| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 1,808,684 | T→A | 9.9% | intergenic (+28/+13) | yniA → / ← yniB | fructosamine kinase family protein/putative inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,808,684 | 0 | T | A | 9.9% | 383.5 / 25.5 | 121 | intergenic (+28/+13) | yniA/yniB | fructosamine kinase family protein/putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (49/58); new base A (5/7); total (55/66) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
GATTTCCTTGAACGTCAACCGGTTTACCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAGGAAAATAGTATGGTGCGGAACAACAATACGGGACTCAATTTGTTCACG > NC_000913/1808537‑1808828 | gATTTCCTTGAACGTCAACCGGTTTACCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTg > 1:64865/1‑149 (MQ=255) ccTTGAACGTCAACCGGTTTACCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGGCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCACGGAGCGGcc < 4:721799/149‑1 (MQ=255) ttGAACGTCAACCGGTTTACCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCACGGAGCGGccat > 2:274873/1‑147 (MQ=255) ttGAACGTCAACCGGTTTACCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCACGGAGCGGccat 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cGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAGGAAAATAGTATGGTGCGGAACAACAATACGGGACTCAATTTGTTc < 1:148758/149‑1 (MQ=255) cGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAGGAAAATAGTATGGTGCGGAACAACAATACGGGACTCAATTTGTTc < 3:281951/149‑1 (MQ=255) tCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAGGAAAATAGTATGGTGCGGAACAACAATACGGGACTCAATTTGTTCAcg > 1:388543/1‑149 (MQ=255) | GATTTCCTTGAACGTCAACCGGTTTACCAACTCTACACGCTGTTAAATCGTGCAAGGTTATTTGGCGGTCAGCATTTGGTTATTGCTCAGCAGTCATTGGATAGATTATTAGCAGCATGATATGGGTTGAGGATAATGGCCGCTCCGTGCGGCCTTTTGATTAAATAAACCCAAGCAGAGAAAAGAACACATAACCTGCAGCAATACAAATAACCGGCAGGATATACAGTGAGAAAAACTGCAGGAAAATAGTATGGTGCGGAACAACAATACGGGACTCAATTTGTTCACG > NC_000913/1808537‑1808828 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |