Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 443,023 | 0 | T | C | 5.5% | 353.3 / 7.9 | 109 | intergenic (+26/+28) | thiI/yajL | tRNA s(4)U8 sulfurtransferase/oxidative‑stress‑resistance chaperone |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (43/60); new base C (3/3); total (46/63) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.96e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
GCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCCCAACCAACAGGTCGATAATTTTCAGACCAAAGTCGATAGCTGTACCCGGC > NC_000913/442879‑443171 | gCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGa > 4:188375/1‑149 (MQ=255) gCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGa < 3:349742/149‑1 (MQ=255) gCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGa < 1:685984/149‑1 (MQ=255) cGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACGATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGAt 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gtgGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCCCAACCAACAGGTCGATAATTTTCAGAcc > 1:515833/1‑149 (MQ=255) gTTTTTACGTCGCATCTGGTAAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGAGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCCCAACCAACAGGTCGATAATTTTCAGACCaaa < 4:623143/149‑1 (MQ=255) tttACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCCCAACCAACAGGTCGATAATTTTCAGACCAAAGTc < 4:487995/149‑1 (MQ=255) aaaCGTCGCATCTGACCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCAt < 3:643954/97‑1 (MQ=39) aCGTCGCATCTAGTCAGATGCGACGTTTGCAGCAACCGACACTACTCGTAATAATTGTAAATCCCTGCCGCCATCACCACTTGTGATGCCACTTCATGGTCTTTTCCGCGCCCAACCAACAGGTCGATAATATTCAGACCAAAGTCGAt < 4:570780/149‑1 (MQ=255) gTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCCCAACCAACAGGTCGATAATTTTCAGACCAAAGTCGATAg < 1:218575/149‑1 (MQ=255) gTCGCATCTGACCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCCCAACCAACAGGTCGATAATTTTCAGACCAAAGTCGATAg > 2:19421/1‑149 (MQ=255) aTCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGc > 4:76376/1‑94 (MQ=255) aTCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGc < 3:76376/94‑1 (MQ=255) aTCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCCCAACCAACAGGTCGATAATTTTCAGACCAAAGTCGATAGCTGTa > 2:324506/1‑149 (MQ=255) tCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCCCAACCAACAGGTCGATAATTTTCAGACCAAAGTCGATAGCTGTAc < 3:825163/149‑1 (MQ=255) gTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCCCAACCAACAGGTCGATAATTTTCAGACCAAAGTCGATAGCTGTACCCgg > 1:87679/1‑149 (MQ=255) gTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCCCAACCAACAGGTCGATAATTTTCAGACCAAAGTCGATAGCTGTACCCgg > 1:428855/1‑149 (MQ=255) | GCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCCCAACCAACAGGTCGATAATTTTCAGACCAAAGTCGATAGCTGTACCCGGC > NC_000913/442879‑443171 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |