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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 420,946 | 0 | T | A | 7.3% | 376.5 / 14.2 | 109 | intergenic (+36/‑40) | brnQ/proY | branched‑chain amino acid transport system 2 carrier protein; LIV‑II transport system for Ile, Leu, and Val/proline‑specific permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (45/56); new base A (6/2); total (51/58) | |||||||||||
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Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
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3:812141/149‑1 (MQ=255) cGGGGCTGCGATGCCCCGTGGCTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATGGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAATTGGCACCGGGCTGTTTTACGGTTc > 1:62075/1‑149 (MQ=255) gCTGCGATGCCCCGTGGTTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAATTGGCACCGGGCTGTTTTACGGTTCGGCa > 4:625070/1‑149 (MQ=255) cGATGCCCCGTGGTTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAATTGGCACCGGGCTGTTTTACGGTTCGGCAGACg > 3:37496/1‑149 (MQ=255) gATGCCCCGTGGTTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAATTGGCACCGGGCTGttt > 3:556621/1‑132 (MQ=255) gATGCCCCGTGGTTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAATTGGCACCGGGCTGttt < 4:556621/132‑1 (MQ=255) aTGCCCCGTGGTTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTgg > 2:140746/1‑105 (MQ=255) aTGCCCCGTGGTTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGCAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTgg < 1:140746/105‑1 (MQ=255) tGCCCCGTGGTTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAATTGGCACCGGGCTGTTTTACGGTTCGGCAGACGCCa < 4:672461/149‑1 (MQ=255) | CCGCTGGCCGAACAAGGTCTGGCGTGGTTAATGCCAACAGTGGTGATGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGGTTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAATTGGCACCGGGCTGTTTTACGGTTCGGCAGACGCCA > NC_000913/420800‑421094 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |