| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 481,228 | 0 | C | A | 6.8% | 552.4 / 21.3 | 163 | intergenic (‑520/+26) | tomB/acrB | Hha toxicity attenuator; conjugation‑related protein/multidrug efflux system protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (76/76); new base A (6/5); total (82/81) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
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4:164546/275‑1 (MQ=255) ttACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTAGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAACCACCACAAAGAATACCGGAACGAAGAAGATTGCCAGTACCGTTGCGGTCACCAt > 5:945467/1‑149 (MQ=255) aCGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAACCACCACAAAGAATACCGGAACGAAGAAGATTGCCAGTACCGTTGCGGTCACCATcc > 5:69959/1‑149 (MQ=255) aCGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAACCACCACAAAGAATACCGGAACGAAGAAGATTGCCAGTACCGTTGCGGTCACCATCCCGCCCATTACAcc < 4:584835/162‑1 (MQ=255) aCGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAACCACCACAAAGAATACCGGAACGAAGAAGATTGCCAGTACCGTTGCGGTCACCATCCCGCCCATTACACCGGTACCTACTGCGTTCTGCGCGCCGGAACCAGCACCAGTACTGATaa > 2:680935/1‑209 (MQ=255) | AGGAATGAATAAAGAATTACCGCAAATAATTAAGAATAGCCTCTAAATGATTATGGATTATTAAATCTATTAGCGCTACTTAATATAAATTAACTAACAATCAGTATTTTTTATGAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAACCACCACAAAGAATACCGGAACGAAGAAGATTGCCAGTACCGTTGCGGTCACCATCCCGCCCATTACACCGGTACCTACTGCGTTCTGCGCGCCGGAACCAGCACCAGTACTGATAACCAGCGGCATAACGCCGAGGATAAACGCCAGCGAGGTCATCAGGATCGGACGTAAACGCATCCG > NC_000913/481013‑481499 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |