| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,291,513 | T→C | 5.3% | M1A (GTG→GCG) †‡ | nrfE → | heme lyase (NrfEFG) for insertion of heme into c552, subunit NrfE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,291,513 | 0 | T | C | 5.3% | 491.9 / 11.5 | 150 | M1A (GTG→GCG) †‡ | nrfE | heme lyase (NrfEFG) for insertion of heme into c552, subunit NrfE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (74/67); new base C (3/5); total (77/73) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.83e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.37e-02 | |||||||||||
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
TGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGC‑TGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTTCTCATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTGGGGCGGCCATGAAGGTTCGCTGCTGCTTTGGGTGCTGCTGCTTTCCG > NC_000913/4291250‑4291773 | tggggggggtggtTCTGGTTTGGTGTGGCCGGGTTTGGGCGGTCTTTGCCAATGCGTGC‑CAAACCGTGGGTCAATGGCAGTTCCGGCATTCCTGCCGGGGTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAGGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCga < 4:446884/268‑2 (MQ=255) ggtggtTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGC‑TGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGGTTCTGGACGTATTCCTTCCTGGAGTTGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTATAGGGGCCAACGTGTTGACTCCGTTGACGGc > 2:516458/1‑275 (MQ=255) gtggtTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGC‑TGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGCAGTCGGCTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGAcc > 2:446884/1‑263 (MQ=255) gtctcagggctggggctgATTGTGCCAATGC‑TGCTCAAACCGGTGGTCATGCGCAGTTCCGGCATTCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCgg < 1:144908/268‑1 (MQ=255) tgCCAATGC‑TGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCCTGCCTGCCatttttc > 4:103116/1‑269 (MQ=255) tgc‑tgcTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCCCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGAccc > 2:243281/1‑271 (MQ=255) gctCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTg > 2:149044/1‑274 (MQ=255) ctCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGc > 2:612098/1‑274 (MQ=255) gggTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTc > 2:291590/1‑274 (MQ=255) gTTCCGGCATTCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCCCTGGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTcg > 2:331515/1‑274 (MQ=255) ttCCGGCATTCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCCGCGCTGTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGAGGTTGCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGCCGGTTTTCCGGCGTTGTTGTTAAGTCTTGGGGTCCACGTGGTGACCCCGTTGATGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCCCTTGCCTGCCATGACGCCACTCCCTTGCAGCGGTATTCTGGCGCATCTcgc > 4:308960/1‑274 (MQ=255) tCCGGCATTCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTcgcg < 4:149044/274‑1 (MQ=255) ccTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCGTGCATGATGCGACGCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCTCGCTCCtgctgc > 1:90369/1‑275 (MQ=255) ccAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACgt > 7:915006/1‑149 (MQ=255) cTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGa < 5:536919/149‑1 (MQ=255) ggTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGAcc > 5:663942/1‑149 (MQ=255) ggTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGAcc > 8:545174/1‑149 (MQ=255) gCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGtt < 5:720818/149‑1 (MQ=255) gtgtTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGa < 6:663942/149‑1 (MQ=255) gtgtTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGa < 6:102546/149‑1 (MQ=255) tgtTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGAc < 6:327963/149‑1 (MQ=255) gtTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACACGTTGACCCCga > 5:356043/1‑143 (MQ=255) tgctgcGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGGTGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCtt < 6:670177/149‑1 (MQ=255) ctgcGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTTCTCATCAGCGATTTCTCg < 2:308960/274‑1 (MQ=255) tgcGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACgtg > 7:432951/1‑126 (MQ=255) tgcGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACgtg < 8:432951/126‑1 (MQ=255) gcTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCggg > 7:785913/1‑149 (MQ=255) gcTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTgcgc > 4:199872/1‑162 (MQ=255) tttttCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAg > 6:307208/1‑149 (MQ=255) tttttCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAg > 5:188355/1‑149 (MQ=255) tttttCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAg > 6:1008615/1‑149 (MQ=255) tttCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGc < 2:199872/162‑1 (MQ=255) tCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCg > 6:39356/1‑149 (MQ=255) cATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCgg > 7:171509/1‑149 (MQ=255) ttCTCTACGCCCGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGtt > 5:576942/1‑149 (MQ=255) tctACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTgcg > 5:966601/1‑149 (MQ=255) tACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCt > 5:243628/1‑149 (MQ=255) tACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCt > 5:675600/1‑149 (MQ=255) tACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCCTTCTGGCGCAGTTCGCGCCCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTCACGGATTGTTTTCTCATCAGCGATTTCTCGGTCCTTTTTgactcacaa > 4:419285/1‑266 (MQ=255) tACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTTCTCATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCaa > 4:489843/1‑274 (MQ=255) ggccgggaggTTGGCGGTGGCGTCATCCATAAAAGGGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAGGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTTCTCATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACa < 4:243281/265‑1 (MQ=255) ccGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTTCTCATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTcg < 2:419285/265‑1 (MQ=255) cGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCt < 7:901485/149‑1 (MQ=255) gACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTTCTCATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCta < 2:489843/275‑1 (MQ=255) aCAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGcc < 8:64835/149‑1 (MQ=255) aCAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGcc > 5:756028/1‑149 (MQ=255) ttGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCatga > 5:694733/1‑149 (MQ=255) ttGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGc < 4:166344/163‑1 (MQ=255) tGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTTCTCATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCct > 2:404562/1‑275 (MQ=255) gACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCatgatg < 5:1096771/149‑1 (MQ=255) aCGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGc < 6:19683/149‑1 (MQ=255) gTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGAc < 6:521410/149‑1 (MQ=255) gTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGAc < 6:586526/149‑1 (MQ=255) gTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTg > 7:339628/1‑132 (MQ=255) gTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTg < 8:339628/132‑1 (MQ=255) gTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACt > 7:197348/1‑149 (MQ=255) gCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAATTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTTCTCATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGaa < 2:22299/274‑1 (MQ=255) gCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGCGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTTCTCATCACCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGGTGTCGTGGGAAc > 2:151963/1‑275 (MQ=255) gtaaaGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGCCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCgg > 5:836243/3‑149 (MQ=255) gagGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTc < 7:731956/149‑1 (MQ=255) gggtTTGTGGATGTATTCCTGCTTGAAGTCGGGTGTTGGGTGTGGTTGTTTAGTCGCGGGGTGAACGTGTCGAGCCCGGGGACGGCCTTCGCGGGAGGGCGGTTGCGCTGGCCTGCCAGTATGCGACGCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTTCTCATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATGGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAg < 4:516458/273‑1 (MQ=255) gtTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTTCTCATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTcgcg > 2:317610/1‑229 (MQ=255) gtTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTTCTCATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTcgcg < 4:317610/229‑1 (MQ=255) tttCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTgcgc < 4:659635/105‑1 (MQ=255) cTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGtt > 6:724497/1‑149 (MQ=255) cTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTTCTCATCAGCGATTTCTCg < 2:667393/210‑1 (MQ=255) ggACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTcg > 6:14320/1‑149 (MQ=255) cGTTTTCCTTCCTTAGTTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTTCTCATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTGGggc < 4:386846/274‑1 (MQ=255) gTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTTCTCATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTGGggcg > 4:47934/1‑274 (MQ=255) ttccttccTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCct > 5:450001/1‑149 (MQ=255) cttcctGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCctgct > 8:1006443/1‑149 (MQ=255) cttcctGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCctgc < 5:155745/148‑1 (MQ=255) cttcctGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCctgc > 6:155745/1‑148 (MQ=255) ttcctGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCctgctg > 8:504478/1‑149 (MQ=255) tcctGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTgg > 4:73100/1‑159 (MQ=255) ctGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACtt < 7:522739/111‑1 (MQ=255) gAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTa < 2:73100/159‑1 (MQ=255) gTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCtt > 5:13205/1‑149 (MQ=255) cGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTg < 7:486618/149‑1 (MQ=255) gTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGc > 6:708705/1‑149 (MQ=255) gTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGc > 8:114679/1‑149 (MQ=255) ttttCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCg > 6:683710/1‑149 (MQ=255) ttCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTTCTCATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATg < 2:485091/192‑1 (MQ=255) tCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTAc < 8:25889/149‑1 (MQ=255) tGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTg > 7:501642/1‑149 (MQ=255) gCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGAc < 5:232943/149‑1 (MQ=255) gttgttgttAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGt < 5:1008615/149‑1 (MQ=255) ttgttgttAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTa < 7:324244/149‑1 (MQ=255) tgttAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGt < 7:545174/149‑1 (MQ=255) gttAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGtt > 7:1005548/1‑149 (MQ=255) ttAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCt > 8:80777/1‑127 (MQ=255) ttAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCt < 7:80777/127‑1 (MQ=255) aaGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTtc < 6:450001/149‑1 (MQ=255) aacGGGGTCAACACGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTgg < 8:505304/123‑1 (MQ=255) tcGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTTCtcatc < 8:194002/149‑1 (MQ=255) gggTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTTCTCATCAGc > 8:1013074/1‑149 (MQ=255) aCGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTTCTCATCAGCGATTtc > 5:4142/1‑149 (MQ=255) cGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTTCTCATCAGCGATTtct < 6:836243/149‑1 (MQ=255) gtgtTGACCCCGTTGACGGCCCTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTTCTCATCAGCGATTtctc < 7:431677/149‑1 (MQ=255) tgtTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTTCTCATCAGCGATTTCTCg < 7:274764/149‑1 (MQ=255) | TGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGC‑TGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCATGATGCGACTCACTTGCATCGGCATTCTGGCGCAGTTCGCGCTCCTGCTGCTCGCCTTTGGCGTACTGACGTATTGTTTTCTCATCAGCGATTTCTCGGTCATTTATGTCGCGCAACATAGCTATAGCCTGCTGTCGTGGGAACTCAAGCTGGCAGCGGTGTGGGGCGGCCATGAAGGTTCGCTGCTGCTTTGGGTGCTGCTGCTTTCCG > NC_000913/4291250‑4291773 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |