| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 3813344 = | 285 (2.680) | coding (614/1221 nt) | dfp | fused 4'‑phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenoylcysteine synthetase, FMN‑binding | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 336 total aligned reads displayed.
CACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACA‑TTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACGCTGGTATCAGGTCCGGTTTCACTACCGACGCCACCGTTTGTTAAACGTGTTGATGTGATGACCGCGCTGGAAATGGAAGCCGCCGTGAATGCTTCTGTACAGCAGCAAAATATTTTTATCGGCTGCGCCGCCGTGGCGGATTATCGCGCAGCTACCGTGGCCCCAGAGAAAATCAAAAAGCAGGCCACGCAG > NC_000913/3813071‑3813618 | cacCTGCGCCTGTGGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCGGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACA‑TTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTg < 2:828979/275‑1 (MQ=255) acCTGCGCCTGTAGCCGGGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCTGTCAACGACCTGAAACATCTGAACA‑TTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTg < 2:174433/274‑1 (MQ=255) gcgcCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTGGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACA‑TTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTta < 2:99239/275‑1 (MQ=255) tGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACA‑TTATGATTACCGCCGGCCCGTCGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTta < 1:175346/270‑1 (MQ=255) cTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACA‑TTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAg > 2:52509/1‑275 (MQ=255) cagATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACA‑TTATGATTTACGCCGGCCCGACGCGTGAAACGCGAGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCCCACCCCCGGCAAGATggggt > 4:421837/1‑272 (MQ=255) cGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACA‑TTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTg < 2:389874/228‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) tgGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACA‑TTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACGCTGGTATc > 2:678739/1‑187 (MQ=255) gATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACA‑TTATGATTACCGCCGGCCCGGCGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACg < 2:421653/177‑1 (MQ=255) gATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACA‑TTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCg < 2:55803/98‑1 (MQ=255) gATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACA‑TTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCcgtc < 4:535405/160‑1 (MQ=255) 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< 6:91600/149‑1 (MQ=255) tagaaCATCTGAACC‑TAGTGATTTCCGCCCGCCCGACGCGTGAACCGCTCGTTCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCGATCGCCGCCGCCGCTGCCAGTCGTGGCGCGAACGTCTCGCTGGTATCGGGTCCGGTTTCACTACCGACGCCACCGTTTGTTAAACGTGTTGATGTGATGACCGCGCTGGAAATGGAAGCCGCCGTGAATGCTTCTGTACAGCAGCAAAATATTTTTATCGGCTGCGCCGCCGTg < 1:224683/272‑1 (MQ=255) gAAACATCTGAACA‑TTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACGCTGGTATCAGGTCCGGTTTCACTACCGACGCCACCGTTTGTTAAACGTGTTGATGTGATGACCGCGCTGGAAATGGAAGCCGCCGTGAATGCTTCTGTACAGCAGCAAAATATTTTTATCGGCTGCGCCGCCGTgg > 2:505218/1‑275 (MQ=255) aTCTGAACA‑TTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACGCTGGTATCAGGTCCg > 8:18505/1‑149 (MQ=255) cTGAACA‑TTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACGCTGGTATCAGGTCCGGt < 6:12972/149‑1 (MQ=255) 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tGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACGCTGGTATCAGGTCCGGTTTCACTACCGACGCCACCGTTTGTTAAACGTGTTGATGTGATGACCGCGCTGGAAATGGAAGCCGCCGTGAATGCTTCTGTACAGCAGCAAAATATTTTTATCGGCTGCGCCGCCGTGGCGGATTATCGCGCAGCTACCGTGGCCCCAGAGAAAATCAAAAAGCAGGCCACGCAg > 2:100571/1‑275 (MQ=255) | CACCTGCGCCTGTAGCCGTGCTCCCCGCCATGAACCAGCAGATGTACCGTGCCGCTGCCACGCAGCATAATTTAGAGGTGCTTGCTTCCCGTGGTTTGCTCATCTGGGGGCCAGACAGTGGCAGTCAGGCTTGTGGTGATATCGGTCCTGGGCGAATGCTCGATCCGTTAACCATTGTGGATATGGCGGTAGCGCATTTTTCGCCCGTCAACGACCTGAAACATCTGAACA‑TTATGATTACCGCCGGCCCGACGCGTGAACCGCTCGATCCGGTGCGTTATATCTCTAATCACAGCTCCGGCAAGATGGGTTTTGCTATCGCCGCCGCCGCTGCCCGTCGTGGCGCGAACGTCACGCTGGTATCAGGTCCGGTTTCACTACCGACGCCACCGTTTGTTAAACGTGTTGATGTGATGACCGCGCTGGAAATGGAAGCCGCCGTGAATGCTTCTGTACAGCAGCAAAATATTTTTATCGGCTGCGCCGCCGTGGCGGATTATCGCGCAGCTACCGTGGCCCCAGAGAAAATCAAAAAGCAGGCCACGCAG > NC_000913/3813071‑3813618 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |