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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,131,608 | 0 | T | A | 5.4% | 394.6 / 9.7 | 112 | A57A (GCT→GCA) | flgC | flagellar component of cell‑proximal portion of basal‑body rod |
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Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
ATATCGCCGGGTCGGCGTTAACTGCCCAGTCCCAGCGCCTGAACGTGGCGGCCAGTAATCTGGCGAATGCTGATAGCGTGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGTAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGCTGGCAGATGCAAAGGGCTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCAT > NC_000913/1131460‑1131754 | atatCGCCGGGTCGGCGTTAACTGCCCAGTCCCAGCGCCTGAACGTGGCGGCCAGTAATCTGGCGAATGCTGATAGCGTGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGtgct > 4:86290/1‑149 (MQ=255)atatCGCCGGGTCGGCGTTAACTGCCCAGTCCCAGCGCCTGAACGTGGCGGCCAGTAATCTGGCGAATGCTGATAGCGTGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGtgct < 3:16183/149‑1 (MQ=255) tCGCCGGGTCGGCGTTAACTGCCCAGTCCCAGCGCCTGAACGTGGCGGCCAGTAATCTGGCGAATGCTGATAGCGTGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCg > 2:896058/1‑149 (MQ=255) gCCGGGTCGGCGTTAACTGCCCAGTCCCAGCGCCTGAACGTGGCGGCCAGTAATCTGGCGAATGCTGATAGCGTGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCAGCACCTGGTGCAGCgtt 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3:918131/6‑149 (MQ=255) gCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGTAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGCTGGCAGATGCAAAGGGCTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGAt > 2:719941/1‑149 (MQ=255) tGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGTAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGCTGGCAGATGCAAAGGGCTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATgg < 1:434383/149‑1 (MQ=255) tGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGTAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGCTGGCAGATGCAAAGGGCTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATgg < 1:896058/149‑1 (MQ=255) agCACCTGGTGCAGCGACAGGCGGCGTAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGCTGGCAGATGCAAAGGGCTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGgaga < 1:8909/143‑1 (MQ=255) agCACCTGGTGCAGCGACAGGCGGCGTAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGCTGGCAGATGCAAAGGGCTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGgaga > 2:8909/2‑144 (MQ=255) 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ggTGCTGCGACAGGCGGCGTAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGCTGGCAGATGCAAAGGGCTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAacac < 3:367443/149‑1 (MQ=255) gctgcGACAGGCGGCGTAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGCTGGCAGATGCAAAGGGCTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCAt < 1:320340/149‑1 (MQ=255) | ATATCGCCGGGTCGGCGTTAACTGCCCAGTCCCAGCGCCTGAACGTGGCGGCCAGTAATCTGGCGAATGCTGATAGCGTGACCGGTCCCGATGGACAGCCATATCGGGCAAAACAGGTGGTATTCCAGGTTAACGCTGCACCAGGTGCTGCGACAGGCGGCGTAAAGGTTGCCGATGTTATAGAAAGTCAGGCCCCGGACAAACTGGTTTATGAACCGGGTAATCCGCTGGCAGATGCAAAGGGCTACGTAAAAATGCCGAACGTTGATGTTGTCGGAGAGATGGTTAACACCAT > NC_000913/1131460‑1131754 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |