| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 3,780,128 | T→C | 5.9% | I101T (ATT→ACT) | lldD → | L‑lactate dehydrogenase, FMN‑linked |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,780,128 | 0 | T | C | 5.9% | 376.4 / 7.2 | 114 | I101T (ATT→ACT) | lldD | L‑lactate dehydrogenase, FMN‑linked |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (50/57); new base C (3/4); total (53/61) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
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ttCCGTTTACTCTCTCGACGGTTTCCGTTTGCCCGATTGAAGAAGTCGCGCCAGCCATCAAGCGCCCAATGTGGTTCCAGCTTTATGTACTGCGCGATCGCGGCTTTATGCGTAACGCGCTGGAGCGAGCAAAAGCAGCGGGTTGTTCg > 4:456595/1‑149 (MQ=255) | TGAAAAACATGTCCGACTTAAGCCTGGAAACGACGCTGTTTAATGAGAAATTGTCGATGCCGGTGGCACTGGCTCCGGTGGGTTTGTGTGGCATGTATGCGCGTCGTGGCGAAGTTCAGGCAGCCAAAGCGGCGGACGCGCATGGTATTCCGTTTACTCTCTCGACGGTTTCCGTTTGCCCGATTGAAGAAGTCGCGCCAGCCATCAAGCGCCCAATGTGGTTCCAGCTTTATGTACTGCGCGATCGCGGCTTTATGCGTAACGCGCTGGAGCGAGCAAAAGCAGCGGGTTGTTCG > NC_000913/3779981‑3780276 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |