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGCTGGATATGGGGGGGACGGGGATCATGGCGAAAGGCCGCCCTTATATTGGAa‑ccaccgcccccgc > 2:446518/1‑273 (MQ=255) gccgccGCTCTCTCGCCGTTCTGGTGATGACGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTATTGCTTTGCTGGTTAACAGTATCGTCGACGGCAGCGGCCCGCTAATTAAAGCCATTTCCAGCGGTGACATGACGTTACCCGATCTGGCGTGGCTTAATACCATTCCGGTGATTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAAATTGCCGGATATGGGGGGGTCGGGGATCCTGGCGAAAGTCCGCCCTTATATTGGCA‑CCACCCCCACCTgg > 2:237061/1‑275 (MQ=255) atgaCGCTGTTATTAGTGCTGGTATTTATCATCCCTATTGATTTGCTGGTTAACAGTATCGTCGAAGGCAACGGCCCGCTAATTAAAGCCATTTCCAGCGGTGACATGACGTTACCCGATCTGGCGTGGCTTAATACCATTCCGGTGATTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGCTGGATATGGGGGGGACGGCGATCATGGCGAAAGTCCGCCCTTATATTGGCA‑CCACCACCACCTGGTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCgg < 1:717171/275‑1 (MQ=255) atgaCGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTATTGCTTTGCTGGTTAACAGTATCGTCGACGGCAGCGGCCCGCTAATTAAAGCCATTTCCAGCGGTGACATGACGTTAACCGATCTGGCGTGGCTTAATACCATTCCGGTGATTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGGTGGCACAACTTGCTGGAGATGGGGGGGGCGGGGATCATGGCGAAAGTCCGCCCTTATCTGGGCA‑GCCACACATCCTGGCTCGTGGGGCAgggggggacgttggg > 4:168246/1‑265 (MQ=255) ggaCGCTTTTTTTAGTGTTGGTGTGTATCATGCCTATTGCTTGGCTGGTTAACAGTACCGTCGACGGCAGCGGCCCGCTAATTAAGGCATTTTCCCGCGGTGAAAGGACGTTACCCGATTTGGCGTGGCTTAATACCATTCCGGTGATTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGCTGGATATGGGGGGGACGGCGATCATGGCGAAAGTCCGCCCTTATATTGGCA‑CCACCACCACCTGGTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCggg < 4:237061/274‑1 (MQ=255) gaCGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTATTGCTTTGCTGGTTAACAGTATCGTCGACGGCAGCGGCCCGCTAATTAAAGCCATTTCCAGCGGTGACATGACGTTACCCGATCTGGCGTGGCTTAATACCATTCCGGTGATTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGCTGGATATGGGGGGGACGGCGATCATGGCGAAAGTCCGCCCTTATATTTGCA‑CCACCACCACCTGGTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCGGgc > 1:314457/1‑275 (MQ=255) gaCGCTGTTATTAGTGATGGTGTTTATCATCCCTATTGCTTTGCTGGTTAACAGTATCGTCGACGGCAGCGGCCCGCTAATTAAAGCCATTTCCAGCGGTGACATGACGTTACCCGATCTGGCGTGGCTTAATACCATTCCGGTGATTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGCTGGATATGGGGGGGACGGCGATCATGGCGAAAGTCCGCCCTTATATTGGCA‑CCACCACCACCTGGTTCGTTGGGCCGGCGGCGCATATCGGgc > 1:60239/1‑275 (MQ=255) aCGCTGTTAGTAGTGTGGGTTGTTCTCGTCGCTAGTGCCTTGCTGGTCAACGGTATCGTCGACGGCAGCGGCCCGCTAATTAAAGCCATTTCCAGCGGGGACATGACGTTGCCCGATCTGGCGTGGCGTAATACCATTCCGGTGATTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGCTGGATATGGGGGGGACGGCGATCATGGCGAAAGTCCGCCCTTATATTGGCA‑CCACCACCACCTGGTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCGGgcg < 4:478312/275‑1 (MQ=255) gCTGGTAGTAGTGAGGGTGTTCATGATCCTATTTGACTTGCGGGTTACCGTGATCGTCAACGGCGGCGGCCCGGGACGTAAAGCCAGATCCATGGGTGGCAGGACGTTACCCGATCTGGCGTAGCTTAATACCATTCCGGAGATTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGCTGGATAGGGGGGGGACGGCGATCATGGCGAAAGTCCGCCCTTATATTGGCA‑CCACCACCACCTGGTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCGGGCGCt < 4:290108/275‑1 (MQ=255) ttagggtGGTGTTTATCATCCCTATTGCTTTGCTGGTTAACAGGCTCGGCGACGGCGGCGGCCCGCTGATTAAAGCAATGTCCAGCGGGGACATGACGTTACCCGATCTGGCGTGGCTTAATACCATTCCGGTGATTGGGGCGAAGGTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGCTGGATATGGGGGGGACGGCGATCATGGCGAAAGTCCGCCCTTATATTGGCA‑CCACCACCACCTGGTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCGGGCGCTTTATGGt < 3:757322/268‑1 (MQ=255) tagggatgtgttttAGCATCCCTATTGCTTTGCTGGTTAACAGTATCGTCGACGGCAGCGTCCCGCTAATTAAAGCCATTTCCAGCGGTGACATGACGTTAACCGTTCTGGCGTGGCTTAATACCATTCCGGTGATTGGCGGGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGCTTGATGTGGGGGGGACGGCGATCATGGCGAAAGTCCGCCCTTATATTGGCG‑CCACCACCACCTGGTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCGGGCGCTTTATGGt < 3:664564/263‑1 (MQ=255) taGTGTTGGTGTTTAGCAGCCCTATTGCTTTGCTGGTTAACAGTATCGTCGACGGCAGCGGCCCGCTAATTAAAGCCATTTCCAGCGGTGACATGACGTTACCCGATCTGGCGTGGCTTAATACCATTCCGGTGATTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGCTGGATATGGGGGGGACGGCGATCATGGCGAAAGTCCGCCCTTATATTGGCA‑CCACCACCACCTGGTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCGGGCGCTTTATGGt < 1:443826/274‑1 (MQ=255) 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tGGTGTTTATCATCCCTATTGCTTTGCTGGTTAACAGTATCGTCGACGGCAGCGGCCCGCTAATTAAAGCCATTTCCAGCGGTGACATGACGTTACCCGATCTGGCGTGGCTTAATACCATTCCGGTGATTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGCTGGATATGGGGGGGACGGCGATCATGGCGAAAGTCCGCCCTTATATTGGAA‑CCACCACCACCTGGTCCGTTGGGCAGGCGGCGCGTATCGGGCGCGTTATGGGCCATtgt > 2:560205/1‑275 (MQ=255) tGGTGTTTATCATCCCTATTGCTTTGCTGGTTAACAGTATCGTCGACGGCAGCGGCCCGCTAATTAAAGCCATTTCCAGCGGTGACATGACGTTACCCGATCTGGCGTGGCTTAATACCATTCCGGTGATTGGCGCGAAGCCGTATGCAGGCTGGCACAATTTGGTGGATATGGGGGGGACGGCGATCATGGCGATAGTCCGCCCTTATATTGGCA‑CCACCACCACCCGGTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCGGGCGCTTTACGGTGCAtt > 1:26452/1‑273 (MQ=255) gtTCATCGTCCCGATTGCTTTGATGGTTACCAGTCTCGTCGACGGCAGCGGCCCGATAATTATAACCATTGCCAGCTGTGACAGTACGTTACCCGATCTGGCGTGGCTTAATACCATTCCGGTGATTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGCTGGATATGGGGGGGACGGCGATCATGGCGAAAGTCCGCCCTTATATTGGCA‑CCACCACCACCTGGTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCGGGCGCTTTATGGTGCATTGTgcgc < 3:475015/275‑1 (MQ=255) tttcatcCCTATTGCTTTGCTGGTTAACAGTATCGTCGACGGCAGCGGCCCGCTACTTAAAGCCATTTCCAGCGGTGTCATGACGTTACCCGATCTGGCGTGGCTTAATACCATTCCGGTGATTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGCTGGATATGGGGGGGACGGCGATCATGGCGAAAGTCCGCCCTTATATTGGCA‑CCACCACCACCTGGTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCGGGCGCTTTATGGTGCATTGTGCGCTGa < 2:168246/273‑1 (MQ=255) tcatcCCTATTGCTTTGCTGGTTACCAGTATCGTCGACGGCAGCGGCCCGCTAATTAAAGCCATTTCCAGCGGTGACATGACGTTACCCGATCTGGCGTGGCTTAATACCATTCCGGTGATTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGGTGGATATGGGGGGGACGGCGATCATGGCGAAAGTCCGCCCTTATATTGGCA‑CCACCACCACCTGGTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCGGGCGCTTTATGGTGCATTGTGCGCTGATg < 2:479316/275‑1 (MQ=255) tcCCTATTGCTTTGCTGGTTAACAGTATCGTCGACGGCAGCGGCCCGCTAATTAAAGCCATTTCCAGCGGTGACATGACGTTACCCGCTCTGGCGTGGCTTAATACCATTCCGGTGATTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGTCACAACTTGCTGGATCTGGGGGGGGCGGCGATCATGGCGAAAGTCAGCCCTTATGTTGGCA‑CCGCCCACACCGGCGTCGTTGGGGAGGCGGCGCTTGGTGGGCGCCTTATCGTTAATTTTGCGCGGacgggg > 4:233321/1‑270 (MQ=255) tcCCGATTGCTTTGGTGTTTACCAGCATGGTCGAGGGCGGCGTCGCGCTAATTAAAGCCATTTCCGGCGGTGACATGACGGTACCCGATCTGGCGTGGCTTAATACCTTTCCGGTGATTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGCTGGATATGGGGGGGACGGCGATCATGGCGAAAGTCCGCCCTTATATTGGCA‑CCACCACCACCTGGTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCGGGCGCTTTATGGTGCATTGTGTGCTGATGCtt < 4:226988/275‑1 (MQ=255) cccTATGGCTTTGCTGGTTAACAGTATGGTCGCCGGCAGCGGCCCGTTAATTAAAGCCATTTCCAGCGGTGACAGGACGTTACCCGATCTGGCGTGGCTTAATACCATTCCGGTGATTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGCTGGATATGGGGGGGACGGCGATCATGGCGAAAGTCCGCCCTTATATTGGCA‑CCACCACCACCTGGTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCGGGCGCTTTATGGTGCATTGTGCGCTGATGCtt < 2:233321/274‑1 (MQ=255) ttgctttgctGGTTAACAGTATCGTCGACGGCAGCGGCCCGCTAATTAAAGCCATTTCCAGCGGTGACATGACGTTACCCGATCTGGCGTGGCTTAATACCATTCCGGTGATTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGCTGGATATGGGGGGGACGGCGATCATGGCGAAAGTCCGCCCTTATATTGGCA‑CCACCACCACCTGGTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATCTCGGGCGCTTTATGGTGCCTTGTGCGCGGATGCTTCTCtt > 2:16447/1‑274 (MQ=255) ttgctttgctGGTTAACAGTATCGTCGACGGCAGCGGCCCGCTAATTAAAGCCATTTCCAGCGGTGACATGACGTTACCCGATCTGGCGTGGCTTAATACCATTCCGGGGATTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGCTGGATATGGGGGGGGCGGCGCTCATGGCGAAAGTACGCCCTTATATTGGCA‑CCGCCACCAACTGGTCGGTTGGGCGGTCGGCGCCTCATGGGCGCTGTACGGTTCATTGTGTGTGGTTGGTTCTCtt > 4:609292/1‑274 (MQ=255) tgctttgctGGTTACCAGTAGCGTCGACGGCAGTGGCCCGCTAATTAAAGCCATTTCCAGCGGTGACATGACGTTACCCGATCTGGCGTGGCTTAATACCATTCCGGTGATTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGCTGGATATGGGGGGGACGGCGATCATGGCGAAAGTCCGCCCTTATATTGGCA‑CCACCACCACCTGGTTCGTTGGGCAGGCGGCGCGTATCGGGCGCTTTATGGTGCATTGTGCGCTGATGCTTCTCTTCa < 2:399125/275‑1 (MQ=255) ctttgctGGTTAACAGTATCGTCGACGGCAGCGGCCCGCTAATTAAAGCCATTTCCAGCGGTGACATGACGTTACCCGATCTGGCGTGGCTTAATACCATTCCGGTGCTTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGCTGGATATGGGGGGGACGGCGATCATGGCGAAAGTCCGCCCTTATTTTGGCG‑CCACCACCACCTGGTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCTGGCCCTTTATCGTTCATTTTGCGTGGCTGCTTCTTTTTAGt > 3:226094/1‑275 (MQ=255) ctttgctGGTTAACAGTATCGTCGACGGCAGCGGCCCGCTAATTAAAGCCATTTCCAGCGGTGACATGACGTTACCCGATCTGGCGTGGCTTAATACCATTCCGGTGATTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGCTGGATATGGGGGGGACGGCGATCATGGCGAAAGTCCGCCCTTATATTGGCA‑CCACCACCACCTGGTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCGGGCGCTTTCTGGTGCATTGTGCGCTGGTGCTGCTATTCAGt > 2:103626/1‑275 (MQ=255) ttttctgtgtAACCGTATCGTCGCCGTCAGCGTCCTGATAATTAAGGCCATTTCCAGCGGGTACATGACGTTACCCGATCTGGCGTGGCTTAATACCATTCCGGTGATTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGCTGGATATGGGGGGGACGGCGATCATGGCGAAAGTCCGCCCTTATATTGGCA‑CCACCACCACCTGGTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCGGGCGCTTTATGGTGCATTGTGCGCTGATGCTTCTCTTCAGTg < 4:402147/266‑1 (MQ=255) ttttcgggTTACCAGTATCCTCGACGGCAGCGGCCCGCTAATTAAAGCCATTTCCAGCGGTGACATGACGTTACCCGATCTGGCGTGGCTTAATACCATTCCGGTGATTGGCGCGAAGCTGTATGCAGGCTGGCACAACTTGCTGGATATGGGGGGGACGGCGATCATGGCGAAAGTCCGCCCTTATATTGGCA‑CCACCACCACCTGGTTCGTTGGGCAGGCGGCGCATATCGGGCGCTTTATGGTGCATTGTGCGCTGATGCTTCTCTTCAGTg < 2:609292/269‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |