| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 420,945 | 0 | A | C | 7.5% | 345.7 / 20.5 | 107 | intergenic (+35/‑41) | brnQ/proY | branched‑chain amino acid transport system 2 carrier protein; LIV‑II transport system for Ile, Leu, and Val/proline‑specific permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (44/55); new base C (6/2); total (50/57) | |||||||||||
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Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
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cGGGGCTGCGATGCCCCGTGGCTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATGGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAATTGGCACCGGGCTGTTTTACGGTTc > 1:62075/1‑149 (MQ=255) ggCTGCGATGCCCCGTGGTTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAATTGGCACCGGGCTGTTTTACGGTTCGGc < 3:781279/149‑1 (MQ=255) gCTGCGATGCCCCGTGGTTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAATTGGCACCGGGCTGTTTTACGGTTCGGCa > 4:625070/1‑149 (MQ=255) gCGATGCCCCGTGGTTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAATTGGCACCGGGCTGTTTTACGGTTCGGCAGAc < 2:595445/149‑1 (MQ=255) gATGCCCCGTGGTTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAATTGGCACCGGGCTGttt < 4:556621/132‑1 (MQ=255) gATGCCCCGTGGTTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAATTGGCACCGGGCTGttt > 3:556621/1‑132 (MQ=255) aTGCCCCGTGGTTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTgg > 2:140746/1‑105 (MQ=255) aTGCCCCGTGGTTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGCAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTgg < 1:140746/105‑1 (MQ=255) | CCGCTGGCCGAACAAGGTCTGGCGTGGTTAATGCCAACAGTGGTGATGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGGTTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAATTGGCACCGGGCTGTTTTACGGTTCGGCAGACG > NC_000913/420800‑421091 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |