| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 3774387 | 403 (3.860) | intergenic (+193/‑37) | mtlA/mtlD | mannitol‑specific PTS enzyme: IIA, IIB and IIC components/mannitol‑1‑phosphate dehydrogenase, NAD‑dependent | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 451 total aligned reads displayed.
GATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGGAGAGGGTTTGGGTGAGGGAAAAGCCTCACCCCAGCCCTCTCGGGTAAAAACATTGATGAAGGTTAATACTATGAAAGCATTACATTTTGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGTACTTGATGCCCTGAATGCCCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGCAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTGTCAGCAGCATTGGTGATGATGTCGTTGATCTGATTGCT > NC_000913/3774117‑3774657 | ccGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATCCCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCACGGAGAGGGTTTGGGTGAGGGAAACGCCTCACCCCCGCCCTCTCGGGt > 2:227996/1‑275 (MQ=255) 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> 4:732588/1‑263 (MQ=255) aaGCCTCACCCCAGCCCTCTCGGGTAAAAACATTGATGAAGGt < 2:632099/43‑1 (MQ=255) aaGCCTCACCCCAGCCCTCTCGGGTAAAAACATTGATGAAGGTTAATACTATGAAAGCATTACATTTTGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAGGTGGTACTTGATGCCCTGAATGACCGTCATAGCTATCAGGTACATGTGGTTGGTGAAACCGAGAAGGTAGATACCGTTTCCGGCGTCAATGCTGTCAGCAGCATTGGTGATGATGTCGTTGAt > 4:188538/1‑275 (MQ=255) ccTCACCCCAGCCCTCTCGGGTAAAAACATTGATGAAGGTTAATACTATGAAAGCATTACATTTTGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAg < 5:44980/149‑1 (MQ=255) cTCACCCCAGCCCTCTCGGGTAAAAACATTGATGAAGGTTAATACTATGAAAGCATTACATTTTGGCGCAGGTAATATCGGTCGTGGCTTTATCGGTAAACTGCTGGCAGACGCGGGTATCCAACTGACGTTTGCCGATGTCAATCAgg > 6:22816/1‑149 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |