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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,704,308 | 0 | C | T | 6.6% | 610.9 / 21.5 | 191 | intergenic (‑245/+27) | rnc/lepB | RNase III/leader peptidase (signal peptidase I) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (94/84); new base T (4/9); total (98/93) | |||||||||||
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Only 100 of 191 total aligned reads displayed.
TAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACAAAGCCCCAGTAACGGCTGTCCGCGCTGTTGTCGCGGTTGTCGCCCATCATGAAGTATTGTCCCGGAGGAACAATCCAGGTTGCCAGTTGTTGCCCTGGCTGCTGGTAATACATCC > NC_000913/2704074‑2704564 | taaatGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGAc < 4:240540/237‑1 (MQ=255) 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taatTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGAt < 5:1064457/149‑1 (MQ=255) atTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTc < 5:792742/149‑1 (MQ=255) ttacagTTGGCGCCAAATCGGCGAAAACGTGAACGATGATGGCTATTAATGGATGCCCCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGCTAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACAAAGCCCCAGTAACGGCTGTCCGCGCTGTTGTCGCGGTTGTCGCCCATCATGAAGTATTGTCCCGGAGGAACAATCCAGGTTGCCAGTTGTTGCCCTGGCTGCTGGTAATACATcc < 4:254303/270‑1 (MQ=255) ttCACGTTGTCGCCGTTATGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGACCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCg > 6:961789/1‑149 (MQ=255) ttCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCg > 6:595031/1‑149 (MQ=255) ttCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACAAAGCCCCAGTAACGGCTGTCCGCGCTGTTGTCGCGGTTGTCGCCCATCATGAAGTATTGTCCCGGAGGAACAATCCAGGTTGCCAGTTGTTGCCCTGGCTGCTGGTAATACATcc < 4:435918/275‑1 (MQ=255) aCGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGc > 5:289564/1‑110 (MQ=255) aCGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCtt > 8:914075/1‑149 (MQ=255) cGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTc < 5:123153/149‑1 (MQ=255) cGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTCAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCCAAGCTCTTCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCCCTTc < 6:238973/149‑1 (MQ=255) 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cATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACaaa < 7:764022/149‑1 (MQ=255) aTAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACAAAg > 7:194782/1‑149 (MQ=255) tAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACAAAGc < 6:138947/149‑1 (MQ=255) | TAAATAAATGCGTCAACAATTCAGCACACGAAACAGACCTGATATACATGGTTCTGCTAACTGCTTCGCTGCAGTTTCAGTTTACCGGTATATGGGGACCAACGCTGTTTCGTGTGCCGTGGCAACCTGGAGGTGCCAACCTTAAACTTCGGGGGAATATTCTATACACAACGACGGGGGATGTCGTTAGCCACGGGAGATTTATCTCATAAATAATTCACGTTGTCGCCATAACGGCGACAACGTGAACGAAGATGGCTATTAATGGATGCCGCCAATGCGACTTAAGCGCAGACCAGTCGGCCATTCGCCTTCTTGCTTATCGAAGCTCATCCAGATAGCCGTTGCCCGACCGACCAGATTCGCTTCCGGCACAAAGCCCCAGTAACGGCTGTCCGCGCTGTTGTCGCGGTTGTCGCCCATCATGAAGTATTGTCCCGGAGGAACAATCCAGGTTGCCAGTTGTTGCCCTGGCTGCTGGTAATACATCC > NC_000913/2704074‑2704564 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |