| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,002,402 | G→A | 7.9% | intergenic (+26/+17) | corA → / ← yigF | magnesium/nickel/cobalt transporter/DUF2628 family putative inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,002,402 | 0 | G | A | 7.9% | 311.5 / 11.4 | 100 | intergenic (+26/+17) | corA/yigF | magnesium/nickel/cobalt transporter/DUF2628 family putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (39/53); new base A (4/4); total (43/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.22e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGAT > NC_000913/4002255‑4002548 | gCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGc > 3:499812/1‑149 (MQ=255)gCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGc < 4:339148/149‑1 (MQ=255) aTGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTa > 4:854354/1‑149 (MQ=255) aTGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTa > 2:917685/1‑149 (MQ=255) tGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTaa < 4:443956/149‑1 (MQ=255) aaCTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGc > 1:264087/1‑149 (MQ=255) aaCTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGc < 2:916756/149‑1 (MQ=255) cTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCa > 1:657607/1‑149 (MQ=255) cTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGCCAGACTAAGCCa < 4:304874/149‑1 (MQ=255) tttGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCAc < 1:917685/149‑1 (MQ=255) tttGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCAc < 4:29311/149‑1 (MQ=255) ttGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCAcc < 2:657607/149‑1 (MQ=255) tGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCt < 2:363106/149‑1 (MQ=255) aTGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTc < 2:609040/149‑1 (MQ=255) ccAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCaaa < 4:312220/149‑1 (MQ=255) cAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAg > 2:541789/1‑149 (MQ=255) cAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAg > 4:75852/1‑149 (MQ=255) gAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGc < 2:85129/149‑1 (MQ=255) cTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTcc > 1:36525/1‑149 (MQ=255) cTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTcc > 2:741007/1‑149 (MQ=255) gAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAg < 2:74895/149‑1 (MQ=255) gAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAg < 1:27313/149‑1 (MQ=255) gTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTa > 1:550215/1‑149 (MQ=255) gCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTaa < 1:741007/149‑1 (MQ=255) cTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAAc < 1:675349/149‑1 (MQ=255) tCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAAccc < 2:462350/149‑1 (MQ=255) aCCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTAc < 2:303721/149‑1 (MQ=255) gATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCa < 2:40029/149‑1 (MQ=255) gATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCa < 2:218747/149‑1 (MQ=255) ttATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATa > 3:204580/1‑149 (MQ=255) cTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAAc < 4:204580/149‑1 (MQ=255) tttATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTcc > 1:64493/1‑113 (MQ=255) tttATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTcc < 2:64493/113‑1 (MQ=255) tttATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAAcc > 3:806859/1‑149 (MQ=255) tttATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAAcc > 1:506512/1‑149 (MQ=255) gttATGGTCCTCGCGGGCCTGGCACCGTTACAGTACTTTAGGCGGACGAATTGGTTGTTACAAACGCGAGAGGTGGCATTGTCAGGGTAAGTCACGTGTTTTGCAAAGCCTACAGGTATTTAATGTTTTTTCCTCTTTTTAGTAGaaaa > 4:567519/2‑147 (MQ=255) tATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCAt > 3:94539/1‑149 (MQ=255) tCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGtt > 2:175509/1‑149 (MQ=255) cTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGCCAGACTAAGCCAc > 3:131510/1‑86 (MQ=39) cTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGCCAGACTAAGCCAc < 4:131510/86‑1 (MQ=39) tCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCgt < 1:529783/149‑1 (MQ=255) tCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCgt > 1:409875/1‑149 (MQ=255) tCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCgt < 2:858454/149‑1 (MQ=255) ggCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTaa > 2:305321/1‑149 (MQ=255) ggCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTaa < 1:507489/149‑1 (MQ=255) ggCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTaa < 3:288256/149‑1 (MQ=255) gCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAAc < 3:917306/149‑1 (MQ=255) ccTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACa < 4:87278/149‑1 (MQ=255) cTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAg > 4:501515/1‑149 (MQ=255) gCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCaa < 2:656617/149‑1 (MQ=255) gCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCaa < 1:923306/149‑1 (MQ=255) cACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAAc < 1:790789/149‑1 (MQ=255) aCCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAAc < 1:869109/101‑1 (MQ=255) aCCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAAc > 2:869109/1‑101 (MQ=255) aCCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACa < 1:392324/149‑1 (MQ=255) ccGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACAt < 3:75852/149‑1 (MQ=255) tgTATCTGTACTTTATGCAGAACAACTGGTGGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCGGGCTAAGCCTCCTGTTATTCAAAGTCTCCAGGTATTTAACCCTATTACCTCTTTCGCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATa < 3:567519/148‑1 (MQ=255) gTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAg > 3:36016/1‑149 (MQ=255) gTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAg > 1:103675/1‑149 (MQ=255) tCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGgct < 4:36016/149‑1 (MQ=255) tCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGgct < 2:103675/149‑1 (MQ=255) tgtgCTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGgctgc > 3:213309/1‑149 (MQ=255) tttAAGCGGAAGAACTGGTTGTAGAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACgg > 1:158239/1‑149 (MQ=255) tttAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACgg > 4:324074/1‑149 (MQ=255) aCTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAAt < 1:175509/149‑1 (MQ=255) tGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGaa > 1:497761/1‑96 (MQ=255) tGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGaa < 2:497761/96‑1 (MQ=255) tGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGCCAGACTaa < 2:448839/39‑1 (MQ=21) tGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGCCAGACTaa > 1:448839/1‑39 (MQ=21) ttGTAGAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTaa < 2:158239/149‑1 (MQ=255) ttGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAgg > 4:905690/1‑122 (MQ=255) ttGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAgg > 4:384458/1‑122 (MQ=255) ttGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAgg < 3:905690/122‑1 (MQ=255) ttGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAgg < 3:384458/122‑1 (MQ=255) ttGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTaa < 1:748064/149‑1 (MQ=255) ttGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTaa < 2:506512/149‑1 (MQ=255) tGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAAc < 4:806859/149‑1 (MQ=255) tAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGc > 1:103594/1‑149 (MQ=255) tAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGc > 4:710095/1‑149 (MQ=255) aaaaaaCGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGcc > 1:58002/1‑149 (MQ=255) aaaaaCGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGt > 1:111176/1‑141 (MQ=255) aaaaaCGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGt < 2:111176/141‑1 (MQ=255) aaaCGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAAt > 3:695153/1‑149 (MQ=255) aCGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTCTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTa < 2:68693/149‑1 (MQ=255) gagaGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGt < 2:550215/149‑1 (MQ=255) taacaggTGGCTTAGCCAGACTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGt < 4:80792/143‑1 (MQ=255) taacaggTGGCTTAGCCAGACTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGt > 3:80792/6‑148 (MQ=255) gCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCAc < 3:854354/149‑1 (MQ=255) gTGGCTTAGCCAGACTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACcaa > 4:672943/1‑149 (MQ=255) tGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACcaac > 2:259298/1‑149 (MQ=255) cTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTTCACCAACaaa < 2:375451/149‑1 (MQ=255) cTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACaaa < 1:259298/149‑1 (MQ=255) ttAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAAt > 2:841621/1‑149 (MQ=255) ttAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAAt > 3:638075/1‑149 (MQ=255) ttAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAAt > 3:492650/1‑149 (MQ=255) gTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACa > 1:849070/1‑86 (MQ=255) gTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACa < 2:849070/86‑1 (MQ=255) gTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATaga < 1:495524/149‑1 (MQ=255) cTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAgaga < 1:9131/149‑1 (MQ=255) tGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGAt < 2:103594/149‑1 (MQ=255) | GCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGAT > NC_000913/4002255‑4002548 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |