| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3426836 = | NA (NA) | 7 (0.070) | 7/334 | NT | NA | intergenic (‑53/+122) | rrlD/alaU | 23S ribosomal RNA of rrnD operon/tRNA‑Ala |
| ? | NC_000913 | 3426854 = | NA (NA) | intergenic (‑71/+104) | rrlD/alaU | 23S ribosomal RNA of rrnD operon/tRNA‑Ala | |||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
TTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTATAACGGTTCATATCACCTTACCGACGCTTATCGCAGATTAGCACGTCCTTCATCGCCTCTGACTGCCAGGGCATCCACCGTGTACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGGAGCTATGCGGGATCGAACCGCAGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCATAACATGTAGTTAAAACCTCTTCAAATTTGCCGTGCAAAT > NC_000913/3426587‑3427074 | tttCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCTCCATTCGGAAATCGCCGGCTATAACGGTTCATATCATCTTACCGACGCTTATCGCAGATTAGCACGTCCTTCATCGCCCCTGACTGCCAGGGCATCCACCGTGTACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAACATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTc > 2:800983/1‑275 (MQ=9) tCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTATAACGGTTCATATCACCTTACCGACGCTTATCGCAGATTAGCACGTCCTTCATCGCCTCTGACTGCCAGGGCATCCACCGTGTACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCCAAAATTTGAGAGACTCCCGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGtttaa > 4:121060/1‑272 (MQ=14) ccGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTATAACGGTTCATATCACCTTACCGACGCTTATCGCAGATTAGCACGTCCTTCATCGCCTCTGACTGCCAGGGCATCCACCGTGTACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCt > 4:739843/1‑275 (MQ=31) cGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAAACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTATAACGGGTCATATCACCTTACCGACGCTTATCGCAGATTAGCACGTCCTTCATCGCCTCTGACTGCCAGGGCATCCACCGTGTACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCt < 1:175516/274‑1 (MQ=14) tCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCTCCATTCGGAAATCGCCGGTTATAACGGTTCATATCACCTTACCGACGCTTATCGCAGATTAGCACGTCCTTCATCGCCTCTGACTGCCAGGGCATCCACCGTGTACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATc > 2:556346/1‑275 (MQ=14) tCATTACCCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTATAACGGTTCATATCACCTTACCGACGCTTATCGCAGATTAGCACGTCCTTCATCGCCTCTGACTGCCAGGGCATCCACCGTGTACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCa < 1:30417/272‑1 (MQ=14) aTGGATTTATGTAATGATATGGTTGCGAAACACAATGGGTGTTCTCATTCGGAAAACGGCCGTTATAACGGTTCATATCACCTTACGGACGCTGTTCGCAGATTTGCACGTCCTTCATCGCCTCTGACTCCCAGGGCGACCACCGTGTACGTTTAGTCACTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGGGACTCACGAACAACTGTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTGTCAGCGTGATCCAGATTTTTATagag < 4:212646/275‑1 (MQ=11) 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acacTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTATAACGGTTCATATCACCTTACCGACGCTTATCGCAGATTAGCACGTCCTTCATCGCCTCTGACTGCCAGGGCATCCACCGTGTACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTaca < 4:13330/275‑1 (MQ=255) cTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTATAACGGTTCATATCACCTTACCGACGCTTATCGCAGATTAGCACGTCCTTCATCGCCTCTGACTGCCAGGGCATCCACCGTGTACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTacac > 4:380979/1‑273 (MQ=255) ggTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTATAACGGTTCATATCACCTTACCGACGCTTATCGCAGATTAGCACGTCCTTCATCGCCTCTGACTGCCAGGGCATCCACCGTGTACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAACGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCGGGTACACTCTGa > 2:67037/1‑275 (MQ=255) 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5:52933/149‑1 (MQ=32) cTGCCAGGGCATCCACCGTGTACGCTTAGTCGCGTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTGGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGAtggt < 2:782130/217‑1 (MQ=255) cAGGGCATCCACCGTGTACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTNCCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACNNCagan > 4:864664/1‑207 (MQ=255) gtcattccccGTGGACGCTTAGTCTCTTAAACTCACAACCCGAAGATGTTTGACTTCAGACGTGAGAAAATTTGAGAGACTCACGAAACACTTTCGTTGTTCAGTGTTTGAATTTCCAGCTTGATCCAGATTGTTAAACAGCAAAACTGCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTCAATCACTACAGAGATGGTCGAGCTATGCGGGATCGAACCGCAGACCGCATGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCta < 4:270199/267‑1 (MQ=14) ggCATCAACCCGGTACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCCCTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGGAGCTATGCGGGATCGAACCGCAGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCta < 4:514291/275‑1 (MQ=255) aTCCACCGGGTAAGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAAGTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGCTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTGTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATCGTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGGAGCGATGCGCGATCGAACCGCAGACATCCTGCGTGAAAAGCAGGCGCGCTCCCAGCTGCGCtatcg < 4:770478/275‑3 (MQ=14) tCCACCGTGTACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGGAGCTATGCGGGATCGAACCGCAGACCTCCTGCGTCCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGc > 1:383877/1‑275 (MQ=255) cACCGTGTACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGt > 5:85723/1‑149 (MQ=40) gtgtACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCtt > 1:146668/1‑112 (MQ=32) tgtACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGc > 4:685469/1‑154 (MQ=255) tgtACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGAtggt > 4:928259/1‑199 (MQ=255) tgtACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGGAGCTATGCGGGATCGAACCGCAGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCATa > 2:370292/1‑274 (MQ=255) aCGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATc < 3:146668/112‑1 (MQ=32) cGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGt < 2:685472/154‑1 (MQ=255) cGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGAt > 2:281393/1‑192 (MQ=255) cGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGGAg < 2:928262/199‑1 (MQ=255) gCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGAtggt > 4:791414/1‑194 (MQ=255) gCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGGAGCTATGCGGGATCGAACCGCAGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCATAACATg < 4:455296/274‑1 (MQ=255) tAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTtttatt > 1:329774/1‑172 (MQ=255) tAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGAtggtg < 4:281390/192‑1 (MQ=255) aGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGGAg < 2:791417/194‑1 (MQ=255) cTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGt < 4:504503/144‑1 (MQ=255) ttAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGAtttt > 2:992001/1‑108 (MQ=32) ccTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTaaa < 4:991998/108‑1 (MQ=32) cTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAg > 5:75592/1‑149 (MQ=255) acaACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAg > 4:384066/1‑120 (MQ=255) acaACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTg > 1:55438/1‑122 (MQ=255) cccGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAAcc < 3:55438/122‑1 (MQ=255) cccGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATGTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGaa < 2:384069/120‑1 (MQ=255) cGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGc > 4:862842/1‑125 (MQ=255) gAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTtttatt > 3:133435/1‑150 (MQ=255) gATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGt < 2:862845/125‑1 (MQ=255) aTGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAAt < 1:133435/150‑1 (MQ=255) gTTTAACTTTAGAGTTGCTAAAATTTGGGTGGCTCAGAAACAACTTTCCTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGTTCCAGATTTTTAAAGAGCAAATCTTCGCATTGAGCCTTTGCAGGGACACTCTGAAGTATTTTTTAGTTAGTCAGTACAGAGATGGTGGAGCAATGCGGGATCGAACCGCAGACCGGCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGGTGAGCTATAGCCCCATAACATGTAGTTAGAACCTCTTCGAATTTGCCGTGCaaa < 4:556343/275‑1 (MQ=11) tttCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCCATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACCCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGGAGCTATGCGGGATCGAACCGCAGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCATAACATGTAGTTAAAACCTCTTAAAATTCGCCGTCCaatt > 4:348579/1‑273 (MQ=255) tttCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCa > 2:636227/1‑118 (MQ=255) tttCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTtttatt > 4:997326/1‑143 (MQ=39) aCTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTa < 4:636224/118‑1 (MQ=38) aCTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAAt < 2:997329/143‑1 (MQ=35) tCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTAtttttt > 3:359194/1‑133 (MQ=33) agTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTa > 3:45326/1‑111 (MQ=11) agTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTtttattt < 1:359194/133‑1 (MQ=11) | TTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTGGGTTTCCCCATTCGGAAATCGCCGGTTATAACGGTTCATATCACCTTACCGACGCTTATCGCAGATTAGCACGTCCTTCATCGCCTCTGACTGCCAGGGCATCCACCGTGTACGCTTAGTCGCTTAACCTCACAACCCGAAGATGTTTCACTTCAGAGTTGCGAAAATTTGAGAGACTCACGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGGAGCTATGCGGGATCGAACCGCAGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTATAGCCCCATAACATGTAGTTAAAACCTCTTCAAATTTGCCGTGCAAAT > NC_000913/3426587‑3427074 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |